208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3095 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  80.8 
 
 		 500 aa  830    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  63.69 
 
 		 511 aa  644    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  80.2 
 
 		 500 aa  831    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  1031    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  64.41 
 
 		 511 aa  674    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  58.99 
 
 		 507 aa  577  1.0000000000000001e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  51.65 
 
 		 516 aa  472  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  49.13 
 
 		 512 aa  472  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  52.52 
 
 		 524 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  48.73 
 
 		 450 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  47.61 
 
 		 496 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  49.11 
 
 		 498 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  48.7 
 
 		 494 aa  458  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  47.92 
 
 		 480 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  49.28 
 
 		 520 aa  432  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  41.75 
 
 		 472 aa  386  1e-106  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  40.46 
 
 		 519 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  37.21 
 
 		 549 aa  358  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  38.32 
 
 		 538 aa  351  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  37.61 
 
 		 1033 aa  351  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  36.65 
 
 		 537 aa  320  3e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  36.89 
 
 		 539 aa  315  8e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  36.97 
 
 		 465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  36.42 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  36.65 
 
 		 463 aa  258  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  36.23 
 
 		 463 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  36.23 
 
 		 463 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  28.15 
 
 		 465 aa  170  7e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  27.56 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  28.57 
 
 		 447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  28.8 
 
 		 446 aa  146  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 		 722 aa  139  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  29.22 
 
 		 437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  27.25 
 
 		 436 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  23.36 
 
 		 459 aa  128  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  27.71 
 
 		 435 aa  125  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  23.9 
 
 		 538 aa  124  5e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2937  amine oxidase  29.12 
 
 		 448 aa  124  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  25.64 
 
 		 452 aa  123  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  22.93 
 
 		 459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  23.62 
 
 		 454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  26.49 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  24.36 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  24.27 
 
 		 489 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  24 
 
 		 532 aa  104  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  23.85 
 
 		 424 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  25.84 
 
 		 449 aa  101  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  26.05 
 
 		 428 aa  97.4  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  25.94 
 
 		 421 aa  89  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  24.61 
 
 		 1293 aa  87  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  22.57 
 
 		 431 aa  86.3  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  20.04 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  25.54 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  25.52 
 
 		 472 aa  68.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  28 
 
 		 370 aa  67  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  23.68 
 
 		 423 aa  66.6  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  22.43 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0404  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  21.6 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1597  hypothetical protein  26.32 
 
 		 412 aa  57  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  30.51 
 
 		 369 aa  57  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  25.99 
 
 		 503 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  21.68 
 
 		 501 aa  57  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  25.25 
 
 		 465 aa  54.3  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  25.15 
 
 		 383 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  44 
 
 		 456 aa  54.3  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  25.15 
 
 		 383 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  25.15 
 
 		 369 aa  53.9  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  46.43 
 
 		 501 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  24.56 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  47.37 
 
 		 501 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  27.71 
 
 		 372 aa  53.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  20.79 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  31.07 
 
 		 451 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  23.08 
 
 		 467 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  31.07 
 
 		 451 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  31.07 
 
 		 451 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  44.29 
 
 		 437 aa  51.6  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  42.05 
 
 		 525 aa  52  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  27.95 
 
 		 365 aa  51.6  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  25.75 
 
 		 366 aa  51.2  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  22.38 
 
 		 453 aa  51.2  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17571  phytoene dehydrogenase and related protein  46.3 
 
 		 501 aa  51.6  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 		 510 aa  50.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  26.06 
 
 		 391 aa  50.8  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  25.75 
 
 		 367 aa  51.2  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  30.25 
 
 		 398 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  42.42 
 
 		 522 aa  50.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  36.36 
 
 		 436 aa  50.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  47.37 
 
 		 494 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  22.11 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  25.88 
 
 		 367 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  25.86 
 
 		 384 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  27.06 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  25.44 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  34.94 
 
 		 499 aa  49.7  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  27.32 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  20.59 
 
 		 373 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  27.39 
 
 		 390 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>