262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0893 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0168  hypothetical protein  89.61 
 
 		 414 aa  753    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  74.7 
 
 		 436 aa  662    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  94.38 
 
 		 427 aa  813    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  878    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  71.56 
 
 		 453 aa  628  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  70.14 
 
 		 428 aa  609  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  55.42 
 
 		 435 aa  522  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  49.4 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  45.99 
 
 		 432 aa  418  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  43.44 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  31.79 
 
 		 436 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  29.27 
 
 		 429 aa  210  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  33.26 
 
 		 437 aa  206  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  29.7 
 
 		 439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0829  hypothetical protein  27.62 
 
 		 448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.476785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  29.29 
 
 		 448 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1133  hypothetical protein  27.93 
 
 		 450 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3973  hypothetical protein  27.68 
 
 		 450 aa  182  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0831495  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  29.77 
 
 		 429 aa  182  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  28.18 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  29.52 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1597  hypothetical protein  29.25 
 
 		 412 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1642  hypothetical protein  28.33 
 
 		 437 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  31.25 
 
 		 412 aa  138  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1338  hypothetical protein  27.08 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1302  hypothetical protein  27.08 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1319  hypothetical protein  27.08 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150757 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0060  hypothetical protein  26.77 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0725  hypothetical protein  27.74 
 
 		 410 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00111805  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0694  hypothetical protein  27.23 
 
 		 409 aa  91.7  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.452898  normal  0.129497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  25.21 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  25.95 
 
 		 624 aa  73.2  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  25.48 
 
 		 524 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  26.13 
 
 		 599 aa  71.2  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  25 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.81 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  24.56 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  23.57 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  23.4 
 
 		 471 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  21.38 
 
 		 480 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  23.13 
 
 		 453 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  25.08 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  23.16 
 
 		 589 aa  64.7  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  22.3 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  22.14 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  22.5 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  22.76 
 
 		 477 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  23.32 
 
 		 473 aa  63.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  23.61 
 
 		 460 aa  63.2  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  24.04 
 
 		 465 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  23.24 
 
 		 496 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  24.04 
 
 		 466 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  23.21 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  24.41 
 
 		 516 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  23.18 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  23.72 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  21.03 
 
 		 500 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  22.49 
 
 		 475 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  20.37 
 
 		 500 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  21.81 
 
 		 722 aa  59.7  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  22.41 
 
 		 474 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.47 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  23.61 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  23.61 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  23.32 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  23.08 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1301  amine oxidase  23.36 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  19.86 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  22.51 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  21.22 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  25.16 
 
 		 463 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  23.08 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  22.19 
 
 		 459 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  25.16 
 
 		 463 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  37.11 
 
 		 456 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  20.12 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  22.08 
 
 		 462 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  24.65 
 
 		 552 aa  54.7  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  22.08 
 
 		 464 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  33.04 
 
 		 456 aa  53.1  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2754  amine oxidase  24.01 
 
 		 430 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  24.84 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1091  putative cyclopropane/cyclopropene fatty acid synthesis protein, flavin amine oxidase  23.98 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.432347  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3309  amine oxidase  25.46 
 
 		 484 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  22.32 
 
 		 507 aa  51.6  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  24.04 
 
 		 493 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  25.62 
 
 		 452 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  35.94 
 
 		 497 aa  51.2  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  25.62 
 
 		 452 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  25.62 
 
 		 452 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  21.76 
 
 		 462 aa  50.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  26.32 
 
 		 482 aa  50.4  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  25.87 
 
 		 498 aa  50.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  22.73 
 
 		 436 aa  50.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  23.61 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  41.46 
 
 		 470 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2683  amine oxidase  21.97 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446485  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  31.96 
 
 		 457 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4037  putative oxidoreductase  29.29 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.239048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  20.92 
 
 		 500 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>