99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1142 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  100 
 
 
428 aa  871    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  35.24 
 
 
427 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  34.99 
 
 
427 aa  259  4e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  29.37 
 
 
454 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  25.52 
 
 
449 aa  172  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  28.08 
 
 
452 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  26.85 
 
 
437 aa  162  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  27.08 
 
 
1293 aa  162  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  28.84 
 
 
447 aa  154  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  25.61 
 
 
436 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  24.27 
 
 
446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  25.68 
 
 
435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  27.25 
 
 
431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  23.29 
 
 
450 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  24.71 
 
 
428 aa  130  3e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  25.06 
 
 
449 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  23.16 
 
 
452 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  24.74 
 
 
532 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
460 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  24.45 
 
 
496 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  24.94 
 
 
472 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  22.98 
 
 
494 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  21.95 
 
 
520 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  23.44 
 
 
516 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  22.48 
 
 
498 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  24.27 
 
 
538 aa  103  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  21.56 
 
 
524 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  23.78 
 
 
465 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  21.54 
 
 
511 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  20.17 
 
 
500 aa  87  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  20.47 
 
 
512 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  23.61 
 
 
424 aa  85.1  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  20.04 
 
 
500 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  21.43 
 
 
436 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  21.14 
 
 
722 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  22.39 
 
 
480 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  20.81 
 
 
463 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  20.81 
 
 
463 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  20.81 
 
 
463 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  22.35 
 
 
511 aa  79  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  20 
 
 
500 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  19.91 
 
 
507 aa  77  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0329  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  21.16 
 
 
431 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  22.74 
 
 
432 aa  63.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  21.67 
 
 
459 aa  62.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  21.67 
 
 
459 aa  61.6  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  21.6 
 
 
439 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  21.03 
 
 
465 aa  57.8  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  19.18 
 
 
467 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  24.14 
 
 
369 aa  55.5  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  21.02 
 
 
465 aa  54.7  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  22.42 
 
 
549 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  37.35 
 
 
468 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  22.64 
 
 
423 aa  54.3  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  37.35 
 
 
468 aa  54.3  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  35.38 
 
 
429 aa  53.5  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  37.35 
 
 
468 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  20.78 
 
 
427 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  19.82 
 
 
453 aa  52.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  20.8 
 
 
537 aa  52.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  18.41 
 
 
421 aa  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  21.08 
 
 
435 aa  51.6  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  20.76 
 
 
428 aa  51.6  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  18.01 
 
 
421 aa  50.1  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  23.96 
 
 
437 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  25 
 
 
489 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 
516 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  21.69 
 
 
436 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  21.02 
 
 
448 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  45.1 
 
 
442 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3760  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 
524 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00569391 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 
516 aa  46.6  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0168  hypothetical protein  20.39 
 
 
414 aa  46.6  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2452  cyclohexanone monooxygenase  55.56 
 
 
650 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  19.92 
 
 
519 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_715  FAD dependent oxidoreductase  36.76 
 
 
500 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  19.58 
 
 
469 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  27.4 
 
 
498 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  20.77 
 
 
448 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0939  amine oxidase  45.1 
 
 
496 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1606  phytoene desaturase  41.07 
 
 
511 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1151  hypothetical protein  33.33 
 
 
465 aa  45.1  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  33.9 
 
 
502 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  33.9 
 
 
502 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  20.93 
 
 
539 aa  44.3  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55152  mitochondrial protoporphyrinogen oxidase  41.27 
 
 
553 aa  43.9  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  29.85 
 
 
427 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  26.92 
 
 
502 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  33.96 
 
 
512 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  32.08 
 
 
506 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  25.93 
 
 
507 aa  43.5  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  26.92 
 
 
512 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  26.92 
 
 
512 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  28.24 
 
 
546 aa  43.5  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  30.95 
 
 
519 aa  43.1  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  31.25 
 
 
565 aa  43.5  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0586  putative flavin-binding monooxygenase  56.41 
 
 
514 aa  43.1  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643741  normal  0.361542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2968  putative phytoene dehydrogenase  27.27 
 
 
416 aa  43.1  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0731  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  26.98 
 
 
500 aa  43.1  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.444322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>