More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1705 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  74.7 
 
 		 427 aa  662    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0168  hypothetical protein  74.09 
 
 		 414 aa  642    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  894    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  71.19 
 
 		 428 aa  640    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  74.29 
 
 		 427 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  74.07 
 
 		 453 aa  665    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  54.61 
 
 		 435 aa  514  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  50.61 
 
 		 419 aa  438  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  47.21 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  42.96 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  31.48 
 
 		 436 aa  242  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  30.05 
 
 		 429 aa  236  7e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0829  hypothetical protein  30.7 
 
 		 448 aa  211  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.476785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1133  hypothetical protein  31.7 
 
 		 450 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  30 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3973  hypothetical protein  31.11 
 
 		 450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0831495  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  31.18 
 
 		 448 aa  199  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  31.34 
 
 		 448 aa  196  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  30.96 
 
 		 429 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  31.29 
 
 		 437 aa  193  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  29.82 
 
 		 436 aa  157  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  32.08 
 
 		 412 aa  150  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1597  hypothetical protein  28.5 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0725  hypothetical protein  30.14 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00111805  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1642  hypothetical protein  26.65 
 
 		 437 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1302  hypothetical protein  28.83 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1319  hypothetical protein  28.83 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150757 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1338  hypothetical protein  28.83 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0060  hypothetical protein  27.46 
 
 		 437 aa  124  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0694  hypothetical protein  28.54 
 
 		 409 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.452898  normal  0.129497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  22.48 
 
 		 520 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  21.17 
 
 		 524 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  25.7 
 
 		 624 aa  70.5  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  25.97 
 
 		 599 aa  69.3  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  25.84 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  20.83 
 
 		 472 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  25.82 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  25.87 
 
 		 479 aa  66.6  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.48 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  24.76 
 
 		 475 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  24.69 
 
 		 449 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  22.78 
 
 		 453 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  24.76 
 
 		 475 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  22.6 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  22.5 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  23.91 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.21 
 
 		 474 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  23.59 
 
 		 516 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4020  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  24.21 
 
 		 589 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  25.16 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  23.13 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  21.69 
 
 		 722 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  22.36 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  21.98 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  21.98 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  22.86 
 
 		 462 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  23.92 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  22.54 
 
 		 464 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  24.44 
 
 		 459 aa  56.2  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  24.44 
 
 		 459 aa  56.2  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  22.22 
 
 		 500 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  21.01 
 
 		 480 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  21 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  23.29 
 
 		 472 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  23.39 
 
 		 463 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  21.26 
 
 		 500 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  20.49 
 
 		 482 aa  54.3  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  23.27 
 
 		 463 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  23.27 
 
 		 463 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  21.35 
 
 		 453 aa  53.5  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01816  hypothetical protein  26.43 
 
 		 436 aa  53.1  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1835  putative oxidoreductase  36.67 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2754  amine oxidase  23.87 
 
 		 430 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3639  putative oxidoreductase  36.44 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4037  putative oxidoreductase  57.5 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.239048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  23.08 
 
 		 479 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  21.71 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  21.16 
 
 		 496 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1801  putative oxidoreductase  57.5 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3309  amine oxidase  23.78 
 
 		 484 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.73 
 
 		 891 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  25 
 
 		 552 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2861  glutamate synthase subunit beta  57.5 
 
 		 455 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1091  putative cyclopropane/cyclopropene fatty acid synthesis protein, flavin amine oxidase  24.35 
 
 		 430 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.432347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2600  glutamate synthase, alpha subunit-like  63.16 
 
 		 771 aa  51.6  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  56.41 
 
 		 489 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1954  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  38.82 
 
 		 579 aa  51.2  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.151886  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  56.41 
 
 		 489 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1301  amine oxidase  23.72 
 
 		 425 aa  51.2  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0130  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  37.65 
 
 		 578 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  22.48 
 
 		 479 aa  50.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05750  putative oxidoreductase  57.5 
 
 		 455 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  19.57 
 
 		 453 aa  50.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  21.92 
 
 		 441 aa  50.8  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  56.41 
 
 		 491 aa  50.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  53.85 
 
 		 488 aa  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  56.41 
 
 		 491 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  56.41 
 
 		 478 aa  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  25.48 
 
 		 501 aa  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>