More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2861 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2861  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 		 455 aa  924    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0966  glutamate synthase subunit beta  73.66 
 
 		 451 aa  643    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4152  glutamate synthase subunit beta  69.34 
 
 		 477 aa  639    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0044  glutamate synthase subunit beta  65.91 
 
 		 472 aa  567  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2360  putative oxidoreductase  57.6 
 
 		 453 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4019  putative oxidoreductase  61.4 
 
 		 448 aa  511  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3280  putative oxidoreductase  58.77 
 
 		 453 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0565301 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3028  putative oxidoreductase  58.09 
 
 		 453 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00065642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0366  putative oxidoreductase  54.2 
 
 		 500 aa  496  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1362  putative oxidoreductase  57.3 
 
 		 445 aa  494  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0297  putative oxidoreductase  56.01 
 
 		 498 aa  491  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.284933  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0283  putative oxidoreductase  56.01 
 
 		 501 aa  491  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2198  putative oxidoreductase  59.32 
 
 		 440 aa  490  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2057  putative oxidoreductase  57.11 
 
 		 450 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0749543  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3448  putative oxidoreductase  55.03 
 
 		 475 aa  487  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0584145  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2713  putative oxidoreductase  57.18 
 
 		 446 aa  481  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1596  putative oxidoreductase  59.41 
 
 		 445 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6235  putative oxidoreductase  59.41 
 
 		 445 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391718  normal  0.166247 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0189  putative oxidoreductase  57.3 
 
 		 445 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1822  glutamate synthase subunit beta  57.34 
 
 		 443 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5966  putative oxidoreductase  59.91 
 
 		 445 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.592617 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5722  putative oxidoreductase  59.91 
 
 		 445 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2690  putative oxidoreductase  59.07 
 
 		 449 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6711  putative oxidoreductase  58.5 
 
 		 445 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717012  normal  0.546311 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6655  putative oxidoreductase  57.86 
 
 		 445 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.0132597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1428  putative oxidoreductase  58.84 
 
 		 449 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1456  putative oxidoreductase  56.5 
 
 		 443 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5350  putative oxidoreductase  58.97 
 
 		 445 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.236159 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1535  putative oxidoreductase  56.98 
 
 		 449 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1501  putative oxidoreductase  53.17 
 
 		 444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3442  putative oxidoreductase  52.61 
 
 		 481 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0542  putative oxidoreductase  52.74 
 
 		 455 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05750  putative oxidoreductase  53.42 
 
 		 455 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4037  putative oxidoreductase  52.05 
 
 		 455 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.239048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1801  putative oxidoreductase  51.6 
 
 		 478 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3639  putative oxidoreductase  51.94 
 
 		 455 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1835  putative oxidoreductase  51.94 
 
 		 455 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6036  putative oxidoreductase  53.05 
 
 		 455 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3447  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.4 
 
 		 453 aa  349  7e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00401797  normal  0.0849799 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2109  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  42.82 
 
 		 445 aa  326  4.0000000000000003e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1890  FAD dependent oxidoreductase  41.88 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00119586  hitchhiker  0.00883124 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  41.31 
 
 		 465 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0262  putative oxidoreductase  37.14 
 
 		 462 aa  299  8e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2582  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.57 
 
 		 457 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  37.77 
 
 		 699 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.96 
 
 		 448 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  36.18 
 
 		 470 aa  232  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  36.71 
 
 		 658 aa  228  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.01 
 
 		 466 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  35.41 
 
 		 471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.82 
 
 		 469 aa  226  6e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  36.44 
 
 		 470 aa  223  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.63 
 
 		 480 aa  223  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  35.46 
 
 		 469 aa  224  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  33.63 
 
 		 464 aa  223  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.63 
 
 		 457 aa  223  7e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  35.79 
 
 		 469 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.87 
 
 		 996 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  35.03 
 
 		 469 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  34.47 
 
 		 469 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  36.1 
 
 		 463 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.08 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  33.56 
 
 		 477 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.56 
 
 		 464 aa  216  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  33.85 
 
 		 480 aa  216  5e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  32.74 
 
 		 455 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  34.16 
 
 		 468 aa  216  7e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  32.96 
 
 		 482 aa  216  9e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.16 
 
 		 476 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  33.41 
 
 		 482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0465  glutamate synthase subunit beta  34.08 
 
 		 472 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000235827  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0529  glutamate synthase subunit beta  34.08 
 
 		 472 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  32.67 
 
 		 480 aa  212  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.07 
 
 		 447 aa  212  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.26 
 
 		 458 aa  212  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  34.55 
 
 		 653 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1129  glutamate synthase subunit beta  33.86 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0513615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  34.3 
 
 		 483 aa  211  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  32.96 
 
 		 469 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.91 
 
 		 465 aa  210  5e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.47 
 
 		 1126 aa  209  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0304  glutamate synthase subunit beta  34.15 
 
 		 472 aa  209  9e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  34.7 
 
 		 653 aa  209  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0298  glutamate synthase subunit beta  33.93 
 
 		 472 aa  209  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0825  putative oxidoreductase  34.52 
 
 		 412 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  33.92 
 
 		 465 aa  208  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.33 
 
 		 464 aa  207  3e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.43 
 
 		 483 aa  207  3e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5121  glutamate synthase, small subunit  33.7 
 
 		 472 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  33.41 
 
 		 465 aa  206  5e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  30.91 
 
 		 470 aa  206  6e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  33.48 
 
 		 667 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  32.36 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66560  glutamate synthase subunit beta  33.26 
 
 		 477 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5772  glutamate synthase subunit beta  33.48 
 
 		 477 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0412  glutamate synthase subunit beta  33.04 
 
 		 472 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2293  putative oxidoreductase  33.81 
 
 		 412 aa  204  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262467 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2332  putative oxidoreductase  33.57 
 
 		 413 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3749  glutamate synthase subunit beta  33.71 
 
 		 471 aa  203  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2280  putative oxidoreductase  34.52 
 
 		 412 aa  202  7e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>