More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0539 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  100 
 
 		 483 aa  993    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1069  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  50.52 
 
 		 465 aa  476  1e-133  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000858078  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  43.76 
 
 		 466 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  44.75 
 
 		 471 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  44.16 
 
 		 468 aa  366  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  43.95 
 
 		 469 aa  359  7e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  43.07 
 
 		 468 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  42.89 
 
 		 464 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  43.1 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.47 
 
 		 469 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  44.35 
 
 		 470 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  43.35 
 
 		 463 aa  356  5.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  43.49 
 
 		 468 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  42.95 
 
 		 468 aa  356  6.999999999999999e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  43.87 
 
 		 470 aa  354  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  42.65 
 
 		 468 aa  353  5.9999999999999994e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  43.13 
 
 		 477 aa  352  1e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  42.16 
 
 		 476 aa  352  1e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  42.41 
 
 		 483 aa  352  1e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.51 
 
 		 457 aa  352  1e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  41.6 
 
 		 482 aa  352  1e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  43.08 
 
 		 469 aa  349  7e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  42.95 
 
 		 469 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  39.87 
 
 		 482 aa  347  4e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.51 
 
 		 464 aa  346  5e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.96 
 
 		 464 aa  345  7e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  43.13 
 
 		 463 aa  345  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.51 
 
 		 467 aa  342  1e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  42.49 
 
 		 503 aa  341  2e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  42.49 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  42.89 
 
 		 476 aa  340  4e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  41.58 
 
 		 480 aa  340  5e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  42.03 
 
 		 469 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  42.03 
 
 		 469 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1111  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.61 
 
 		 469 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.7 
 
 		 466 aa  336  7e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2934  putative oxidoreductase  43.64 
 
 		 459 aa  335  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.912851  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.14 
 
 		 761 aa  335  2e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1900  putative bifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta  40.93 
 
 		 747 aa  330  3e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22072  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  41.85 
 
 		 462 aa  328  1.0000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.37 
 
 		 458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.09 
 
 		 480 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  43.41 
 
 		 1005 aa  326  6e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  39.1 
 
 		 465 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.48 
 
 		 448 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  39.96 
 
 		 477 aa  320  5e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  42.01 
 
 		 474 aa  319  6e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  42.67 
 
 		 1008 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0820  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.51 
 
 		 466 aa  318  2e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.32 
 
 		 465 aa  318  2e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  42.07 
 
 		 1011 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  42.07 
 
 		 1011 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1250  putative oxidoreductase  39.92 
 
 		 476 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  38.68 
 
 		 465 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  38.79 
 
 		 994 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2781  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.9 
 
 		 497 aa  312  1e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.662826  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.25 
 
 		 479 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.22 
 
 		 465 aa  309  9e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3635  putative oxidoreductase  39.66 
 
 		 476 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000713283  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.73 
 
 		 461 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.18 
 
 		 447 aa  306  8.000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40 
 
 		 447 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.09 
 
 		 463 aa  301  1e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3634  glutamate synthase subunit beta  38.09 
 
 		 472 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137963  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0745  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  38.66 
 
 		 994 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375637  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1112  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  40.97 
 
 		 446 aa  300  3e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3792  glutamate synthase subunit beta  37.66 
 
 		 472 aa  297  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0298  glutamate synthase subunit beta  37.55 
 
 		 472 aa  297  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0304  glutamate synthase subunit beta  37.55 
 
 		 472 aa  297  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2873  glutamate synthase subunit beta  36.24 
 
 		 468 aa  297  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0110656 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3051  glutamate synthase subunit beta  36.24 
 
 		 468 aa  296  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1324  glutamate synthase subunit beta  36.03 
 
 		 468 aa  296  5e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2955  glutamate synthase subunit beta  36.24 
 
 		 468 aa  296  5e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0529  glutamate synthase subunit beta  36.91 
 
 		 472 aa  295  9e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0465  glutamate synthase subunit beta  36.91 
 
 		 472 aa  295  9e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000235827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4345  glutamate synthase subunit beta  37.18 
 
 		 472 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0056621  hitchhiker  0.00954543 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1984  putative oxidoreductase  37.84 
 
 		 473 aa  293  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.292785  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1129  glutamate synthase subunit beta  36.7 
 
 		 472 aa  293  5e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0513615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  40.92 
 
 		 1150 aa  292  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1177  glutamate synthase subunit beta  35.48 
 
 		 468 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.407199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1254  glutamate synthase subunit beta  35.81 
 
 		 468 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.55842 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0271  glutamate synthase, small subunit  37.2 
 
 		 467 aa  291  3e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0925346 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2768  glutamate synthase subunit beta  35.55 
 
 		 481 aa  290  4e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.407102  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  38.02 
 
 		 465 aa  290  6e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3136  glutamate synthase subunit beta  35.89 
 
 		 468 aa  289  9e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.632002 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1135  glutamate synthase subunit beta  35.14 
 
 		 468 aa  289  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1221  glutamate synthase subunit beta  35.79 
 
 		 468 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1125  glutamate synthase subunit beta  35.15 
 
 		 469 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1220  glutamate synthase subunit beta  35.28 
 
 		 469 aa  288  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0877  glutamate synthase, small subunit  36.87 
 
 		 465 aa  288  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.44066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0729  glutamate synthase, small subunit  36.87 
 
 		 465 aa  288  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1933  glutamate synthase, small subunit  36.67 
 
 		 469 aa  288  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.889564  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.7 
 
 		 659 aa  288  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.48 
 
 		 659 aa  287  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0835  glutamate synthase subunit beta  37.86 
 
 		 472 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.387522  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  36.7 
 
 		 659 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.7 
 
 		 659 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.7 
 
 		 659 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2764  glutamate synthase subunit beta  37.39 
 
 		 469 aa  287  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.7 
 
 		 659 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>