More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3447 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3447  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 453 aa  934    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00401797  normal  0.0849799 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2198  putative oxidoreductase  46.56 
 
 		 440 aa  378  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  45.56 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2713  putative oxidoreductase  46.9 
 
 		 446 aa  368  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2360  putative oxidoreductase  45.1 
 
 		 453 aa  365  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3448  putative oxidoreductase  44.57 
 
 		 475 aa  362  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0584145  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0297  putative oxidoreductase  44.57 
 
 		 498 aa  359  6e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.284933  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0283  putative oxidoreductase  44.77 
 
 		 501 aa  359  6e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1362  putative oxidoreductase  44.32 
 
 		 445 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1428  putative oxidoreductase  45.58 
 
 		 449 aa  349  7e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2861  glutamate synthase subunit beta  43.4 
 
 		 455 aa  349  7e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4019  putative oxidoreductase  43.32 
 
 		 448 aa  347  3e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0366  putative oxidoreductase  42.57 
 
 		 500 aa  347  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0966  glutamate synthase subunit beta  45.17 
 
 		 451 aa  345  8e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0262  putative oxidoreductase  43.3 
 
 		 462 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3028  putative oxidoreductase  44.47 
 
 		 453 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00065642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2690  putative oxidoreductase  44.42 
 
 		 449 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1890  FAD dependent oxidoreductase  45.62 
 
 		 440 aa  343  5e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00119586  hitchhiker  0.00883124 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6655  putative oxidoreductase  44.39 
 
 		 445 aa  342  7e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.0132597 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0189  putative oxidoreductase  44.21 
 
 		 445 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4152  glutamate synthase subunit beta  42.18 
 
 		 477 aa  340  2.9999999999999998e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1596  putative oxidoreductase  44.16 
 
 		 445 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6235  putative oxidoreductase  44.16 
 
 		 445 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391718  normal  0.166247 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3280  putative oxidoreductase  43.79 
 
 		 453 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0565301 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5722  putative oxidoreductase  44.32 
 
 		 445 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1801  putative oxidoreductase  43.37 
 
 		 478 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6711  putative oxidoreductase  43.94 
 
 		 445 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717012  normal  0.546311 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5966  putative oxidoreductase  43.78 
 
 		 445 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.592617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4037  putative oxidoreductase  43.37 
 
 		 455 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.239048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0044  glutamate synthase subunit beta  43.64 
 
 		 472 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3639  putative oxidoreductase  42.92 
 
 		 455 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1535  putative oxidoreductase  43.62 
 
 		 449 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2109  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  44.95 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1822  glutamate synthase subunit beta  43.98 
 
 		 443 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1501  putative oxidoreductase  43.69 
 
 		 444 aa  332  8e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2057  putative oxidoreductase  42.57 
 
 		 450 aa  331  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0749543  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1835  putative oxidoreductase  42.25 
 
 		 455 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5350  putative oxidoreductase  43.16 
 
 		 445 aa  330  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.236159 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3442  putative oxidoreductase  42.43 
 
 		 481 aa  328  9e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6036  putative oxidoreductase  45.26 
 
 		 455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0542  putative oxidoreductase  41.63 
 
 		 455 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05750  putative oxidoreductase  41.86 
 
 		 455 aa  319  7e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1456  putative oxidoreductase  43.18 
 
 		 443 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2582  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.31 
 
 		 457 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  37.2 
 
 		 476 aa  272  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  39.03 
 
 		 470 aa  269  8.999999999999999e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  37.28 
 
 		 469 aa  268  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  37.03 
 
 		 468 aa  266  7e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.43 
 
 		 466 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  36.95 
 
 		 471 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  36.95 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.61 
 
 		 465 aa  259  5.0000000000000005e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1900  putative bifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta  35.51 
 
 		 747 aa  256  7e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22072  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  35.87 
 
 		 469 aa  255  9e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.81 
 
 		 761 aa  255  9e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  37.41 
 
 		 464 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.05 
 
 		 463 aa  254  3e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.23 
 
 		 457 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0729  glutamate synthase, small subunit  35.38 
 
 		 465 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0877  glutamate synthase, small subunit  35.38 
 
 		 465 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.44066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  35.48 
 
 		 469 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0337  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.29 
 
 		 467 aa  252  1e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  36.1 
 
 		 465 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  36.1 
 
 		 465 aa  250  4e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.57 
 
 		 465 aa  250  4e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  35.11 
 
 		 470 aa  249  7e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.84 
 
 		 479 aa  249  9e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  35.75 
 
 		 468 aa  249  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  35.25 
 
 		 469 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  35.42 
 
 		 462 aa  248  2e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  36.66 
 
 		 455 aa  248  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  36.01 
 
 		 480 aa  247  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  37.76 
 
 		 463 aa  247  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.62 
 
 		 464 aa  246  6.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.25 
 
 		 463 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  36.36 
 
 		 480 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  34.8 
 
 		 469 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.02 
 
 		 466 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  36.83 
 
 		 1150 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2138  putative oxidoreductase  33.41 
 
 		 480 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.41 
 
 		 458 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.72 
 
 		 474 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.98 
 
 		 464 aa  239  8e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.87 
 
 		 461 aa  239  9e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.05 
 
 		 467 aa  238  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  34.08 
 
 		 482 aa  238  1e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  36.43 
 
 		 477 aa  238  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  38.08 
 
 		 658 aa  238  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.37 
 
 		 483 aa  238  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  33.18 
 
 		 482 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  38.11 
 
 		 493 aa  236  9e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35 
 
 		 448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  34.98 
 
 		 472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  35.14 
 
 		 503 aa  234  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  34.7 
 
 		 483 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  34.98 
 
 		 472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  34.98 
 
 		 472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.3 
 
 		 476 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.02 
 
 		 469 aa  234  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.16 
 
 		 1126 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.633226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>