More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5075 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03078  glutamate synthase, 4Fe-4S protein, small subunit  69.94 
 
 		 472 aa  682    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0494  glutamate synthase, small subunit  69.94 
 
 		 472 aa  682    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3691  glutamate synthase subunit beta  69.57 
 
 		 472 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.752822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 		 472 aa  969    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0487  glutamate synthase subunit beta  69.94 
 
 		 472 aa  682    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1220  glutamate synthase subunit beta  66.45 
 
 		 469 aa  663    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 		 472 aa  969    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1324  glutamate synthase subunit beta  67.31 
 
 		 468 aa  667    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5121  glutamate synthase, small subunit  92.8 
 
 		 472 aa  891    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0412  glutamate synthase subunit beta  93.43 
 
 		 472 aa  896    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1873  glutamate synthase subunit beta  73.15 
 
 		 473 aa  733    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0404  glutamate synthase subunit beta  74.52 
 
 		 472 aa  748    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0157845 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2768  glutamate synthase subunit beta  68.88 
 
 		 481 aa  682    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.407102  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0414  glutamate synthase subunit beta  95.76 
 
 		 472 aa  912    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0298  glutamate synthase subunit beta  69.51 
 
 		 472 aa  676    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0529  glutamate synthase subunit beta  68.44 
 
 		 472 aa  677    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3522  glutamate synthase subunit beta  69.57 
 
 		 472 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1254  glutamate synthase subunit beta  66.67 
 
 		 468 aa  669    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.55842 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  65.11 
 
 		 470 aa  639    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3019  glutamate synthase subunit beta  73.08 
 
 		 468 aa  731    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4345  glutamate synthase subunit beta  67.87 
 
 		 472 aa  670    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0056621  hitchhiker  0.00954543 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3634  glutamate synthase subunit beta  69.36 
 
 		 472 aa  680    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137963  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3593  glutamate synthase subunit beta  69.57 
 
 		 472 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1129  glutamate synthase subunit beta  68.23 
 
 		 472 aa  675    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0513615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2682  glutamate synthase subunit beta  80.93 
 
 		 483 aa  810    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.287891 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00925  glutamate synthase subunit beta  69.51 
 
 		 470 aa  654    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1012  glutamate synthase subunit beta  66.67 
 
 		 469 aa  657    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3406  glutamate synthase subunit beta  69.94 
 
 		 472 aa  682    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2791  glutamate synthase subunit beta  65.46 
 
 		 485 aa  639    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3557  glutamate synthase subunit beta  69.94 
 
 		 472 aa  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0616  glutamate synthase subunit beta  77.75 
 
 		 472 aa  781    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0465  glutamate synthase subunit beta  68.44 
 
 		 472 aa  677    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000235827  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2164  glutamate synthase subunit beta  73.15 
 
 		 473 aa  731    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0515227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4113  glutamate synthase, small subunit  75.26 
 
 		 473 aa  754    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116897 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03029  hypothetical protein  69.94 
 
 		 472 aa  682    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0551  glutamate synthase subunit beta  93.01 
 
 		 472 aa  893    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592463 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45200  glutamate synthase subunit beta  90.87 
 
 		 473 aa  870    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1135  glutamate synthase subunit beta  67.31 
 
 		 468 aa  671    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1177  glutamate synthase subunit beta  66.24 
 
 		 468 aa  666    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.407199  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3792  glutamate synthase subunit beta  69.51 
 
 		 472 aa  687    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3749  glutamate synthase subunit beta  70.09 
 
 		 471 aa  680    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1031  glutamate synthase subunit beta  67.31 
 
 		 469 aa  656    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.473013  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004469  glutamate synthase [NADPH] small chain  69.94 
 
 		 470 aa  662    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1125  glutamate synthase subunit beta  66.67 
 
 		 469 aa  666    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2873  glutamate synthase subunit beta  67.31 
 
 		 468 aa  669    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0110656 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2955  glutamate synthase subunit beta  67.09 
 
 		 468 aa  667    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2764  glutamate synthase subunit beta  72.71 
 
 		 469 aa  728    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2952  glutamate synthase subunit beta  64.32 
 
 		 468 aa  640    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1933  glutamate synthase, small subunit  70 
 
 		 469 aa  690    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.889564  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3629  glutamate synthase subunit beta  69.36 
 
 		 472 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.344291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66560  glutamate synthase subunit beta  91.72 
 
 		 477 aa  903    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  98.73 
 
 		 472 aa  964    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0271  glutamate synthase, small subunit  70.45 
 
 		 467 aa  690    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0925346 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3051  glutamate synthase subunit beta  67.09 
 
 		 468 aa  667    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4536  glutamate synthase subunit beta  69.79 
 
 		 472 aa  684    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3136  glutamate synthase subunit beta  66.88 
 
 		 468 aa  672    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.632002 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0856  glutamate synthase subunit beta  68.38 
 
 		 472 aa  681    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5772  glutamate synthase subunit beta  91.3 
 
 		 477 aa  900    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3509  glutamate synthase subunit beta  69.94 
 
 		 472 aa  684    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3657  glutamate synthase subunit beta  68.23 
 
 		 472 aa  671    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3524  glutamate synthase subunit beta  69.36 
 
 		 472 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0835  glutamate synthase subunit beta  78.39 
 
 		 472 aa  775    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.387522  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 		 472 aa  969    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0304  glutamate synthase subunit beta  69.15 
 
 		 472 aa  677    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1221  glutamate synthase subunit beta  66.67 
 
 		 468 aa  665    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1057  glutamate synthase subunit beta  69.61 
 
 		 469 aa  682    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01630  glutamate synthase subunit beta  69.23 
 
 		 471 aa  671    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3701  glutamate synthase subunit beta  69.94 
 
 		 472 aa  682    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1955  glutamate synthase subunit beta  69.02 
 
 		 471 aa  653    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4502  glutamate synthase subunit beta  64.68 
 
 		 475 aa  622  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0877  glutamate synthase, small subunit  63.25 
 
 		 465 aa  623  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.44066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0729  glutamate synthase, small subunit  63.25 
 
 		 465 aa  623  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3684  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  61.7 
 
 		 671 aa  611  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0731  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  61.7 
 
 		 652 aa  610  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.272693  normal  0.130877 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3831  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  61.49 
 
 		 671 aa  609  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  61.47 
 
 		 659 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  61.47 
 
 		 659 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  61.69 
 
 		 659 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  61.47 
 
 		 659 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  61.47 
 
 		 659 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  61.47 
 
 		 659 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  61.47 
 
 		 659 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  61.26 
 
 		 659 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  61 
 
 		 653 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  62.83 
 
 		 667 aa  598  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  61 
 
 		 653 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  61 
 
 		 653 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  60.39 
 
 		 658 aa  595  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2623  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  60.57 
 
 		 653 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2845  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  60.78 
 
 		 653 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  61.42 
 
 		 671 aa  590  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  61.62 
 
 		 674 aa  585  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  62.06 
 
 		 674 aa  586  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03318  glutamate synthase subunit beta  57.74 
 
 		 493 aa  558  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0063  glutamate synthase subunit beta  57.68 
 
 		 481 aa  549  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2257  glutamate synthase subunit beta  57.23 
 
 		 513 aa  545  1e-154  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000664143  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2165  glutamate synthase subunit beta  57.44 
 
 		 513 aa  545  1e-154  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000111952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0806  glutamate synthase, small subunit  56.83 
 
 		 639 aa  535  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0822  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  57.05 
 
 		 639 aa  536  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3046  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  56.83 
 
 		 639 aa  533  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>