More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2138 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0659  putative oxidoreductase  76.88 
 
 
485 aa  747    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247758  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2138  putative oxidoreductase  100 
 
 
480 aa  981    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0001  putative oxidoreductase  67.16 
 
 
479 aa  639    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4951  putative oxidoreductase  66.67 
 
 
481 aa  631  1e-180  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279273  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1149  putative oxidoreductase  65.33 
 
 
475 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2822  putative oxidoreductase  64.21 
 
 
480 aa  607  9.999999999999999e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.289366  normal  0.925781 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2810  putative oxidoreductase  65.33 
 
 
475 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0490  putative oxidoreductase  62.47 
 
 
497 aa  604  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.221306  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0248  putative oxidoreductase  65.24 
 
 
478 aa  600  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0018  putative oxidoreductase  63.25 
 
 
485 aa  594  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1667  putative oxidoreductase  64.83 
 
 
483 aa  596  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.882058  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2778  putative oxidoreductase  65.96 
 
 
475 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.903592 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0331  putative oxidoreductase  64.36 
 
 
484 aa  587  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0301  putative oxidoreductase  65.11 
 
 
487 aa  585  1e-166  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.456706 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03078  glutamate synthase, 4Fe-4S protein, small subunit  46.22 
 
 
472 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0494  glutamate synthase, small subunit  46.22 
 
 
472 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0487  glutamate synthase subunit beta  46.22 
 
 
472 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03029  hypothetical protein  46.22 
 
 
472 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3701  glutamate synthase subunit beta  46.22 
 
 
472 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0616  glutamate synthase subunit beta  47.21 
 
 
472 aa  409  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0465  glutamate synthase subunit beta  46.22 
 
 
472 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000235827  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3406  glutamate synthase subunit beta  46.22 
 
 
472 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4536  glutamate synthase subunit beta  46.01 
 
 
472 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0877  glutamate synthase, small subunit  47.31 
 
 
465 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.44066  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1129  glutamate synthase subunit beta  46.01 
 
 
472 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0513615  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3509  glutamate synthase subunit beta  46.22 
 
 
472 aa  411  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0529  glutamate synthase subunit beta  46.22 
 
 
472 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3557  glutamate synthase subunit beta  46.22 
 
 
472 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0729  glutamate synthase, small subunit  47.31 
 
 
465 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5772  glutamate synthase subunit beta  47 
 
 
477 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1175  glutamate synthase subunit beta  44.64 
 
 
461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66560  glutamate synthase subunit beta  47.21 
 
 
477 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2791  glutamate synthase subunit beta  46.27 
 
 
485 aa  405  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3524  glutamate synthase subunit beta  45.72 
 
 
472 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0530  glutamate synthase, small subunit  45.61 
 
 
461 aa  405  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0212146  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2764  glutamate synthase subunit beta  47.66 
 
 
469 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0856  glutamate synthase subunit beta  45.84 
 
 
472 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3691  glutamate synthase subunit beta  45.51 
 
 
472 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.752822  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0551  glutamate synthase subunit beta  46.22 
 
 
472 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5121  glutamate synthase, small subunit  47.27 
 
 
472 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0412  glutamate synthase subunit beta  47.27 
 
 
472 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45200  glutamate synthase subunit beta  47.17 
 
 
473 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3593  glutamate synthase subunit beta  45.51 
 
 
472 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0304  glutamate synthase subunit beta  44.94 
 
 
472 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2952  glutamate synthase subunit beta  45.97 
 
 
468 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3629  glutamate synthase subunit beta  45.51 
 
 
472 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.344291 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3051  glutamate synthase subunit beta  46.04 
 
 
468 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3522  glutamate synthase subunit beta  45.51 
 
 
472 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0298  glutamate synthase subunit beta  44.94 
 
 
472 aa  398  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1324  glutamate synthase subunit beta  46.04 
 
 
468 aa  398  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0414  glutamate synthase subunit beta  46.43 
 
 
472 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  44.42 
 
 
470 aa  398  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3792  glutamate synthase subunit beta  45.62 
 
 
472 aa  395  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1031  glutamate synthase subunit beta  46.74 
 
 
469 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.473013  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2873  glutamate synthase subunit beta  46.04 
 
 
468 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0110656 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2955  glutamate synthase subunit beta  45.82 
 
 
468 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1012  glutamate synthase subunit beta  45.73 
 
 
469 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  45.91 
 
 
659 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  45.91 
 
 
659 aa  393  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  46.46 
 
 
472 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3657  glutamate synthase subunit beta  44.98 
 
 
472 aa  395  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3136  glutamate synthase subunit beta  45.63 
 
 
468 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.632002 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  46.46 
 
 
472 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.91 
 
 
659 aa  393  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  46.46 
 
 
472 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  45.91 
 
 
659 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.91 
 
 
659 aa  393  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1125  glutamate synthase subunit beta  45.87 
 
 
469 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1177  glutamate synthase subunit beta  45.4 
 
 
468 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.407199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1254  glutamate synthase subunit beta  45.4 
 
 
468 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.55842 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4345  glutamate synthase subunit beta  44.75 
 
 
472 aa  395  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0056621  hitchhiker  0.00954543 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.91 
 
 
659 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.91 
 
 
659 aa  395  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3019  glutamate synthase subunit beta  45.51 
 
 
468 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  45.83 
 
 
472 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.91 
 
 
659 aa  394  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0271  glutamate synthase, small subunit  45.91 
 
 
467 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0925346 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4113  glutamate synthase, small subunit  44.19 
 
 
473 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116897 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1221  glutamate synthase subunit beta  45.63 
 
 
468 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1220  glutamate synthase subunit beta  45.87 
 
 
469 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1135  glutamate synthase subunit beta  45.63 
 
 
468 aa  391  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1057  glutamate synthase subunit beta  48.31 
 
 
469 aa  390  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  47.11 
 
 
674 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2768  glutamate synthase subunit beta  43.96 
 
 
481 aa  386  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.407102  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.32 
 
 
674 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2165  glutamate synthase subunit beta  43.88 
 
 
513 aa  384  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1873  glutamate synthase subunit beta  44.4 
 
 
473 aa  383  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3634  glutamate synthase subunit beta  44.12 
 
 
472 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137963  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2682  glutamate synthase subunit beta  43.56 
 
 
483 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.287891 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2257  glutamate synthase subunit beta  43.47 
 
 
513 aa  382  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000664143  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0835  glutamate synthase subunit beta  45.96 
 
 
472 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.387522  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.36 
 
 
667 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0063  glutamate synthase subunit beta  45.44 
 
 
481 aa  382  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2164  glutamate synthase subunit beta  44.51 
 
 
473 aa  380  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0515227  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1933  glutamate synthase, small subunit  44.02 
 
 
469 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.889564  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  43.51 
 
 
671 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0404  glutamate synthase subunit beta  44.47 
 
 
472 aa  377  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0157845 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  44.57 
 
 
653 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  44.57 
 
 
653 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  44.78 
 
 
653 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>