More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2212 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007103  pE33L466_0262  putative oxidoreductase  68.35 
 
 		 462 aa  650    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  100 
 
 		 465 aa  956    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2109  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  55.38 
 
 		 445 aa  468  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1890  FAD dependent oxidoreductase  54.18 
 
 		 440 aa  468  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00119586  hitchhiker  0.00883124 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  48.89 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  48.67 
 
 		 468 aa  380  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3447  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.56 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00401797  normal  0.0849799 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  46.74 
 
 		 466 aa  360  3e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  45.45 
 
 		 467 aa  360  3e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  44.59 
 
 		 464 aa  357  2.9999999999999997e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  46.73 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2582  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.14 
 
 		 457 aa  349  5e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  45.95 
 
 		 463 aa  348  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  44.72 
 
 		 464 aa  346  5e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  43.74 
 
 		 470 aa  345  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1111  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  43.5 
 
 		 469 aa  345  1e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2198  putative oxidoreductase  44.34 
 
 		 440 aa  343  5e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  44.12 
 
 		 469 aa  342  7e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  43.2 
 
 		 480 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  43.08 
 
 		 468 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  42.86 
 
 		 468 aa  339  5e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  43.02 
 
 		 468 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  42.61 
 
 		 470 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  44.2 
 
 		 476 aa  335  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  45.15 
 
 		 463 aa  334  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  43.21 
 
 		 466 aa  334  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  43.08 
 
 		 464 aa  334  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  43.08 
 
 		 471 aa  334  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  43.18 
 
 		 469 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  43.49 
 
 		 477 aa  333  5e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6711  putative oxidoreductase  43.69 
 
 		 445 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717012  normal  0.546311 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1900  putative bifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta  44.49 
 
 		 747 aa  330  2e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22072  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  44.04 
 
 		 461 aa  330  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  42.6 
 
 		 469 aa  330  3e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  41.59 
 
 		 465 aa  330  4e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1596  putative oxidoreductase  43.47 
 
 		 445 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6235  putative oxidoreductase  43.47 
 
 		 445 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391718  normal  0.166247 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2781  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40 
 
 		 497 aa  330  5.0000000000000004e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.662826  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  43.11 
 
 		 480 aa  329  8e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  42.76 
 
 		 469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6655  putative oxidoreductase  42.83 
 
 		 445 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.0132597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2690  putative oxidoreductase  44.6 
 
 		 449 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1428  putative oxidoreductase  44.47 
 
 		 449 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.26 
 
 		 465 aa  327  3e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  42.99 
 
 		 455 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  41.26 
 
 		 465 aa  325  9e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.96 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  43.12 
 
 		 457 aa  324  2e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  43.46 
 
 		 476 aa  322  9.999999999999999e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.22 
 
 		 761 aa  322  9.999999999999999e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.8 
 
 		 479 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5722  putative oxidoreductase  43.32 
 
 		 445 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  41.11 
 
 		 482 aa  320  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4019  putative oxidoreductase  42.86 
 
 		 448 aa  320  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3639  putative oxidoreductase  42.47 
 
 		 455 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3448  putative oxidoreductase  40.59 
 
 		 475 aa  320  3.9999999999999996e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0584145  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5350  putative oxidoreductase  42.73 
 
 		 445 aa  319  5e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.236159 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5966  putative oxidoreductase  43.96 
 
 		 445 aa  319  7e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.592617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2861  glutamate synthase subunit beta  41.31 
 
 		 455 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  41.02 
 
 		 483 aa  318  2e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  43.5 
 
 		 465 aa  317  2e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  41.36 
 
 		 469 aa  317  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0542  putative oxidoreductase  42.66 
 
 		 455 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0366  putative oxidoreductase  41.85 
 
 		 500 aa  315  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  44.55 
 
 		 447 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  41.36 
 
 		 469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2934  putative oxidoreductase  41.98 
 
 		 459 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.912851  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1535  putative oxidoreductase  41.94 
 
 		 449 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  43.93 
 
 		 474 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1835  putative oxidoreductase  41.35 
 
 		 455 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  41.07 
 
 		 462 aa  311  2e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  43.95 
 
 		 448 aa  311  2e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4037  putative oxidoreductase  41.35 
 
 		 455 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.239048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  39.47 
 
 		 482 aa  310  4e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3280  putative oxidoreductase  42.38 
 
 		 453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0565301 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3442  putative oxidoreductase  40.86 
 
 		 481 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2360  putative oxidoreductase  41.37 
 
 		 453 aa  306  6e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1801  putative oxidoreductase  40.99 
 
 		 478 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1250  putative oxidoreductase  40.13 
 
 		 476 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3028  putative oxidoreductase  41.8 
 
 		 453 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00065642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1362  putative oxidoreductase  40.54 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05750  putative oxidoreductase  41.53 
 
 		 455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0283  putative oxidoreductase  40.22 
 
 		 501 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0297  putative oxidoreductase  40.22 
 
 		 498 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.284933  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0189  putative oxidoreductase  42.79 
 
 		 445 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2057  putative oxidoreductase  43.99 
 
 		 450 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0749543  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1069  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.18 
 
 		 465 aa  301  1e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000858078  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1984  putative oxidoreductase  40 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.292785  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2713  putative oxidoreductase  41.03 
 
 		 446 aa  298  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1112  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  43.89 
 
 		 446 aa  298  2e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1822  glutamate synthase subunit beta  42.56 
 
 		 443 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  40.31 
 
 		 477 aa  297  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0820  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.07 
 
 		 466 aa  296  5e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4152  glutamate synthase subunit beta  39.01 
 
 		 477 aa  296  5e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  38.89 
 
 		 503 aa  295  1e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  39.29 
 
 		 699 aa  295  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0337  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.22 
 
 		 467 aa  294  2e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0044  glutamate synthase subunit beta  41.42 
 
 		 472 aa  293  6e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.76 
 
 		 447 aa  293  6e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0938  putative oxidoreductase  40.49 
 
 		 481 aa  292  7e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>