More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0189 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0189  putative oxidoreductase  100 
 
 		 445 aa  901    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1822  glutamate synthase subunit beta  99.55 
 
 		 443 aa  889    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1456  putative oxidoreductase  92.1 
 
 		 443 aa  811    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1362  putative oxidoreductase  70.59 
 
 		 445 aa  632  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2713  putative oxidoreductase  69.46 
 
 		 446 aa  613  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1501  putative oxidoreductase  67.65 
 
 		 444 aa  593  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3448  putative oxidoreductase  63.37 
 
 		 475 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0584145  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2360  putative oxidoreductase  63.7 
 
 		 453 aa  541  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0283  putative oxidoreductase  61.66 
 
 		 501 aa  536  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0297  putative oxidoreductase  62.9 
 
 		 498 aa  535  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.284933  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2057  putative oxidoreductase  63.39 
 
 		 450 aa  530  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0749543  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0366  putative oxidoreductase  60.45 
 
 		 500 aa  523  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3028  putative oxidoreductase  62.9 
 
 		 453 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00065642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3280  putative oxidoreductase  62.67 
 
 		 453 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0565301 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0044  glutamate synthase subunit beta  58.96 
 
 		 472 aa  488  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2861  glutamate synthase subunit beta  57.3 
 
 		 455 aa  481  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4019  putative oxidoreductase  59.06 
 
 		 448 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2198  putative oxidoreductase  57.05 
 
 		 440 aa  468  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0966  glutamate synthase subunit beta  59.59 
 
 		 451 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1596  putative oxidoreductase  58.03 
 
 		 445 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6235  putative oxidoreductase  58.03 
 
 		 445 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391718  normal  0.166247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4152  glutamate synthase subunit beta  56.02 
 
 		 477 aa  455  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6036  putative oxidoreductase  57.98 
 
 		 455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6711  putative oxidoreductase  58.03 
 
 		 445 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717012  normal  0.546311 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1428  putative oxidoreductase  58.45 
 
 		 449 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5966  putative oxidoreductase  58.22 
 
 		 445 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.592617 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5722  putative oxidoreductase  58.22 
 
 		 445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6655  putative oxidoreductase  57.57 
 
 		 445 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.0132597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2690  putative oxidoreductase  57.08 
 
 		 449 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5350  putative oxidoreductase  59.38 
 
 		 445 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.236159 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1535  putative oxidoreductase  57.41 
 
 		 449 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0542  putative oxidoreductase  53.1 
 
 		 455 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4037  putative oxidoreductase  53.2 
 
 		 455 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.239048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3639  putative oxidoreductase  52.97 
 
 		 455 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1835  putative oxidoreductase  52.74 
 
 		 455 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1801  putative oxidoreductase  53.2 
 
 		 478 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3442  putative oxidoreductase  51.72 
 
 		 481 aa  411  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05750  putative oxidoreductase  52.87 
 
 		 455 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3447  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.21 
 
 		 453 aa  340  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00401797  normal  0.0849799 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2109  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  44.32 
 
 		 445 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1890  FAD dependent oxidoreductase  44.88 
 
 		 440 aa  321  9.999999999999999e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00119586  hitchhiker  0.00883124 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0262  putative oxidoreductase  40.42 
 
 		 462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  42.79 
 
 		 465 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2582  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.6 
 
 		 457 aa  281  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  38.96 
 
 		 470 aa  249  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  35.28 
 
 		 464 aa  247  3e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.42 
 
 		 466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.5 
 
 		 448 aa  243  5e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.45 
 
 		 457 aa  241  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  37.14 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  37.92 
 
 		 470 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.83 
 
 		 479 aa  237  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  36.91 
 
 		 468 aa  237  4e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.26 
 
 		 476 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  37.84 
 
 		 469 aa  234  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.68 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  36.34 
 
 		 471 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.33 
 
 		 469 aa  230  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.52 
 
 		 464 aa  230  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  36.64 
 
 		 469 aa  230  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  36.42 
 
 		 469 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  36.91 
 
 		 469 aa  228  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  35.82 
 
 		 455 aa  228  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.64 
 
 		 483 aa  227  3e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  38.98 
 
 		 653 aa  226  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  35.11 
 
 		 465 aa  224  2e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  34.27 
 
 		 468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.92 
 
 		 474 aa  221  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.22 
 
 		 465 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  36.95 
 
 		 493 aa  219  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2332  putative oxidoreductase  35.89 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2421  putative oxidoreductase  35.89 
 
 		 413 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.70845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2425  putative oxidoreductase  36.03 
 
 		 413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2533  putative oxidoreductase  36.03 
 
 		 413 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0200812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.38 
 
 		 476 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  37.35 
 
 		 658 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  34.47 
 
 		 469 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2376  putative oxidoreductase  36.03 
 
 		 413 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  37.72 
 
 		 654 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  34.48 
 
 		 994 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.41 
 
 		 464 aa  213  7.999999999999999e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  33.04 
 
 		 465 aa  212  9e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3278  putative oxidoreductase  35.2 
 
 		 412 aa  212  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.598108 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  34.5 
 
 		 480 aa  212  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  38.33 
 
 		 699 aa  212  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0825  putative oxidoreductase  36.39 
 
 		 412 aa  212  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.24 
 
 		 458 aa  212  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02075  predicted oxidoreductase  35.46 
 
 		 412 aa  210  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1512  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.46 
 
 		 412 aa  210  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1502  putative oxidoreductase  35.46 
 
 		 412 aa  210  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02034  hypothetical protein  35.46 
 
 		 412 aa  210  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.34 
 
 		 447 aa  210  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2293  putative oxidoreductase  35.43 
 
 		 412 aa  210  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262467 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  35.21 
 
 		 463 aa  210  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2280  putative oxidoreductase  35.7 
 
 		 412 aa  209  6e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  34.15 
 
 		 477 aa  209  7e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1112  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  34.83 
 
 		 446 aa  209  7e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  34.5 
 
 		 480 aa  209  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1069  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.65 
 
 		 465 aa  208  1e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000858078  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3019  glutamate synthase subunit beta  33.26 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>