More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2582 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2582  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
457 aa  904    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1890  FAD dependent oxidoreductase  48.52 
 
 
440 aa  360  2e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00119586  hitchhiker  0.00883124 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2109  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  47.64 
 
 
445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  46.14 
 
 
465 aa  349  5e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  43.75 
 
 
468 aa  332  1e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0262  putative oxidoreductase  40.9 
 
 
462 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  43.75 
 
 
468 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  41.8 
 
 
455 aa  318  1e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  42.17 
 
 
457 aa  307  3e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  41.5 
 
 
476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  39.91 
 
 
465 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3447  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.31 
 
 
453 aa  303  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00401797  normal  0.0849799 
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  39.91 
 
 
465 aa  301  2e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.91 
 
 
466 aa  301  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.54 
 
 
458 aa  301  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  39.91 
 
 
464 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.91 
 
 
465 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2198  putative oxidoreductase  44.78 
 
 
440 aa  298  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2360  putative oxidoreductase  44.58 
 
 
453 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.44 
 
 
448 aa  298  2e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1362  putative oxidoreductase  44.08 
 
 
445 aa  296  7e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.17 
 
 
467 aa  294  2e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3028  putative oxidoreductase  43.94 
 
 
453 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00065642  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3280  putative oxidoreductase  44.62 
 
 
453 aa  292  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0565301 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  41.39 
 
 
469 aa  291  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.77 
 
 
476 aa  291  2e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  39.69 
 
 
470 aa  290  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  41.43 
 
 
469 aa  288  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0542  putative oxidoreductase  43.84 
 
 
455 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.04 
 
 
464 aa  288  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3448  putative oxidoreductase  40.62 
 
 
475 aa  287  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0584145  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2690  putative oxidoreductase  43.62 
 
 
449 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0366  putative oxidoreductase  38.98 
 
 
500 aa  286  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  42.09 
 
 
463 aa  286  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1596  putative oxidoreductase  43.53 
 
 
445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  38.96 
 
 
480 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6235  putative oxidoreductase  43.53 
 
 
445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391718  normal  0.166247 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  42.72 
 
 
447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  39.13 
 
 
468 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6655  putative oxidoreductase  43.33 
 
 
445 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.0132597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2713  putative oxidoreductase  42.26 
 
 
446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.83 
 
 
461 aa  283  5.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6711  putative oxidoreductase  43.16 
 
 
445 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717012  normal  0.546311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2861  glutamate synthase subunit beta  42.57 
 
 
455 aa  283  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05750  putative oxidoreductase  43.02 
 
 
455 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  39.52 
 
 
469 aa  282  9e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0189  putative oxidoreductase  42.6 
 
 
445 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1428  putative oxidoreductase  43.12 
 
 
449 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1835  putative oxidoreductase  42.33 
 
 
455 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3442  putative oxidoreductase  40.64 
 
 
481 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  39.43 
 
 
469 aa  280  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  37.53 
 
 
482 aa  280  4e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2057  putative oxidoreductase  44.29 
 
 
450 aa  280  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0749543  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  39.19 
 
 
477 aa  279  6e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.68 
 
 
464 aa  279  8e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4037  putative oxidoreductase  42.33 
 
 
455 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.239048  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.13 
 
 
447 aa  278  1e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  37.92 
 
 
477 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  38.17 
 
 
482 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5722  putative oxidoreductase  42.46 
 
 
445 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265057  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3509  glutamate synthase subunit beta  39.64 
 
 
472 aa  277  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  39.73 
 
 
480 aa  277  4e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0044  glutamate synthase subunit beta  41.7 
 
 
472 aa  276  4e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5966  putative oxidoreductase  42.46 
 
 
445 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.592617 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  38.34 
 
 
483 aa  276  5e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1801  putative oxidoreductase  42.33 
 
 
478 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1111  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.05 
 
 
469 aa  276  8e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0487  glutamate synthase subunit beta  39.41 
 
 
472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5350  putative oxidoreductase  42.66 
 
 
445 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.236159 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03078  glutamate synthase, 4Fe-4S protein, small subunit  39.41 
 
 
472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0494  glutamate synthase, small subunit  39.41 
 
 
472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3639  putative oxidoreductase  42.11 
 
 
455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3406  glutamate synthase subunit beta  39.41 
 
 
472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03029  hypothetical protein  39.41 
 
 
472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3557  glutamate synthase subunit beta  39.41 
 
 
472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4536  glutamate synthase subunit beta  39.41 
 
 
472 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3691  glutamate synthase subunit beta  39.64 
 
 
472 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.752822  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1535  putative oxidoreductase  43.09 
 
 
449 aa  274  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3593  glutamate synthase subunit beta  39.64 
 
 
472 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.55 
 
 
474 aa  273  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3522  glutamate synthase subunit beta  39.64 
 
 
472 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3629  glutamate synthase subunit beta  39.64 
 
 
472 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.344291 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.67 
 
 
465 aa  273  4.0000000000000004e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1822  glutamate synthase subunit beta  42.14 
 
 
443 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  35.89 
 
 
468 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.28 
 
 
761 aa  273  5.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3701  glutamate synthase subunit beta  39.18 
 
 
472 aa  273  6e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0271  glutamate synthase, small subunit  40.7 
 
 
467 aa  273  6e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0925346 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3792  glutamate synthase subunit beta  38.26 
 
 
472 aa  272  7e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  35.67 
 
 
468 aa  272  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0297  putative oxidoreductase  39.19 
 
 
498 aa  271  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.284933  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4019  putative oxidoreductase  43.39 
 
 
448 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0283  putative oxidoreductase  39.19 
 
 
501 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0304  glutamate synthase subunit beta  37.92 
 
 
472 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3524  glutamate synthase subunit beta  39.18 
 
 
472 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  38.98 
 
 
471 aa  270  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0298  glutamate synthase subunit beta  37.92 
 
 
472 aa  270  5e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3634  glutamate synthase subunit beta  38.6 
 
 
472 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137963  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1900  putative bifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta  39.09 
 
 
747 aa  269  8e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22072  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1112  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  41.27 
 
 
446 aa  269  8.999999999999999e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>