More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1835 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1835  putative oxidoreductase  100 
 
 		 455 aa  921    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4037  putative oxidoreductase  92.75 
 
 		 455 aa  860    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.239048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3442  putative oxidoreductase  80.66 
 
 		 481 aa  756    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0542  putative oxidoreductase  82.86 
 
 		 455 aa  766    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1801  putative oxidoreductase  92.31 
 
 		 478 aa  856    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05750  putative oxidoreductase  83.08 
 
 		 455 aa  769    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3639  putative oxidoreductase  94.73 
 
 		 455 aa  874    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0366  putative oxidoreductase  53.42 
 
 		 500 aa  463  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0044  glutamate synthase subunit beta  55.15 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0283  putative oxidoreductase  52.93 
 
 		 501 aa  448  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0297  putative oxidoreductase  52.93 
 
 		 498 aa  448  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.284933  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4152  glutamate synthase subunit beta  53.8 
 
 		 477 aa  441  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4019  putative oxidoreductase  53.61 
 
 		 448 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0966  glutamate synthase subunit beta  54.84 
 
 		 451 aa  429  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2198  putative oxidoreductase  54.11 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2690  putative oxidoreductase  54.06 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1596  putative oxidoreductase  53.53 
 
 		 445 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6235  putative oxidoreductase  53.53 
 
 		 445 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391718  normal  0.166247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2861  glutamate synthase subunit beta  51.94 
 
 		 455 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1428  putative oxidoreductase  53.95 
 
 		 449 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6711  putative oxidoreductase  53.53 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717012  normal  0.546311 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5722  putative oxidoreductase  54.08 
 
 		 445 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2360  putative oxidoreductase  52.35 
 
 		 453 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0189  putative oxidoreductase  52.74 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1822  glutamate synthase subunit beta  52.74 
 
 		 443 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6655  putative oxidoreductase  52.62 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.0132597 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5966  putative oxidoreductase  53.38 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.592617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1535  putative oxidoreductase  53.36 
 
 		 449 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2057  putative oxidoreductase  52.85 
 
 		 450 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0749543  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5350  putative oxidoreductase  52.45 
 
 		 445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.236159 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3028  putative oxidoreductase  53.15 
 
 		 453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00065642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2713  putative oxidoreductase  52.15 
 
 		 446 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3280  putative oxidoreductase  53.15 
 
 		 453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0565301 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3448  putative oxidoreductase  50 
 
 		 475 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0584145  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1501  putative oxidoreductase  52.38 
 
 		 444 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1362  putative oxidoreductase  51.02 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1456  putative oxidoreductase  51.25 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6036  putative oxidoreductase  49.64 
 
 		 455 aa  341  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2109  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  44.84 
 
 		 445 aa  330  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3447  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.25 
 
 		 453 aa  330  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00401797  normal  0.0849799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1890  FAD dependent oxidoreductase  44.54 
 
 		 440 aa  323  6e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00119586  hitchhiker  0.00883124 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  41.35 
 
 		 465 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0262  putative oxidoreductase  35.89 
 
 		 462 aa  290  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2582  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.33 
 
 		 457 aa  281  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  35.93 
 
 		 470 aa  237  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.41 
 
 		 466 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.12 
 
 		 480 aa  231  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.08 
 
 		 463 aa  229  7e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.12 
 
 		 474 aa  229  8e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  34.56 
 
 		 469 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.53 
 
 		 469 aa  228  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  35.18 
 
 		 470 aa  227  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.41 
 
 		 465 aa  227  3e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  34.18 
 
 		 482 aa  226  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  33.98 
 
 		 465 aa  226  8e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  34.79 
 
 		 463 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  34.22 
 
 		 469 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  33.84 
 
 		 468 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.25 
 
 		 457 aa  224  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  33.56 
 
 		 468 aa  224  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  34.04 
 
 		 483 aa  224  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  33.92 
 
 		 482 aa  223  4e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  35.62 
 
 		 469 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.26 
 
 		 463 aa  223  6e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  34.89 
 
 		 480 aa  223  7e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.15 
 
 		 996 aa  223  8e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  33.91 
 
 		 469 aa  222  9e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  34.08 
 
 		 468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.62 
 
 		 465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  34.5 
 
 		 477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  33.77 
 
 		 464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.82 
 
 		 483 aa  221  3e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.91 
 
 		 464 aa  220  3e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  33.05 
 
 		 471 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  32.67 
 
 		 455 aa  219  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  33.26 
 
 		 465 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.09 
 
 		 476 aa  218  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  31.96 
 
 		 469 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  34.27 
 
 		 503 aa  216  5.9999999999999996e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1112  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  35.78 
 
 		 446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.53 
 
 		 464 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  35.61 
 
 		 653 aa  213  7.999999999999999e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.13 
 
 		 458 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.32 
 
 		 467 aa  212  1e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2781  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.53 
 
 		 497 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.662826  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  31.01 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  31.98 
 
 		 994 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.08 
 
 		 466 aa  210  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  33.18 
 
 		 480 aa  210  5e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.31 
 
 		 448 aa  209  7e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  33.48 
 
 		 472 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  33.48 
 
 		 472 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  33.48 
 
 		 472 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  33.03 
 
 		 472 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0551  glutamate synthase subunit beta  33.26 
 
 		 472 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592463 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45200  glutamate synthase subunit beta  34.07 
 
 		 473 aa  207  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.49 
 
 		 476 aa  206  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.85 
 
 		 447 aa  204  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  30.56 
 
 		 468 aa  205  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.06 
 
 		 1406 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>