More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5350 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2690  putative oxidoreductase  78.4 
 
 
449 aa  675    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5722  putative oxidoreductase  89.66 
 
 
445 aa  781    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265057  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6655  putative oxidoreductase  89.44 
 
 
445 aa  795    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.0132597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1535  putative oxidoreductase  79.81 
 
 
449 aa  677    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5350  putative oxidoreductase  100 
 
 
445 aa  889    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.236159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1428  putative oxidoreductase  80.51 
 
 
449 aa  682    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1596  putative oxidoreductase  89.66 
 
 
445 aa  794    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5966  putative oxidoreductase  89.66 
 
 
445 aa  781    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.592617 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6235  putative oxidoreductase  89.66 
 
 
445 aa  794    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391718  normal  0.166247 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6711  putative oxidoreductase  89.66 
 
 
445 aa  793    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717012  normal  0.546311 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2198  putative oxidoreductase  63.07 
 
 
440 aa  506  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0044  glutamate synthase subunit beta  58.77 
 
 
472 aa  474  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4019  putative oxidoreductase  58.81 
 
 
448 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2861  glutamate synthase subunit beta  58.54 
 
 
455 aa  467  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1362  putative oxidoreductase  57.27 
 
 
445 aa  464  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0366  putative oxidoreductase  52.82 
 
 
500 aa  455  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0297  putative oxidoreductase  53.27 
 
 
498 aa  449  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.284933  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0283  putative oxidoreductase  53.27 
 
 
501 aa  448  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0189  putative oxidoreductase  59.15 
 
 
445 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1822  glutamate synthase subunit beta  59.15 
 
 
443 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2713  putative oxidoreductase  56.7 
 
 
446 aa  448  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2360  putative oxidoreductase  54.36 
 
 
453 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4152  glutamate synthase subunit beta  54.64 
 
 
477 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0966  glutamate synthase subunit beta  58.35 
 
 
451 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05750  putative oxidoreductase  55.07 
 
 
455 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0542  putative oxidoreductase  55.07 
 
 
455 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1456  putative oxidoreductase  59.15 
 
 
443 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2057  putative oxidoreductase  55.1 
 
 
450 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0749543  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3448  putative oxidoreductase  53.08 
 
 
475 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0584145  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3280  putative oxidoreductase  53.81 
 
 
453 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0565301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1835  putative oxidoreductase  52.39 
 
 
455 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3028  putative oxidoreductase  53.59 
 
 
453 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00065642  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3639  putative oxidoreductase  53.18 
 
 
455 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3442  putative oxidoreductase  51.48 
 
 
481 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1501  putative oxidoreductase  53.88 
 
 
444 aa  412  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4037  putative oxidoreductase  53.18 
 
 
455 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.239048  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1801  putative oxidoreductase  53.18 
 
 
478 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6036  putative oxidoreductase  52.91 
 
 
455 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255193  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3447  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.02 
 
 
453 aa  338  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00401797  normal  0.0849799 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2109  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  44.04 
 
 
445 aa  335  1e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  42.47 
 
 
465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1890  FAD dependent oxidoreductase  44.24 
 
 
440 aa  327  3e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00119586  hitchhiker  0.00883124 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0262  putative oxidoreductase  40.14 
 
 
462 aa  315  9e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2582  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.53 
 
 
457 aa  285  9e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  39.1 
 
 
470 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.64 
 
 
448 aa  254  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  36.1 
 
 
464 aa  252  9.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.64 
 
 
466 aa  250  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  37.98 
 
 
465 aa  246  4e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.59 
 
 
469 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  37.78 
 
 
455 aa  246  8e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.09 
 
 
447 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.16 
 
 
465 aa  238  1e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  35.54 
 
 
462 aa  237  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.49 
 
 
474 aa  237  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  37.25 
 
 
470 aa  236  8e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  36.4 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.2 
 
 
457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  37.44 
 
 
471 aa  234  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  38.44 
 
 
654 aa  233  6e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  37.09 
 
 
469 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  38.55 
 
 
699 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.38 
 
 
476 aa  233  8.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  36.94 
 
 
469 aa  232  9e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.83 
 
 
466 aa  232  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  36.75 
 
 
469 aa  231  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.62 
 
 
464 aa  230  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  37.67 
 
 
463 aa  230  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  35.53 
 
 
468 aa  229  7e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  36.53 
 
 
469 aa  229  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.19 
 
 
463 aa  228  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.32 
 
 
458 aa  227  3e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.36 
 
 
480 aa  226  6e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  35.53 
 
 
468 aa  225  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.97 
 
 
464 aa  224  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  33.99 
 
 
482 aa  224  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  36.94 
 
 
658 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  34.34 
 
 
469 aa  223  6e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.67 
 
 
447 aa  223  6e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2781  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.85 
 
 
497 aa  221  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.662826  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.04 
 
 
467 aa  222  9.999999999999999e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.47 
 
 
479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  34.57 
 
 
483 aa  218  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.08 
 
 
996 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1112  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  36.36 
 
 
446 aa  219  1e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  35.52 
 
 
468 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  35.48 
 
 
477 aa  218  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  34.22 
 
 
480 aa  218  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  33.19 
 
 
482 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  35.33 
 
 
477 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.42 
 
 
476 aa  215  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  35.68 
 
 
493 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  36.36 
 
 
653 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1900  putative bifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta  35.24 
 
 
747 aa  213  3.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  30.06 
 
 
468 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  35.73 
 
 
1150 aa  212  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  33.72 
 
 
503 aa  212  1e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.08 
 
 
461 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  29.85 
 
 
468 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.22 
 
 
463 aa  211  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>