More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6036 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6036  putative oxidoreductase  100 
 
 		 455 aa  900    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0297  putative oxidoreductase  60.14 
 
 		 498 aa  501  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.284933  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0283  putative oxidoreductase  60.14 
 
 		 501 aa  501  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2360  putative oxidoreductase  59.28 
 
 		 453 aa  498  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0366  putative oxidoreductase  58.73 
 
 		 500 aa  495  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0189  putative oxidoreductase  58.92 
 
 		 445 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3280  putative oxidoreductase  60.32 
 
 		 453 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0565301 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1362  putative oxidoreductase  58.07 
 
 		 445 aa  488  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3028  putative oxidoreductase  60.87 
 
 		 453 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00065642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3448  putative oxidoreductase  58.22 
 
 		 475 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0584145  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1822  glutamate synthase subunit beta  59.14 
 
 		 443 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2713  putative oxidoreductase  56.95 
 
 		 446 aa  475  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2057  putative oxidoreductase  59.32 
 
 		 450 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0749543  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1456  putative oxidoreductase  58.74 
 
 		 443 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1501  putative oxidoreductase  56.92 
 
 		 444 aa  457  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0044  glutamate synthase subunit beta  55.87 
 
 		 472 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4019  putative oxidoreductase  55.73 
 
 		 448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4152  glutamate synthase subunit beta  53.52 
 
 		 477 aa  441  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2861  glutamate synthase subunit beta  52.69 
 
 		 455 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2198  putative oxidoreductase  53.6 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6711  putative oxidoreductase  54.71 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717012  normal  0.546311 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1596  putative oxidoreductase  54.48 
 
 		 445 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6235  putative oxidoreductase  54.48 
 
 		 445 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391718  normal  0.166247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0966  glutamate synthase subunit beta  55.81 
 
 		 451 aa  430  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1535  putative oxidoreductase  54.36 
 
 		 449 aa  423  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6655  putative oxidoreductase  53.14 
 
 		 445 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.0132597 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5722  putative oxidoreductase  53.67 
 
 		 445 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1428  putative oxidoreductase  53.44 
 
 		 449 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5966  putative oxidoreductase  53.44 
 
 		 445 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.592617 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2690  putative oxidoreductase  52.29 
 
 		 449 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5350  putative oxidoreductase  54.13 
 
 		 445 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.236159 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3442  putative oxidoreductase  50.33 
 
 		 481 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4037  putative oxidoreductase  50.44 
 
 		 455 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.239048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3639  putative oxidoreductase  50.46 
 
 		 455 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05750  putative oxidoreductase  51.28 
 
 		 455 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0542  putative oxidoreductase  51.47 
 
 		 455 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1801  putative oxidoreductase  50.68 
 
 		 478 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1835  putative oxidoreductase  49.77 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3447  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.8 
 
 		 453 aa  347  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00401797  normal  0.0849799 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2109  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  47.64 
 
 		 445 aa  338  8e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1890  FAD dependent oxidoreductase  46.8 
 
 		 440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00119586  hitchhiker  0.00883124 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2582  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.37 
 
 		 457 aa  289  6e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  41.56 
 
 		 465 aa  289  8e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0262  putative oxidoreductase  38.41 
 
 		 462 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  38.88 
 
 		 470 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.17 
 
 		 457 aa  236  6e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0825  putative oxidoreductase  37.67 
 
 		 412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3278  putative oxidoreductase  37.44 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.598108 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2421  putative oxidoreductase  37.27 
 
 		 413 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.70845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2425  putative oxidoreductase  37.04 
 
 		 413 aa  232  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2332  putative oxidoreductase  36.28 
 
 		 413 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2533  putative oxidoreductase  36.81 
 
 		 413 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0200812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  36.61 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2293  putative oxidoreductase  37.21 
 
 		 412 aa  231  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262467 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02075  predicted oxidoreductase  36.74 
 
 		 412 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1512  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.74 
 
 		 412 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02034  hypothetical protein  36.74 
 
 		 412 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1502  putative oxidoreductase  36.74 
 
 		 412 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3792  glutamate synthase subunit beta  36 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2441  putative oxidoreductase  36.98 
 
 		 412 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0304  glutamate synthase subunit beta  35.78 
 
 		 472 aa  227  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0465  glutamate synthase subunit beta  35.84 
 
 		 472 aa  227  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000235827  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0529  glutamate synthase subunit beta  35.84 
 
 		 472 aa  227  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38 
 
 		 479 aa  227  4e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  39.67 
 
 		 469 aa  227  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0729  glutamate synthase, small subunit  37.86 
 
 		 465 aa  226  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0877  glutamate synthase, small subunit  37.86 
 
 		 465 aa  226  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.44066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2376  putative oxidoreductase  36.28 
 
 		 413 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2280  putative oxidoreductase  36.74 
 
 		 412 aa  226  7e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0298  glutamate synthase subunit beta  35.78 
 
 		 472 aa  226  8e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.16 
 
 		 466 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3634  glutamate synthase subunit beta  35.79 
 
 		 472 aa  225  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137963  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1129  glutamate synthase subunit beta  35.62 
 
 		 472 aa  225  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0513615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  36.58 
 
 		 469 aa  225  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0856  glutamate synthase subunit beta  34.6 
 
 		 472 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.62 
 
 		 476 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4345  glutamate synthase subunit beta  35.63 
 
 		 472 aa  223  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0056621  hitchhiker  0.00954543 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  36.58 
 
 		 469 aa  223  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  37.55 
 
 		 471 aa  222  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.62 
 
 		 464 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  38.91 
 
 		 470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.18 
 
 		 463 aa  220  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1220  glutamate synthase subunit beta  35.35 
 
 		 469 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4536  glutamate synthase subunit beta  35.86 
 
 		 472 aa  219  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.62 
 
 		 659 aa  219  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3509  glutamate synthase subunit beta  35.35 
 
 		 472 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03078  glutamate synthase, 4Fe-4S protein, small subunit  35.35 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0494  glutamate synthase, small subunit  35.35 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3557  glutamate synthase subunit beta  35.35 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3691  glutamate synthase subunit beta  35.57 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.752822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0487  glutamate synthase subunit beta  35.35 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3406  glutamate synthase subunit beta  35.35 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3522  glutamate synthase subunit beta  35.57 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.16 
 
 		 474 aa  218  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03029  hypothetical protein  35.35 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  34.24 
 
 		 482 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3593  glutamate synthase subunit beta  35.57 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3629  glutamate synthase subunit beta  35.57 
 
 		 472 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.344291 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  35.98 
 
 		 477 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  37.3 
 
 		 455 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>