More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6235 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1535  putative oxidoreductase  82.41 
 
 
449 aa  699    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5350  putative oxidoreductase  89.66 
 
 
445 aa  776    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.236159 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2690  putative oxidoreductase  80.97 
 
 
449 aa  689    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6655  putative oxidoreductase  93.03 
 
 
445 aa  824    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.0132597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1428  putative oxidoreductase  81.21 
 
 
449 aa  693    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1596  putative oxidoreductase  100 
 
 
445 aa  892    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6711  putative oxidoreductase  98.43 
 
 
445 aa  877    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717012  normal  0.546311 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5722  putative oxidoreductase  94.38 
 
 
445 aa  819    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265057  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5966  putative oxidoreductase  94.16 
 
 
445 aa  815    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.592617 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6235  putative oxidoreductase  100 
 
 
445 aa  892    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391718  normal  0.166247 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2198  putative oxidoreductase  63.16 
 
 
440 aa  516  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0044  glutamate synthase subunit beta  59.23 
 
 
472 aa  484  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2861  glutamate synthase subunit beta  59.41 
 
 
455 aa  484  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4019  putative oxidoreductase  58.12 
 
 
448 aa  475  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1362  putative oxidoreductase  57.27 
 
 
445 aa  474  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0366  putative oxidoreductase  53.5 
 
 
500 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1822  glutamate synthase subunit beta  58.03 
 
 
443 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_004310  BR0283  putative oxidoreductase  53.72 
 
 
501 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0189  putative oxidoreductase  58.03 
 
 
445 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0297  putative oxidoreductase  53.72 
 
 
498 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.284933  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2713  putative oxidoreductase  55.68 
 
 
446 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2360  putative oxidoreductase  54.91 
 
 
453 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0966  glutamate synthase subunit beta  57.89 
 
 
451 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4152  glutamate synthase subunit beta  54.43 
 
 
477 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3448  putative oxidoreductase  53.64 
 
 
475 aa  438  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0584145  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1456  putative oxidoreductase  58.03 
 
 
443 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3028  putative oxidoreductase  54.48 
 
 
453 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00065642  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1501  putative oxidoreductase  54.77 
 
 
444 aa  428  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2057  putative oxidoreductase  54.95 
 
 
450 aa  430  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0749543  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1835  putative oxidoreductase  53.53 
 
 
455 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05750  putative oxidoreductase  54.02 
 
 
455 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3280  putative oxidoreductase  53.81 
 
 
453 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0565301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3639  putative oxidoreductase  53.86 
 
 
455 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0542  putative oxidoreductase  53.92 
 
 
455 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4037  putative oxidoreductase  53.86 
 
 
455 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.239048  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1801  putative oxidoreductase  53.86 
 
 
478 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3442  putative oxidoreductase  51.26 
 
 
481 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6036  putative oxidoreductase  52.91 
 
 
455 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255193  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3447  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.16 
 
 
453 aa  345  7e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00401797  normal  0.0849799 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2109  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  44.29 
 
 
445 aa  335  7e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  43.47 
 
 
465 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1890  FAD dependent oxidoreductase  43.52 
 
 
440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00119586  hitchhiker  0.00883124 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0262  putative oxidoreductase  41.3 
 
 
462 aa  323  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2582  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.76 
 
 
457 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.95 
 
 
448 aa  261  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  38.8 
 
 
470 aa  260  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  38.65 
 
 
465 aa  252  9.000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  36.18 
 
 
464 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  37.47 
 
 
469 aa  246  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  36.93 
 
 
470 aa  245  9e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  36.98 
 
 
469 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.32 
 
 
466 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.86 
 
 
447 aa  244  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.69 
 
 
469 aa  243  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.53 
 
 
465 aa  244  3e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  37.95 
 
 
471 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  35.93 
 
 
462 aa  243  6e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  36.96 
 
 
455 aa  242  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.01 
 
 
457 aa  241  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  38.83 
 
 
469 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  36.85 
 
 
465 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  37.11 
 
 
469 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.3 
 
 
474 aa  237  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.63 
 
 
466 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  37.89 
 
 
654 aa  233  5e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  38.03 
 
 
699 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.87 
 
 
463 aa  232  1e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.84 
 
 
464 aa  232  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  36.47 
 
 
658 aa  231  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  36.1 
 
 
469 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.24 
 
 
476 aa  229  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.94 
 
 
465 aa  229  8e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  35.57 
 
 
468 aa  229  9e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.4 
 
 
458 aa  229  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  35.63 
 
 
468 aa  225  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  37.25 
 
 
463 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.9 
 
 
464 aa  224  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.7 
 
 
483 aa  224  3e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  35.6 
 
 
477 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  37.02 
 
 
653 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2781  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.5 
 
 
497 aa  223  6e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.662826  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  36.13 
 
 
493 aa  223  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.89 
 
 
447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.68 
 
 
467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  32.21 
 
 
468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  34.96 
 
 
480 aa  220  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.42 
 
 
479 aa  221  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.96 
 
 
612 aa  221  3e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1112  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  36.85 
 
 
446 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.82 
 
 
996 aa  219  8.999999999999998e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.94 
 
 
476 aa  219  8.999999999999998e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  31.99 
 
 
468 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.99 
 
 
463 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.68 
 
 
480 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  34.59 
 
 
483 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  32.9 
 
 
482 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  33.94 
 
 
482 aa  217  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  35.7 
 
 
1150 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0825  putative oxidoreductase  35.02 
 
 
412 aa  215  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1900  putative bifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta  35.89 
 
 
747 aa  214  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>