More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2109 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1890  FAD dependent oxidoreductase  83.41 
 
 
440 aa  756    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00119586  hitchhiker  0.00883124 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2109  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  100 
 
 
445 aa  896    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  55.38 
 
 
465 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0262  putative oxidoreductase  51.76 
 
 
462 aa  433  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2582  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.64 
 
 
457 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2198  putative oxidoreductase  45.81 
 
 
440 aa  345  7e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  46.17 
 
 
466 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4037  putative oxidoreductase  45.48 
 
 
455 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.239048  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0366  putative oxidoreductase  44.47 
 
 
500 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3639  putative oxidoreductase  45.7 
 
 
455 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3447  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.95 
 
 
453 aa  334  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00401797  normal  0.0849799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1801  putative oxidoreductase  45.02 
 
 
478 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0542  putative oxidoreductase  45.45 
 
 
455 aa  332  9e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1596  putative oxidoreductase  44.29 
 
 
445 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6235  putative oxidoreductase  44.29 
 
 
445 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391718  normal  0.166247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05750  putative oxidoreductase  45.68 
 
 
455 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1835  putative oxidoreductase  44.84 
 
 
455 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6711  putative oxidoreductase  44.29 
 
 
445 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717012  normal  0.546311 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6655  putative oxidoreductase  44.29 
 
 
445 aa  330  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.0132597 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5722  putative oxidoreductase  45.26 
 
 
445 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265057  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0189  putative oxidoreductase  44.32 
 
 
445 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5966  putative oxidoreductase  45.26 
 
 
445 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.592617 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  43.81 
 
 
469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5350  putative oxidoreductase  44.13 
 
 
445 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.236159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2861  glutamate synthase subunit beta  42.82 
 
 
455 aa  326  4.0000000000000003e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2360  putative oxidoreductase  44.02 
 
 
453 aa  326  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2690  putative oxidoreductase  42.73 
 
 
449 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1822  glutamate synthase subunit beta  44.32 
 
 
443 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_004310  BR0283  putative oxidoreductase  43.78 
 
 
501 aa  323  3e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0297  putative oxidoreductase  43.78 
 
 
498 aa  323  3e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.284933  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1428  putative oxidoreductase  43.52 
 
 
449 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1362  putative oxidoreductase  43.09 
 
 
445 aa  323  4e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  42.82 
 
 
464 aa  323  4e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3448  putative oxidoreductase  42.82 
 
 
475 aa  322  7e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0584145  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3442  putative oxidoreductase  42.32 
 
 
481 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2713  putative oxidoreductase  45.37 
 
 
446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0044  glutamate synthase subunit beta  44.16 
 
 
472 aa  319  6e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3028  putative oxidoreductase  44.57 
 
 
453 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00065642  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1535  putative oxidoreductase  42.43 
 
 
449 aa  317  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4019  putative oxidoreductase  43.97 
 
 
448 aa  315  9e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  43.46 
 
 
470 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2057  putative oxidoreductase  45.87 
 
 
450 aa  315  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0749543  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3280  putative oxidoreductase  44.34 
 
 
453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0565301 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  43.75 
 
 
480 aa  312  1e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4152  glutamate synthase subunit beta  41.98 
 
 
477 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6036  putative oxidoreductase  45.87 
 
 
455 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255193  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  42.66 
 
 
469 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  41.84 
 
 
470 aa  309  5e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  43.09 
 
 
477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  44.08 
 
 
468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  43.98 
 
 
468 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  41.8 
 
 
468 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  44.52 
 
 
463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0966  glutamate synthase subunit beta  44.01 
 
 
451 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  40.62 
 
 
483 aa  303  6.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  41.61 
 
 
480 aa  302  6.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  43.49 
 
 
469 aa  301  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  40.84 
 
 
471 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  40.92 
 
 
469 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  40.69 
 
 
469 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  42.42 
 
 
455 aa  300  2e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  41.55 
 
 
476 aa  300  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  43.07 
 
 
458 aa  297  2e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1456  putative oxidoreductase  44.85 
 
 
443 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.87 
 
 
465 aa  296  3e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.86 
 
 
464 aa  296  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  39.49 
 
 
482 aa  296  7e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.34 
 
 
761 aa  293  3e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.76 
 
 
448 aa  294  3e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  43.2 
 
 
463 aa  293  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.07 
 
 
467 aa  293  5e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.91 
 
 
479 aa  292  9e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  42.46 
 
 
457 aa  292  9e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  43.22 
 
 
474 aa  291  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  40.73 
 
 
482 aa  291  2e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1501  putative oxidoreductase  43.19 
 
 
444 aa  289  9e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  40.65 
 
 
462 aa  288  1e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.11 
 
 
469 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0856  glutamate synthase subunit beta  38.36 
 
 
472 aa  286  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.2 
 
 
466 aa  286  5e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  39.59 
 
 
503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.9 
 
 
447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.34 
 
 
464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1112  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  42.09 
 
 
446 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2934  putative oxidoreductase  42 
 
 
459 aa  282  7.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.912851  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  38.56 
 
 
465 aa  282  7.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.32 
 
 
483 aa  282  8.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  42.79 
 
 
447 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  39.78 
 
 
465 aa  282  1e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.2 
 
 
461 aa  281  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.42 
 
 
480 aa  280  5e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  38.43 
 
 
477 aa  279  7e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1111  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.27 
 
 
469 aa  279  9e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3792  glutamate synthase subunit beta  37.72 
 
 
472 aa  277  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1129  glutamate synthase subunit beta  37.95 
 
 
472 aa  276  4e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0513615  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0529  glutamate synthase subunit beta  37.95 
 
 
472 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0465  glutamate synthase subunit beta  37.95 
 
 
472 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000235827  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.98 
 
 
465 aa  276  6e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  38.07 
 
 
468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.41 
 
 
476 aa  274  2.0000000000000002e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>