More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0436 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  84.68 
 
 
483 aa  848    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  82.56 
 
 
480 aa  827    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  81.4 
 
 
477 aa  821    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  82.63 
 
 
480 aa  819    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  100 
 
 
482 aa  987    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  83.61 
 
 
482 aa  851    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  62.28 
 
 
468 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  61.94 
 
 
469 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  59.57 
 
 
469 aa  570  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  61.44 
 
 
464 aa  567  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  59.52 
 
 
466 aa  561  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  60.39 
 
 
466 aa  555  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  61.34 
 
 
463 aa  557  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  58.82 
 
 
464 aa  550  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  58.89 
 
 
462 aa  543  1e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  56.16 
 
 
503 aa  543  1e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  60.77 
 
 
469 aa  543  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  57.81 
 
 
470 aa  538  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  56.38 
 
 
479 aa  535  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  59.47 
 
 
761 aa  531  1e-150  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  56.03 
 
 
468 aa  525  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  57.05 
 
 
468 aa  525  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  60.56 
 
 
463 aa  526  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  56.33 
 
 
471 aa  524  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  56.93 
 
 
461 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  57.77 
 
 
455 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  55.63 
 
 
469 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  55.56 
 
 
465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  55.34 
 
 
465 aa  514  1e-144  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  56.66 
 
 
476 aa  513  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  55.12 
 
 
465 aa  513  1e-144  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  54.56 
 
 
470 aa  509  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2781  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  53.02 
 
 
497 aa  510  1e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.662826  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.96 
 
 
480 aa  509  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0820  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  56.49 
 
 
466 aa  509  1e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  54.89 
 
 
469 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3635  putative oxidoreductase  55.58 
 
 
476 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000713283  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  54.26 
 
 
469 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1250  putative oxidoreductase  56.01 
 
 
476 aa  502  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  55.01 
 
 
457 aa  504  1e-141  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  55.86 
 
 
463 aa  500  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2934  putative oxidoreductase  59.29 
 
 
459 aa  495  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.912851  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1984  putative oxidoreductase  56.04 
 
 
473 aa  495  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.292785  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.76 
 
 
474 aa  489  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0938  putative oxidoreductase  55.36 
 
 
481 aa  488  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  54.8 
 
 
468 aa  485  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0766  putative oxidoreductase  55.51 
 
 
476 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  54.8 
 
 
468 aa  483  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  52.94 
 
 
465 aa  474  1e-132  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  51.98 
 
 
467 aa  474  1e-132  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  55.9 
 
 
447 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0337  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  53.06 
 
 
467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1111  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  53.93 
 
 
469 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  52.47 
 
 
464 aa  467  9.999999999999999e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  51.9 
 
 
994 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0313  putative oxidoreductase  53.05 
 
 
473 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1112  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  54.42 
 
 
446 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1900  putative bifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta  53.88 
 
 
747 aa  460  9.999999999999999e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22072  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.99 
 
 
458 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  52.15 
 
 
476 aa  460  9.999999999999999e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  51.47 
 
 
1005 aa  458  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  51.94 
 
 
1008 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  51.72 
 
 
1011 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  51.82 
 
 
1011 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  51.72 
 
 
477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  52.93 
 
 
448 aa  450  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  51.79 
 
 
447 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0745  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  51.97 
 
 
994 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375637  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1069  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  45.53 
 
 
465 aa  363  3e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000858078  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3208  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  43.66 
 
 
947 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.950859  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0850  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  43.76 
 
 
942 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0958  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  43.53 
 
 
944 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.6 
 
 
483 aa  352  1e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5203  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  43.18 
 
 
944 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0703  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  42.62 
 
 
944 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2764  glutamate synthase subunit beta  39.19 
 
 
469 aa  333  6e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.28 
 
 
438 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  37.5 
 
 
470 aa  320  5e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3019  glutamate synthase subunit beta  38.97 
 
 
468 aa  316  8e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0877  glutamate synthase, small subunit  38.34 
 
 
465 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.44066  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0729  glutamate synthase, small subunit  38.34 
 
 
465 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  39.46 
 
 
472 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  39.46 
 
 
472 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  39.46 
 
 
472 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0404  glutamate synthase subunit beta  37.34 
 
 
472 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0157845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5772  glutamate synthase subunit beta  38.58 
 
 
477 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0616  glutamate synthase subunit beta  37.89 
 
 
472 aa  310  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  39.47 
 
 
465 aa  310  5e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2682  glutamate synthase subunit beta  36.63 
 
 
483 aa  309  9e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.287891 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1933  glutamate synthase, small subunit  37.47 
 
 
469 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.889564  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.82 
 
 
996 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  39.01 
 
 
472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  41.57 
 
 
699 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45200  glutamate synthase subunit beta  39.01 
 
 
473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66560  glutamate synthase subunit beta  38.15 
 
 
477 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0271  glutamate synthase, small subunit  37.98 
 
 
467 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0925346 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0551  glutamate synthase subunit beta  38.34 
 
 
472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592463 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3509  glutamate synthase subunit beta  37.89 
 
 
472 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0414  glutamate synthase subunit beta  39.01 
 
 
472 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03029  hypothetical protein  37.89 
 
 
472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>