More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2764 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0271  glutamate synthase, small subunit  77.56 
 
 
467 aa  744    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0925346 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03078  glutamate synthase, 4Fe-4S protein, small subunit  64.04 
 
 
472 aa  639    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0494  glutamate synthase, small subunit  64.26 
 
 
472 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  72.71 
 
 
472 aa  721    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3557  glutamate synthase subunit beta  64.26 
 
 
472 aa  640    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1324  glutamate synthase subunit beta  66.24 
 
 
468 aa  651    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5121  glutamate synthase, small subunit  73.35 
 
 
472 aa  722    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1177  glutamate synthase subunit beta  65.88 
 
 
468 aa  647    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.407199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0412  glutamate synthase subunit beta  73.56 
 
 
472 aa  724    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1873  glutamate synthase subunit beta  69.36 
 
 
473 aa  684    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1254  glutamate synthase subunit beta  66.31 
 
 
468 aa  650    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.55842 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1125  glutamate synthase subunit beta  64.82 
 
 
469 aa  639    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2768  glutamate synthase subunit beta  68.94 
 
 
481 aa  686    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.407102  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01630  glutamate synthase subunit beta  69.94 
 
 
471 aa  669    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0414  glutamate synthase subunit beta  73.56 
 
 
472 aa  726    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1220  glutamate synthase subunit beta  64.18 
 
 
469 aa  634    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1012  glutamate synthase subunit beta  64.61 
 
 
469 aa  635    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03029  hypothetical protein  64.04 
 
 
472 aa  639    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0551  glutamate synthase subunit beta  74.2 
 
 
472 aa  731    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592463 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0404  glutamate synthase subunit beta  69.36 
 
 
472 aa  681    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0157845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  72.71 
 
 
472 aa  721    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2682  glutamate synthase subunit beta  72.49 
 
 
483 aa  712    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.287891 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1221  glutamate synthase subunit beta  66.31 
 
 
468 aa  647    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3406  glutamate synthase subunit beta  64.04 
 
 
472 aa  639    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2791  glutamate synthase subunit beta  64.39 
 
 
485 aa  634    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0616  glutamate synthase subunit beta  71.86 
 
 
472 aa  711    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2164  glutamate synthase subunit beta  69.36 
 
 
473 aa  686    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0515227  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  72.92 
 
 
472 aa  722    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  72.71 
 
 
472 aa  721    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3019  glutamate synthase subunit beta  81.24 
 
 
468 aa  799    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5772  glutamate synthase subunit beta  72.92 
 
 
477 aa  728    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3749  glutamate synthase subunit beta  69.3 
 
 
471 aa  664    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45200  glutamate synthase subunit beta  74.36 
 
 
473 aa  726    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2873  glutamate synthase subunit beta  66.03 
 
 
468 aa  651    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0110656 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2955  glutamate synthase subunit beta  65.81 
 
 
468 aa  649    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2764  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 
469 aa  958    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1933  glutamate synthase, small subunit  72.34 
 
 
469 aa  708    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.889564  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66560  glutamate synthase subunit beta  73.35 
 
 
477 aa  731    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0487  glutamate synthase subunit beta  64.04 
 
 
472 aa  639    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3051  glutamate synthase subunit beta  65.81 
 
 
468 aa  650    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3136  glutamate synthase subunit beta  66.31 
 
 
468 aa  650    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.632002 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4536  glutamate synthase subunit beta  64.26 
 
 
472 aa  640    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0856  glutamate synthase subunit beta  65.88 
 
 
472 aa  659    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3792  glutamate synthase subunit beta  64.04 
 
 
472 aa  635    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0835  glutamate synthase subunit beta  73.13 
 
 
472 aa  728    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.387522  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4113  glutamate synthase, small subunit  71.06 
 
 
473 aa  704    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116897 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3701  glutamate synthase subunit beta  64.26 
 
 
472 aa  640    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1135  glutamate synthase subunit beta  65.81 
 
 
468 aa  647    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1057  glutamate synthase subunit beta  76.5 
 
 
469 aa  739    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3509  glutamate synthase subunit beta  64.47 
 
 
472 aa  644    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1031  glutamate synthase subunit beta  64.82 
 
 
469 aa  638    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.473013  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3691  glutamate synthase subunit beta  63.4 
 
 
472 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.752822  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3657  glutamate synthase subunit beta  63.62 
 
 
472 aa  632  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3629  glutamate synthase subunit beta  63.4 
 
 
472 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.344291 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3522  glutamate synthase subunit beta  63.4 
 
 
472 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0298  glutamate synthase subunit beta  64.26 
 
 
472 aa  632  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2952  glutamate synthase subunit beta  63.68 
 
 
468 aa  634  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3593  glutamate synthase subunit beta  63.4 
 
 
472 aa  631  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0529  glutamate synthase subunit beta  63.19 
 
 
472 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0304  glutamate synthase subunit beta  63.83 
 
 
472 aa  629  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3634  glutamate synthase subunit beta  63.62 
 
 
472 aa  629  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137963  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4345  glutamate synthase subunit beta  62.98 
 
 
472 aa  628  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0056621  hitchhiker  0.00954543 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0465  glutamate synthase subunit beta  63.19 
 
 
472 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000235827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3524  glutamate synthase subunit beta  63.19 
 
 
472 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004469  glutamate synthase [NADPH] small chain  66.6 
 
 
470 aa  628  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1129  glutamate synthase subunit beta  62.98 
 
 
472 aa  628  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0513615  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0877  glutamate synthase, small subunit  64.03 
 
 
465 aa  623  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.44066  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  64.97 
 
 
470 aa  624  1e-177  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0729  glutamate synthase, small subunit  64.03 
 
 
465 aa  623  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00925  glutamate synthase subunit beta  66.38 
 
 
470 aa  624  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1955  glutamate synthase subunit beta  66.31 
 
 
471 aa  621  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4502  glutamate synthase subunit beta  63.06 
 
 
475 aa  611  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  59.44 
 
 
667 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  58.28 
 
 
671 aa  568  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3684  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  58.81 
 
 
671 aa  568  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0731  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  58.81 
 
 
652 aa  569  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.272693  normal  0.130877 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  58.79 
 
 
674 aa  565  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3831  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  58.6 
 
 
671 aa  567  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  58.87 
 
 
658 aa  564  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  56.75 
 
 
659 aa  558  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  58.13 
 
 
674 aa  561  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  56.54 
 
 
659 aa  558  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  56.75 
 
 
659 aa  558  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  56.75 
 
 
659 aa  558  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  57.92 
 
 
653 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  56.75 
 
 
659 aa  558  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  56.75 
 
 
659 aa  558  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  57.7 
 
 
653 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  57.7 
 
 
653 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  56.75 
 
 
659 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  56.75 
 
 
659 aa  558  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2623  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  57.48 
 
 
653 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2845  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  57.7 
 
 
653 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2165  glutamate synthase subunit beta  58.13 
 
 
513 aa  544  1e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2257  glutamate synthase subunit beta  57.92 
 
 
513 aa  541  1e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000664143  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0063  glutamate synthase subunit beta  57.11 
 
 
481 aa  543  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03318  glutamate synthase subunit beta  58.71 
 
 
493 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0806  glutamate synthase, small subunit  57.11 
 
 
639 aa  525  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0822  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  57.33 
 
 
639 aa  526  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3046  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  57.11 
 
 
639 aa  523  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>