More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4152 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2861  glutamate synthase subunit beta  69.34 
 
 		 455 aa  639    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0966  glutamate synthase subunit beta  72.84 
 
 		 451 aa  654    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4152  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 		 477 aa  952    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0044  glutamate synthase subunit beta  62.34 
 
 		 472 aa  557  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2360  putative oxidoreductase  55.77 
 
 		 453 aa  502  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4019  putative oxidoreductase  59.14 
 
 		 448 aa  501  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3280  putative oxidoreductase  56.25 
 
 		 453 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0565301 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3028  putative oxidoreductase  55.82 
 
 		 453 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00065642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0297  putative oxidoreductase  54.41 
 
 		 498 aa  479  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.284933  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0283  putative oxidoreductase  54.41 
 
 		 501 aa  478  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0366  putative oxidoreductase  51.47 
 
 		 500 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3448  putative oxidoreductase  52.69 
 
 		 475 aa  465  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0584145  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2198  putative oxidoreductase  55.72 
 
 		 440 aa  465  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1362  putative oxidoreductase  52.67 
 
 		 445 aa  462  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2057  putative oxidoreductase  54.04 
 
 		 450 aa  462  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0749543  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2713  putative oxidoreductase  53.03 
 
 		 446 aa  455  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1428  putative oxidoreductase  55.38 
 
 		 449 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0189  putative oxidoreductase  56.02 
 
 		 445 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2690  putative oxidoreductase  54.73 
 
 		 449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1822  glutamate synthase subunit beta  56.02 
 
 		 443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3442  putative oxidoreductase  53.58 
 
 		 481 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4037  putative oxidoreductase  54.23 
 
 		 455 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.239048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1835  putative oxidoreductase  53.8 
 
 		 455 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1456  putative oxidoreductase  55.36 
 
 		 443 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1801  putative oxidoreductase  54.01 
 
 		 478 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1596  putative oxidoreductase  54.43 
 
 		 445 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6235  putative oxidoreductase  54.43 
 
 		 445 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391718  normal  0.166247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3639  putative oxidoreductase  53.58 
 
 		 455 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6711  putative oxidoreductase  54.43 
 
 		 445 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717012  normal  0.546311 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5722  putative oxidoreductase  54.43 
 
 		 445 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1535  putative oxidoreductase  54.53 
 
 		 449 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1501  putative oxidoreductase  51.6 
 
 		 444 aa  436  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0542  putative oxidoreductase  53.8 
 
 		 455 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5966  putative oxidoreductase  54.41 
 
 		 445 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.592617 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6655  putative oxidoreductase  52.97 
 
 		 445 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.0132597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05750  putative oxidoreductase  53.36 
 
 		 455 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5350  putative oxidoreductase  54.41 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.236159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6036  putative oxidoreductase  51.56 
 
 		 455 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3447  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.18 
 
 		 453 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00401797  normal  0.0849799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1890  FAD dependent oxidoreductase  42.76 
 
 		 440 aa  313  2.9999999999999996e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00119586  hitchhiker  0.00883124 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2109  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  41.98 
 
 		 445 aa  311  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  39.01 
 
 		 465 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0262  putative oxidoreductase  35.61 
 
 		 462 aa  286  8e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2582  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.31 
 
 		 457 aa  261  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.82 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.5 
 
 		 466 aa  226  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  34.75 
 
 		 468 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  33.62 
 
 		 464 aa  223  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.71 
 
 		 469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  36.28 
 
 		 653 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.61 
 
 		 480 aa  221  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  35.98 
 
 		 470 aa  219  7e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  35.29 
 
 		 654 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.55 
 
 		 464 aa  219  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  36.38 
 
 		 463 aa  217  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  35.31 
 
 		 470 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  34.32 
 
 		 469 aa  216  8e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  33.76 
 
 		 468 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  33.26 
 
 		 480 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1112  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  36.19 
 
 		 446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.89 
 
 		 476 aa  213  7e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  33.63 
 
 		 658 aa  213  7e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.98 
 
 		 448 aa  212  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.06 
 
 		 447 aa  211  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.12 
 
 		 465 aa  210  6e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  35.32 
 
 		 465 aa  209  6e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  33.54 
 
 		 468 aa  209  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.05 
 
 		 447 aa  209  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.44 
 
 		 479 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  33.47 
 
 		 483 aa  207  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.54 
 
 		 463 aa  207  4e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  35 
 
 		 469 aa  207  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.43 
 
 		 483 aa  207  5e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.15 
 
 		 1406 aa  206  6e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  33.05 
 
 		 455 aa  206  9e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.23 
 
 		 996 aa  206  9e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  32.99 
 
 		 471 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.48 
 
 		 476 aa  205  1e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.01 
 
 		 1126 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  34.04 
 
 		 465 aa  205  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  34.62 
 
 		 653 aa  205  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  34.58 
 
 		 469 aa  204  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  32.21 
 
 		 482 aa  204  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.54 
 
 		 465 aa  203  5e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.46 
 
 		 458 aa  203  5e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  33.4 
 
 		 480 aa  202  8e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0856  glutamate synthase subunit beta  34.12 
 
 		 472 aa  202  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  34.67 
 
 		 699 aa  202  9e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.77 
 
 		 761 aa  202  9e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.97 
 
 		 466 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1933  glutamate synthase, small subunit  33.4 
 
 		 469 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.889564  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  32.91 
 
 		 477 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1031  glutamate synthase subunit beta  33.83 
 
 		 469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.473013  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  33.47 
 
 		 469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0877  glutamate synthase, small subunit  36.62 
 
 		 465 aa  201  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.44066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0729  glutamate synthase, small subunit  36.62 
 
 		 465 aa  201  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  33.26 
 
 		 469 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  31.87 
 
 		 482 aa  200  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.74 
 
 		 463 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1310  putative oxidoreductase  32.66 
 
 		 413 aa  199  7.999999999999999e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>