More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1737 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  100 
 
 		 654 aa  1315    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  56.29 
 
 		 653 aa  727    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0447  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  56.62 
 
 		 656 aa  721    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  51.45 
 
 		 653 aa  668    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0418  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  53.06 
 
 		 653 aa  667    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  56.75 
 
 		 658 aa  724    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0413  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  53.36 
 
 		 659 aa  678    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.933547  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  40.31 
 
 		 1073 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.28 
 
 		 996 aa  450  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  39.19 
 
 		 1150 aa  433  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.33 
 
 		 1406 aa  423  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.07 
 
 		 1424 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.22 
 
 		 1410 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  37.11 
 
 		 688 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  36.89 
 
 		 1385 aa  413  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.74 
 
 		 1440 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.81 
 
 		 1426 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.18 
 
 		 1440 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.49 
 
 		 1428 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.14 
 
 		 1425 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.3 
 
 		 1425 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.58 
 
 		 1432 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.69 
 
 		 1432 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.82 
 
 		 1421 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.99 
 
 		 1425 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  36.42 
 
 		 1412 aa  391  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.57 
 
 		 1432 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  43.21 
 
 		 493 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.91 
 
 		 1126 aa  361  3e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  36.23 
 
 		 1387 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  39.58 
 
 		 699 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.44 
 
 		 555 aa  314  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.63 
 
 		 1487 aa  296  8e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.26 
 
 		 895 aa  294  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1855  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.31 
 
 		 579 aa  293  6e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0230589  normal  0.0943361 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.14 
 
 		 1480 aa  290  8e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.933284 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1594  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.94 
 
 		 609 aa  288  2.9999999999999996e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2503  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.51 
 
 		 663 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.51 
 
 		 891 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.89 
 
 		 466 aa  282  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2314  respiratory-chain NADH dehydrogenase, 51 kDa subunit  38.57 
 
 		 707 aa  281  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0653639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.5 
 
 		 1481 aa  281  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  40.59 
 
 		 465 aa  280  8e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  41.4 
 
 		 463 aa  280  9e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  38.1 
 
 		 482 aa  279  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2986  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.59 
 
 		 552 aa  278  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144587 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  39.29 
 
 		 476 aa  278  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  41.69 
 
 		 470 aa  276  6e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.23 
 
 		 914 aa  275  3e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0770  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  38.38 
 
 		 546 aa  275  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.67 
 
 		 469 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  38.72 
 
 		 464 aa  272  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  39.16 
 
 		 480 aa  271  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  39.44 
 
 		 477 aa  272  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.24 
 
 		 479 aa  272  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0659  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.03 
 
 		 670 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.28 
 
 		 612 aa  271  2.9999999999999997e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  39.76 
 
 		 468 aa  271  4e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  38.82 
 
 		 483 aa  271  4e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  40.23 
 
 		 471 aa  270  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  39.01 
 
 		 482 aa  270  5e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  38.79 
 
 		 469 aa  270  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  40.14 
 
 		 469 aa  269  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  40.14 
 
 		 469 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6307  putative 2-ketoglutarate  33.16 
 
 		 599 aa  267  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.747625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.27 
 
 		 464 aa  267  5e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  42.02 
 
 		 463 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0510  Fe(III) reductase, beta subunit  35.03 
 
 		 672 aa  266  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  38.26 
 
 		 480 aa  265  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  39 
 
 		 468 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  39.11 
 
 		 455 aa  265  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4866  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.61 
 
 		 559 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0672  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.44 
 
 		 670 aa  265  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0858799999999997e-27 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.72 
 
 		 457 aa  265  2e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4955  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.61 
 
 		 559 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.14 
 
 		 467 aa  264  3e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  38.3 
 
 		 468 aa  265  3e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.48 
 
 		 466 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5234  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.4 
 
 		 558 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.542472  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  39.05 
 
 		 470 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  38.7 
 
 		 469 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3023  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.71 
 
 		 672 aa  260  6e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1543  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.03 
 
 		 618 aa  259  9e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4108  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.4 
 
 		 543 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112813  normal  0.10156 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2274  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.57 
 
 		 542 aa  258  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0531449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3235  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.84 
 
 		 596 aa  257  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  38.46 
 
 		 469 aa  257  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  37.61 
 
 		 503 aa  257  5e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2152  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.24 
 
 		 571 aa  257  6e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000764519 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.08 
 
 		 465 aa  254  3e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00210  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.81 
 
 		 612 aa  254  3e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.301732 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0977  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.67 
 
 		 1105 aa  254  3e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000028046  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2800  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.2 
 
 		 608 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  36.87 
 
 		 465 aa  253  1e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.71 
 
 		 761 aa  253  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  36.78 
 
 		 465 aa  252  1e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.53 
 
 		 464 aa  253  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.08 
 
 		 465 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  37.56 
 
 		 468 aa  250  5e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.23 
 
 		 461 aa  250  6e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>