More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0418 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  53.06 
 
 
654 aa  679    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  52.99 
 
 
653 aa  688    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0418  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  100 
 
 
653 aa  1329    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  58.84 
 
 
658 aa  768    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  60.06 
 
 
653 aa  790    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0447  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  55.05 
 
 
656 aa  700    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0413  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  57.03 
 
 
659 aa  724    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.933547  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  40.9 
 
 
1150 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.97 
 
 
996 aa  492  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  41.28 
 
 
1073 aa  479  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  41.52 
 
 
688 aa  464  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.5 
 
 
1440 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.09 
 
 
1406 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.78 
 
 
1410 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.7 
 
 
1426 aa  435  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  38.37 
 
 
1412 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  38.93 
 
 
1385 aa  428  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  45 
 
 
493 aa  422  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.67 
 
 
1440 aa  415  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.18 
 
 
1424 aa  414  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.79 
 
 
1425 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.18 
 
 
1421 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.18 
 
 
1425 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.18 
 
 
1425 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.89 
 
 
1428 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.57 
 
 
1432 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.97 
 
 
1432 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.55 
 
 
1432 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  39 
 
 
1387 aa  395  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.29 
 
 
1126 aa  345  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  42.34 
 
 
699 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2314  respiratory-chain NADH dehydrogenase, 51 kDa subunit  41.2 
 
 
707 aa  324  3e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0653639  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.12 
 
 
555 aa  324  3e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  46.45 
 
 
463 aa  322  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  44.05 
 
 
469 aa  319  9e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2503  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.82 
 
 
663 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  45.02 
 
 
464 aa  314  3.9999999999999997e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  44.39 
 
 
479 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.32 
 
 
1480 aa  310  5e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.933284 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  43.59 
 
 
466 aa  308  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  43.88 
 
 
465 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  43.41 
 
 
465 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  42.93 
 
 
465 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  42.42 
 
 
464 aa  302  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  42.96 
 
 
455 aa  301  2e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.53 
 
 
914 aa  300  4e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1855  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.59 
 
 
579 aa  299  9e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0230589  normal  0.0943361 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.67 
 
 
1487 aa  299  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.88 
 
 
891 aa  298  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0659  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.45 
 
 
670 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0510  Fe(III) reductase, beta subunit  39.92 
 
 
672 aa  298  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0672  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.25 
 
 
670 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0858799999999997e-27 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2152  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  37.18 
 
 
571 aa  295  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000764519 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  43.19 
 
 
468 aa  294  4e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  44.31 
 
 
463 aa  293  6e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  42.62 
 
 
466 aa  293  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  43.5 
 
 
470 aa  292  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2184  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  38.1 
 
 
541 aa  291  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.544077  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  42.69 
 
 
469 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  41.74 
 
 
476 aa  290  4e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  42.32 
 
 
468 aa  289  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  43.03 
 
 
469 aa  289  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  42.76 
 
 
470 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3023  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.69 
 
 
672 aa  288  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  42.45 
 
 
468 aa  288  2e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0770  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.01 
 
 
546 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  43.09 
 
 
477 aa  287  5.999999999999999e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  42.03 
 
 
483 aa  286  7e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  43.26 
 
 
482 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2274  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  37.83 
 
 
542 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0531449  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.09 
 
 
457 aa  282  1e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.04 
 
 
895 aa  281  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.95 
 
 
1481 aa  281  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.61 
 
 
761 aa  281  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  44.55 
 
 
469 aa  280  5e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2986  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35 
 
 
552 aa  280  6e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144587 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  41.59 
 
 
480 aa  280  8e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  40.28 
 
 
503 aa  279  1e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3635  putative oxidoreductase  42.69 
 
 
476 aa  278  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000713283  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  42.08 
 
 
480 aa  278  3e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.24 
 
 
464 aa  278  3e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  40.51 
 
 
482 aa  278  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  39.67 
 
 
465 aa  277  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  42.07 
 
 
467 aa  276  8e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  42.4 
 
 
458 aa  276  8e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1383  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.78 
 
 
673 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  42.25 
 
 
474 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4108  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.4 
 
 
543 aa  274  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112813  normal  0.10156 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.39 
 
 
612 aa  273  5.000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.05 
 
 
476 aa  273  9e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.9 
 
 
461 aa  272  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  42.72 
 
 
463 aa  272  2e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1543  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.25 
 
 
618 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2934  putative oxidoreductase  43.36 
 
 
459 aa  271  4e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.912851  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  39.21 
 
 
468 aa  271  4e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.95 
 
 
480 aa  270  5e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16540  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.82 
 
 
612 aa  270  5.9999999999999995e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000430303  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  40.66 
 
 
462 aa  269  1e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5234  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.23 
 
 
558 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.542472  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0766  putative oxidoreductase  42.73 
 
 
476 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0956688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>