More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16540 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  66.83 
 
 
612 aa  848    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00210  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  64.09 
 
 
612 aa  781    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.301732 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2250  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  62.58 
 
 
617 aa  746    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16540  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  100 
 
 
612 aa  1242    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000430303  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1594  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  45.35 
 
 
609 aa  536  1e-151  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  37.47 
 
 
1150 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2503  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.92 
 
 
663 aa  293  8e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.34 
 
 
996 aa  290  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  39.9 
 
 
493 aa  280  5e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  36.97 
 
 
653 aa  280  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  37.37 
 
 
699 aa  279  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0418  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  36.82 
 
 
653 aa  257  5e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0138  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.22 
 
 
663 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  35.98 
 
 
658 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1543  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.08 
 
 
618 aa  253  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.33 
 
 
1426 aa  251  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  32.8 
 
 
653 aa  250  4e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  34.38 
 
 
654 aa  250  7e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.54 
 
 
1410 aa  248  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.74 
 
 
1126 aa  246  8e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  33.02 
 
 
1412 aa  246  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.7 
 
 
1440 aa  244  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.2 
 
 
1424 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.22 
 
 
1425 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.81 
 
 
1425 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.48 
 
 
1440 aa  242  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.67 
 
 
1421 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.81 
 
 
1425 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.23 
 
 
914 aa  241  2.9999999999999997e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  32.81 
 
 
1385 aa  240  5.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.29 
 
 
1406 aa  239  8e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0447  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  34.23 
 
 
656 aa  239  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.13 
 
 
1432 aa  239  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  36.01 
 
 
1073 aa  239  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0423  selenate reductase YgfK  35.64 
 
 
1075 aa  239  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.8 
 
 
1428 aa  238  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.13 
 
 
1432 aa  237  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.14 
 
 
895 aa  236  9e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  38.01 
 
 
469 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  34.64 
 
 
688 aa  236  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0770  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.78 
 
 
546 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0413  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  34.66 
 
 
659 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.933547  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1383  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.59 
 
 
673 aa  234  3e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2986  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.89 
 
 
552 aa  234  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144587 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.08 
 
 
1481 aa  234  5e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.53 
 
 
1432 aa  234  5e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  36.6 
 
 
470 aa  232  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  32.63 
 
 
1387 aa  232  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2274  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.87 
 
 
542 aa  231  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0531449  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33 
 
 
891 aa  231  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.63 
 
 
466 aa  230  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  39.51 
 
 
469 aa  230  6e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.17 
 
 
469 aa  230  7e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2314  respiratory-chain NADH dehydrogenase, 51 kDa subunit  30.35 
 
 
707 aa  229  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0653639  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2184  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.26 
 
 
541 aa  228  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.544077  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4866  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.48 
 
 
559 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4955  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.48 
 
 
559 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5234  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.05 
 
 
558 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.542472  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0510  Fe(III) reductase, beta subunit  30.11 
 
 
672 aa  227  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.41 
 
 
761 aa  226  7e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.92 
 
 
1480 aa  226  8e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.933284 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3023  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.48 
 
 
672 aa  226  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.68 
 
 
1487 aa  226  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.21 
 
 
555 aa  226  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  35.42 
 
 
464 aa  225  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4108  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.59 
 
 
543 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112813  normal  0.10156 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.27 
 
 
448 aa  224  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.51 
 
 
457 aa  224  4e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  34.96 
 
 
455 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  35.48 
 
 
468 aa  221  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  36.71 
 
 
470 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  34.93 
 
 
471 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  35.48 
 
 
469 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0977  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.7 
 
 
1105 aa  220  7.999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000028046  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  35.07 
 
 
468 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  35.07 
 
 
468 aa  219  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6307  putative 2-ketoglutarate  32.99 
 
 
599 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.747625  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  35.8 
 
 
463 aa  217  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  34.19 
 
 
482 aa  217  5e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  35.24 
 
 
468 aa  216  7e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.51 
 
 
464 aa  216  9e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  34.2 
 
 
477 aa  216  9e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.8 
 
 
476 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  33.87 
 
 
465 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.84 
 
 
479 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  34.05 
 
 
480 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.21 
 
 
465 aa  214  4.9999999999999996e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  34.53 
 
 
480 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0130  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.61 
 
 
578 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2152  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.16 
 
 
571 aa  213  7.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000764519 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1855  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.69 
 
 
579 aa  212  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0230589  normal  0.0943361 
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  33.41 
 
 
465 aa  211  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0659  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.05 
 
 
670 aa  212  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.64 
 
 
465 aa  211  4e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0672  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.87 
 
 
670 aa  211  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0858799999999997e-27 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4019  putative oxidoreductase  35.18 
 
 
448 aa  210  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.54 
 
 
463 aa  209  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1954  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.55 
 
 
579 aa  209  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.151886  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.52 
 
 
483 aa  209  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2319  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.4 
 
 
578 aa  207  4e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000648814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>