More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2986 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5234  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  58.81 
 
 
558 aa  645    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.542472  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0770  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  65.86 
 
 
546 aa  746    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2986  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  100 
 
 
552 aa  1135    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4866  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  58.63 
 
 
559 aa  645    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2274  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  56.67 
 
 
542 aa  645    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0531449  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4955  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  58.63 
 
 
559 aa  645    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4108  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  59.63 
 
 
543 aa  664    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112813  normal  0.10156 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2184  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  54.79 
 
 
541 aa  610  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.544077  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2152  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  53.45 
 
 
571 aa  599  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000764519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2358  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  54.1 
 
 
544 aa  552  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0703  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  50.1 
 
 
543 aa  513  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0130  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.72 
 
 
578 aa  326  9e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0696  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.35 
 
 
577 aa  325  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0031  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  38.08 
 
 
578 aa  323  5e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.43195 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2319  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.86 
 
 
578 aa  320  5e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000648814  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0038  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.3 
 
 
578 aa  318  1e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.093726  normal  0.0842207 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1954  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.26 
 
 
579 aa  311  1e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.151886  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1855  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.56 
 
 
579 aa  311  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0230589  normal  0.0943361 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.4 
 
 
1481 aa  294  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  37.53 
 
 
658 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2158  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.84 
 
 
585 aa  282  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.625717  normal  0.662886 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  36.59 
 
 
654 aa  278  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  33.94 
 
 
688 aa  277  4e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.35 
 
 
1487 aa  276  8e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.3 
 
 
1126 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  32.94 
 
 
1150 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  38.57 
 
 
1073 aa  273  5.000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.3 
 
 
996 aa  273  7e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  35.75 
 
 
653 aa  269  8.999999999999999e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2193  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.93 
 
 
648 aa  266  7e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.119268  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0418  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  35 
 
 
653 aa  266  7e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  34.83 
 
 
653 aa  258  3e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.07 
 
 
1480 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.933284 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  35.2 
 
 
699 aa  256  5e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1959  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.71 
 
 
647 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1661  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.34 
 
 
648 aa  253  8.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.950377  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0977  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.88 
 
 
1105 aa  250  5e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000028046  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2477  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.66 
 
 
653 aa  249  8e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0447  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  36.87 
 
 
656 aa  249  8e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0423  selenate reductase YgfK  35.95 
 
 
1075 aa  246  9e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.06 
 
 
1426 aa  243  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.56 
 
 
479 aa  237  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.87 
 
 
1410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  37.69 
 
 
493 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.3 
 
 
891 aa  234  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2159  glutamate synthase alpha subunit  30.2 
 
 
771 aa  234  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681462  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16540  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.89 
 
 
612 aa  234  4.0000000000000004e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000430303  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  37.02 
 
 
463 aa  234  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0413  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  32.44 
 
 
659 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.933547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2600  glutamate synthase, alpha subunit-like  31.49 
 
 
771 aa  233  5e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.73 
 
 
555 aa  231  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.47 
 
 
476 aa  231  3e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.44 
 
 
612 aa  230  4e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1594  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.33 
 
 
609 aa  229  8e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.29 
 
 
614 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.31 
 
 
1440 aa  229  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2314  respiratory-chain NADH dehydrogenase, 51 kDa subunit  34.52 
 
 
707 aa  228  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0653639  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  35.1 
 
 
464 aa  228  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.88 
 
 
895 aa  228  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.75 
 
 
652 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.931627 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.56 
 
 
1424 aa  227  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  30.7 
 
 
1387 aa  227  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00210  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.19 
 
 
612 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.301732 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2503  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.08 
 
 
663 aa  226  7e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  30.44 
 
 
1412 aa  226  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6307  putative 2-ketoglutarate  30.66 
 
 
599 aa  226  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.747625  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.02 
 
 
464 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.6 
 
 
914 aa  223  6e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3023  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.68 
 
 
672 aa  223  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.39 
 
 
1425 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  30.66 
 
 
1385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.51 
 
 
1425 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.01 
 
 
1428 aa  221  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0659  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.49 
 
 
670 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.22 
 
 
1421 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.2 
 
 
1432 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0510  Fe(III) reductase, beta subunit  32.74 
 
 
672 aa  220  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.2 
 
 
1432 aa  220  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.34 
 
 
1425 aa  220  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2118  FAD dependent oxidoreductase  30.92 
 
 
615 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2800  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.88 
 
 
608 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  35.46 
 
 
468 aa  218  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0350  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.34 
 
 
598 aa  218  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.67 
 
 
476 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  35.46 
 
 
468 aa  217  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  36.63 
 
 
471 aa  217  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.14 
 
 
438 aa  216  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5479  Glutamate synthase (NADPH)  29.76 
 
 
599 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0672  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.94 
 
 
670 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0858799999999997e-27 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3235  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.9 
 
 
596 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.77 
 
 
1406 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  33.89 
 
 
462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2250  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35 
 
 
617 aa  214  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.85 
 
 
1432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1136  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.07 
 
 
598 aa  212  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.84 
 
 
1440 aa  211  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2406  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.13 
 
 
648 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0287125  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.28 
 
 
463 aa  211  3e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.73 
 
 
457 aa  210  5e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  34.29 
 
 
468 aa  210  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>