More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1855 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1855  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 579 aa  1196    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0230589  normal  0.0943361 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2319  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  41.17 
 
 		 578 aa  462  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000648814  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0130  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  41.68 
 
 		 578 aa  463  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1954  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  41.23 
 
 		 579 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.151886  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0696  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  40.58 
 
 		 577 aa  450  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0031  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  41.54 
 
 		 578 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.43195 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0038  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  40.48 
 
 		 578 aa  443  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.093726  normal  0.0842207 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2158  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  38.46 
 
 		 585 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.625717  normal  0.662886 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1661  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  37.3 
 
 		 648 aa  372  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.950377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.83 
 
 		 1126 aa  348  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1959  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.02 
 
 		 647 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2477  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.4 
 
 		 653 aa  332  8e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2193  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.91 
 
 		 648 aa  331  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.119268  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.68 
 
 		 996 aa  325  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0770  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  37.45 
 
 		 546 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.14 
 
 		 555 aa  318  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  38.64 
 
 		 658 aa  312  1e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2986  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.56 
 
 		 552 aa  311  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144587 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  37.21 
 
 		 688 aa  306  7e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2184  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.86 
 
 		 541 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.544077  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  38.13 
 
 		 653 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  38.13 
 
 		 1150 aa  302  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2152  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.75 
 
 		 571 aa  300  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000764519 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  36.67 
 
 		 1412 aa  299  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4108  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.13 
 
 		 543 aa  298  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112813  normal  0.10156 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  39.96 
 
 		 1073 aa  296  5e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4955  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.75 
 
 		 559 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4866  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.75 
 
 		 559 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.35 
 
 		 1480 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.933284 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2358  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.64 
 
 		 544 aa  294  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  40.95 
 
 		 468 aa  293  4e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  37.31 
 
 		 654 aa  293  6e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2274  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.61 
 
 		 542 aa  292  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0531449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  40.72 
 
 		 468 aa  291  2e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5234  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.56 
 
 		 558 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.542472  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.04 
 
 		 1426 aa  289  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  36.51 
 
 		 653 aa  288  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  35.98 
 
 		 1387 aa  288  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.11 
 
 		 1406 aa  288  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  41.36 
 
 		 471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  40.65 
 
 		 468 aa  288  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  45.38 
 
 		 493 aa  287  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  42.46 
 
 		 468 aa  286  5e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  44.62 
 
 		 469 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  41.36 
 
 		 470 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  40.42 
 
 		 468 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.2 
 
 		 1481 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0510  Fe(III) reductase, beta subunit  38.16 
 
 		 672 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.8 
 
 		 1440 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0418  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  39.59 
 
 		 653 aa  283  8.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  39.53 
 
 		 476 aa  282  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  44.62 
 
 		 469 aa  282  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  41.94 
 
 		 464 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.35 
 
 		 458 aa  281  3e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.13 
 
 		 1410 aa  281  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  37.72 
 
 		 699 aa  279  9e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  40.86 
 
 		 470 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3023  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.71 
 
 		 672 aa  279  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.98 
 
 		 1440 aa  278  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.37 
 
 		 464 aa  277  4e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  40.14 
 
 		 469 aa  276  6e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0659  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.24 
 
 		 670 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.32 
 
 		 464 aa  275  2.0000000000000002e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.18 
 
 		 469 aa  274  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0672  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.05 
 
 		 670 aa  272  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0858799999999997e-27 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0703  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.99 
 
 		 543 aa  272  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.3 
 
 		 467 aa  271  2e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1069  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.41 
 
 		 465 aa  271  2e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000858078  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0447  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  38.68 
 
 		 656 aa  270  4e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.95 
 
 		 463 aa  270  4e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.28 
 
 		 479 aa  270  5e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  42.54 
 
 		 465 aa  269  8.999999999999999e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  40.98 
 
 		 463 aa  269  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2934  putative oxidoreductase  41.63 
 
 		 459 aa  268  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.912851  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  42.21 
 
 		 465 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  37.67 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  40.71 
 
 		 469 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  32.24 
 
 		 1385 aa  267  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0820  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.69 
 
 		 466 aa  266  5.999999999999999e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  38.9 
 
 		 455 aa  266  7e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.57 
 
 		 483 aa  266  8e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.71 
 
 		 465 aa  266  8.999999999999999e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.67 
 
 		 466 aa  266  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  39.01 
 
 		 469 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.36 
 
 		 1428 aa  264  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  37.33 
 
 		 480 aa  264  4e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.1 
 
 		 466 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.92 
 
 		 761 aa  263  6e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0494  glutamate synthase, small subunit  39.53 
 
 		 472 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3509  glutamate synthase subunit beta  39.53 
 
 		 472 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4536  glutamate synthase subunit beta  39.53 
 
 		 472 aa  262  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  38.52 
 
 		 477 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3557  glutamate synthase subunit beta  39.53 
 
 		 472 aa  261  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.29 
 
 		 1432 aa  261  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0413  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  36.44 
 
 		 659 aa  261  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.933547  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03078  glutamate synthase, 4Fe-4S protein, small subunit  39.53 
 
 		 472 aa  260  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3406  glutamate synthase subunit beta  39.53 
 
 		 472 aa  260  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3701  glutamate synthase subunit beta  39.53 
 
 		 472 aa  260  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.81 
 
 		 465 aa  260  4e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03029  hypothetical protein  39.53 
 
 		 472 aa  260  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>