More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2358 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2184  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  61.76 
 
 
541 aa  706    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.544077  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2152  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  60.53 
 
 
571 aa  689    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000764519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2358  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  100 
 
 
544 aa  1107    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0703  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  58.12 
 
 
543 aa  608  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0770  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  55.7 
 
 
546 aa  590  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2986  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  54.1 
 
 
552 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4108  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  54.29 
 
 
543 aa  552  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112813  normal  0.10156 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2274  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  51.05 
 
 
542 aa  549  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0531449  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4866  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  53.61 
 
 
559 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4955  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  53.61 
 
 
559 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5234  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  53.23 
 
 
558 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.542472  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0130  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  37.97 
 
 
578 aa  351  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0031  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  38.24 
 
 
578 aa  338  9.999999999999999e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.43195 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0038  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  38.24 
 
 
578 aa  335  1e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.093726  normal  0.0842207 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2319  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  37.73 
 
 
578 aa  335  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000648814  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0696  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.56 
 
 
577 aa  333  4e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1954  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.38 
 
 
579 aa  333  7.000000000000001e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.151886  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1855  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.88 
 
 
579 aa  311  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0230589  normal  0.0943361 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2477  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.93 
 
 
653 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1661  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.44 
 
 
648 aa  300  6e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.950377  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2158  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.74 
 
 
585 aa  293  8e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.625717  normal  0.662886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2193  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.52 
 
 
648 aa  290  6e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.119268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  35.39 
 
 
1150 aa  281  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  35.3 
 
 
658 aa  278  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1959  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.98 
 
 
647 aa  276  5e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  36.85 
 
 
699 aa  272  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.88 
 
 
1487 aa  270  5.9999999999999995e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  36.82 
 
 
1073 aa  262  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  36.11 
 
 
1412 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0977  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.28 
 
 
1105 aa  260  4e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000028046  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0418  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  37.4 
 
 
653 aa  260  5.0000000000000005e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  34.64 
 
 
688 aa  260  6e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.67 
 
 
1426 aa  259  7e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  33.87 
 
 
654 aa  259  7e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  35.85 
 
 
1387 aa  257  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.35 
 
 
1406 aa  257  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.22 
 
 
996 aa  256  8e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.09 
 
 
1410 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.12 
 
 
1421 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.87 
 
 
1480 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.933284 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  33.74 
 
 
653 aa  251  3e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.85 
 
 
1432 aa  251  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.1 
 
 
1440 aa  250  5e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.86 
 
 
1428 aa  249  8e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.03 
 
 
1432 aa  249  8e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  33.96 
 
 
653 aa  249  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.94 
 
 
1425 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.39 
 
 
1481 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.2 
 
 
1126 aa  246  6.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.58 
 
 
1425 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.25 
 
 
1432 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.76 
 
 
1425 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.01 
 
 
1440 aa  243  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  40.05 
 
 
493 aa  240  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.58 
 
 
1424 aa  239  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  30.44 
 
 
1385 aa  235  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2503  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
663 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.01 
 
 
652 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.931627 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.53 
 
 
614 aa  234  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.84 
 
 
555 aa  233  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2314  respiratory-chain NADH dehydrogenase, 51 kDa subunit  36.74 
 
 
707 aa  233  7.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0653639  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.3 
 
 
476 aa  232  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.94 
 
 
479 aa  230  6e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  37.05 
 
 
463 aa  229  9e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0447  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  32.43 
 
 
656 aa  229  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.84 
 
 
464 aa  227  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.46 
 
 
612 aa  228  3e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.1 
 
 
463 aa  228  3e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2800  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.16 
 
 
608 aa  226  9e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5479  Glutamate synthase (NADPH)  30.76 
 
 
599 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0423  selenate reductase YgfK  34.7 
 
 
1075 aa  226  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  37.02 
 
 
471 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  35.95 
 
 
468 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0413  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  33.81 
 
 
659 aa  224  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.933547  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  33.81 
 
 
462 aa  223  6e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1067  putative glutamate synthase (NADPH)  30.45 
 
 
597 aa  223  7e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2406  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.2 
 
 
648 aa  223  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0287125  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0350  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.11 
 
 
598 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  33.04 
 
 
503 aa  221  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1552  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.84 
 
 
646 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  36.21 
 
 
470 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  33.17 
 
 
464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2118  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 
615 aa  220  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.29 
 
 
466 aa  220  6e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3235  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.45 
 
 
596 aa  219  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00210  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.61 
 
 
612 aa  219  1e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.301732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6307  putative 2-ketoglutarate  29.69 
 
 
599 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.747625  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1457  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.27 
 
 
646 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  34.51 
 
 
482 aa  218  2.9999999999999998e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  34.69 
 
 
469 aa  216  9e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1594  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.89 
 
 
609 aa  215  9.999999999999999e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  35.7 
 
 
468 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  36.15 
 
 
468 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16540  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.4 
 
 
612 aa  214  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000430303  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1136  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.99 
 
 
598 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  34.69 
 
 
994 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.36 
 
 
483 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  35.58 
 
 
469 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.93 
 
 
476 aa  213  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.23 
 
 
891 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>