More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1181 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
555 aa  1135    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.68 
 
 
1126 aa  434  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.54 
 
 
1487 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  43.86 
 
 
699 aa  375  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.93 
 
 
1480 aa  364  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.933284 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.8 
 
 
996 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.02 
 
 
1481 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  45.43 
 
 
688 aa  350  5e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  41.98 
 
 
1150 aa  349  7e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3023  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.41 
 
 
672 aa  348  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0510  Fe(III) reductase, beta subunit  44.68 
 
 
672 aa  347  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.14 
 
 
1410 aa  340  5e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.51 
 
 
1426 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0977  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.41 
 
 
1105 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000028046  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  43.95 
 
 
1412 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  42.82 
 
 
1385 aa  333  5e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.26 
 
 
1440 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.99 
 
 
1432 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3640  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.9 
 
 
672 aa  330  6e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000847513  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0659  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.95 
 
 
670 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  41.67 
 
 
493 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.99 
 
 
1432 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.8 
 
 
1432 aa  326  6e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.2 
 
 
1428 aa  326  7e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.86 
 
 
1440 aa  325  9e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2314  respiratory-chain NADH dehydrogenase, 51 kDa subunit  44.94 
 
 
707 aa  325  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0653639  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0672  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.27 
 
 
670 aa  325  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0858799999999997e-27 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  42.93 
 
 
653 aa  323  4e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  43.21 
 
 
658 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  43.6 
 
 
1387 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.97 
 
 
1424 aa  320  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  41.36 
 
 
1073 aa  321  3e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.34 
 
 
1425 aa  320  6e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.89 
 
 
1425 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1855  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.14 
 
 
579 aa  318  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0230589  normal  0.0943361 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.89 
 
 
1421 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.09 
 
 
1425 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.71 
 
 
1406 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  41.44 
 
 
654 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  42.12 
 
 
653 aa  312  9e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  42.21 
 
 
464 aa  311  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2503  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.77 
 
 
663 aa  310  4e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0418  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  44.12 
 
 
653 aa  310  5e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0660  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.69 
 
 
672 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0413  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  42.68 
 
 
659 aa  307  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.933547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  42.72 
 
 
466 aa  306  6e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  39.67 
 
 
468 aa  297  3e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  40.82 
 
 
468 aa  296  9e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40 
 
 
479 aa  295  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.02 
 
 
463 aa  294  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  38.13 
 
 
468 aa  293  8e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  38.64 
 
 
476 aa  292  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  40.72 
 
 
469 aa  292  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  40.91 
 
 
463 aa  292  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  41.16 
 
 
455 aa  292  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.97 
 
 
461 aa  292  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  40.1 
 
 
468 aa  291  2e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.45 
 
 
458 aa  291  2e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.53 
 
 
464 aa  290  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.82 
 
 
457 aa  291  3e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  40.62 
 
 
470 aa  289  7e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.05 
 
 
469 aa  289  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  39.09 
 
 
482 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  40.1 
 
 
468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  39.57 
 
 
483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  39.62 
 
 
480 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39 
 
 
761 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0447  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  41 
 
 
656 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  39.06 
 
 
482 aa  282  9e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  38.7 
 
 
469 aa  282  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.34 
 
 
476 aa  280  4e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  38.65 
 
 
469 aa  280  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  39.48 
 
 
477 aa  280  5e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.77 
 
 
464 aa  280  5e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1543  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.42 
 
 
618 aa  280  6e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.05 
 
 
465 aa  279  1e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  39.57 
 
 
480 aa  278  3e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1069  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.36 
 
 
465 aa  277  4e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000858078  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  38.01 
 
 
465 aa  276  7e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  38.81 
 
 
465 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1111  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.19 
 
 
469 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  40.91 
 
 
477 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.13 
 
 
466 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  35.44 
 
 
914 aa  274  4.0000000000000004e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.37 
 
 
895 aa  273  9e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  38.1 
 
 
465 aa  271  2e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.85 
 
 
463 aa  271  2e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2781  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.82 
 
 
497 aa  269  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.662826  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.26 
 
 
467 aa  268  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  43.13 
 
 
474 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  36.63 
 
 
470 aa  267  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0820  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.08 
 
 
466 aa  266  5.999999999999999e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1900  putative bifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta  36.99 
 
 
747 aa  265  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22072  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2205  putative oxidoreductase  39.32 
 
 
598 aa  265  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204646  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  39.29 
 
 
462 aa  263  4.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0138  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.47 
 
 
663 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.63 
 
 
891 aa  263  8.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1594  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  37.07 
 
 
609 aa  261  2e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.09 
 
 
483 aa  261  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2934  putative oxidoreductase  40.4 
 
 
459 aa  261  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.912851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>