More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1959 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2477  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  52.34 
 
 
653 aa  669    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2193  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  56.39 
 
 
648 aa  780    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.119268  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1661  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  71.91 
 
 
648 aa  978    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.950377  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1959  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  100 
 
 
647 aa  1316    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0696  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  40.51 
 
 
577 aa  442  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0031  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  40.53 
 
 
578 aa  441  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.43195 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0130  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  40.1 
 
 
578 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2319  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  40.1 
 
 
578 aa  436  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000648814  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1954  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  39.23 
 
 
579 aa  432  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.151886  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0038  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  39.62 
 
 
578 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.093726  normal  0.0842207 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2158  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  38.39 
 
 
585 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.625717  normal  0.662886 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1855  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.47 
 
 
579 aa  343  5e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0230589  normal  0.0943361 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2152  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.35 
 
 
571 aa  305  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000764519 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2184  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.79 
 
 
541 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.544077  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4866  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.51 
 
 
559 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4955  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.51 
 
 
559 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.42 
 
 
996 aa  275  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0770  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.95 
 
 
546 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5234  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.51 
 
 
558 aa  273  7e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.542472  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4108  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.6 
 
 
543 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112813  normal  0.10156 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2358  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.33 
 
 
544 aa  270  8e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0703  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.43 
 
 
543 aa  257  4e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2986  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.87 
 
 
552 aa  257  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144587 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2274  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.75 
 
 
542 aa  256  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0531449  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  31.83 
 
 
1073 aa  239  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  30.88 
 
 
654 aa  231  3e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  28.64 
 
 
653 aa  223  7e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.35 
 
 
1432 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.57 
 
 
1432 aa  220  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.17 
 
 
1432 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  29.91 
 
 
1150 aa  219  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.48 
 
 
1487 aa  219  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.82 
 
 
1428 aa  217  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.92 
 
 
1126 aa  213  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.59 
 
 
1421 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.61 
 
 
1425 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.16 
 
 
555 aa  211  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.59 
 
 
1425 aa  211  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.76 
 
 
914 aa  210  8e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.86 
 
 
1424 aa  208  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.16 
 
 
1425 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.81 
 
 
1440 aa  208  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0413  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  30.08 
 
 
659 aa  208  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.933547  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  28.22 
 
 
653 aa  204  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2600  glutamate synthase, alpha subunit-like  28.94 
 
 
771 aa  203  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.87 
 
 
1426 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  29.23 
 
 
658 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.22 
 
 
891 aa  201  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.85 
 
 
1406 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  28.51 
 
 
1412 aa  201  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  30.17 
 
 
688 aa  200  7e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  34.47 
 
 
493 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.53 
 
 
1410 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  31.85 
 
 
699 aa  195  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0447  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  29.16 
 
 
656 aa  194  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  29.07 
 
 
612 aa  193  7e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.65 
 
 
1440 aa  193  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2159  glutamate synthase alpha subunit  28.16 
 
 
771 aa  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681462  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.04 
 
 
483 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6307  putative 2-ketoglutarate  26.33 
 
 
599 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.747625  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.7 
 
 
1480 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.933284 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  28.04 
 
 
1385 aa  189  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2533  putative oxidoreductase  31.67 
 
 
413 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0200812  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2332  putative oxidoreductase  31.67 
 
 
413 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2425  putative oxidoreductase  31.45 
 
 
413 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  30.11 
 
 
1387 aa  187  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2376  putative oxidoreductase  31.45 
 
 
413 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2421  putative oxidoreductase  31.22 
 
 
413 aa  185  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.70845  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2205  putative oxidoreductase  31.67 
 
 
598 aa  184  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204646  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.54 
 
 
895 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.41 
 
 
1481 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16540  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  29.18 
 
 
612 aa  183  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000430303  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0418  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  28.57 
 
 
653 aa  182  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00210  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  29.65 
 
 
612 aa  181  4e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.301732 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  31.5 
 
 
470 aa  180  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0510  Fe(III) reductase, beta subunit  34.3 
 
 
672 aa  179  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1594  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  29.87 
 
 
609 aa  179  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  31.63 
 
 
471 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1067  putative glutamate synthase (NADPH)  27.22 
 
 
597 aa  177  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3023  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.17 
 
 
672 aa  177  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2314  respiratory-chain NADH dehydrogenase, 51 kDa subunit  33.55 
 
 
707 aa  177  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0653639  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 
652 aa  177  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.931627 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5479  Glutamate synthase (NADPH)  26.56 
 
 
599 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1310  putative oxidoreductase  29.12 
 
 
413 aa  175  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  31.87 
 
 
468 aa  172  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  31.8 
 
 
469 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0825  putative oxidoreductase  31 
 
 
412 aa  172  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2293  putative oxidoreductase  31 
 
 
412 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262467 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2250  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.12 
 
 
617 aa  172  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02075  predicted oxidoreductase  31.22 
 
 
412 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1512  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.22 
 
 
412 aa  171  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1502  putative oxidoreductase  31.22 
 
 
412 aa  171  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  31.4 
 
 
471 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02034  hypothetical protein  31.22 
 
 
412 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2800  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.64 
 
 
608 aa  171  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  30.09 
 
 
464 aa  171  6e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2441  putative oxidoreductase  31 
 
 
412 aa  170  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  31.33 
 
 
465 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3278  putative oxidoreductase  30.84 
 
 
412 aa  169  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.598108 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  30.71 
 
 
468 aa  169  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>