More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0770 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0770  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  100 
 
 
546 aa  1121    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2274  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  65.05 
 
 
542 aa  736    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0531449  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5234  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  62.27 
 
 
558 aa  686    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.542472  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2184  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  56.54 
 
 
541 aa  646    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.544077  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4866  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  62.08 
 
 
559 aa  683    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2986  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  65.86 
 
 
552 aa  746    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144587 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4955  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  62.08 
 
 
559 aa  683    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4108  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  64.76 
 
 
543 aa  726    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112813  normal  0.10156 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2152  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  54.97 
 
 
571 aa  628  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000764519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2358  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  55.24 
 
 
544 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0703  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  52.22 
 
 
543 aa  548  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2319  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.16 
 
 
578 aa  336  7e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000648814  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0031  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  37.76 
 
 
578 aa  332  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.43195 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0696  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.8 
 
 
577 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1855  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.45 
 
 
579 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0230589  normal  0.0943361 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0130  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.39 
 
 
578 aa  321  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0038  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.22 
 
 
578 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.093726  normal  0.0842207 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1954  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.45 
 
 
579 aa  307  3e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.151886  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  36.98 
 
 
688 aa  306  4.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  38.11 
 
 
658 aa  300  5e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  38.27 
 
 
1150 aa  296  8e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.9 
 
 
1487 aa  290  4e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.69 
 
 
996 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2158  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.21 
 
 
585 aa  286  8e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.625717  normal  0.662886 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  37.58 
 
 
699 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.35 
 
 
1126 aa  283  8.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  36.04 
 
 
1073 aa  277  4e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  36.59 
 
 
653 aa  277  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.74 
 
 
1481 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  38.38 
 
 
654 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0418  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  36.16 
 
 
653 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1959  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.84 
 
 
647 aa  270  4e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0413  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  36.53 
 
 
659 aa  270  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.933547  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2193  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.03 
 
 
648 aa  270  7e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.119268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.09 
 
 
1480 aa  269  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.933284 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1661  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.25 
 
 
648 aa  267  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.950377  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  36.29 
 
 
1412 aa  267  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  34.27 
 
 
653 aa  266  7e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  35.33 
 
 
1387 aa  264  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  40.81 
 
 
463 aa  262  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0977  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.44 
 
 
1105 aa  260  6e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000028046  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2477  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.49 
 
 
653 aa  259  9e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  38.86 
 
 
493 aa  256  6e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.12 
 
 
1426 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.55 
 
 
1410 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.32 
 
 
612 aa  252  1e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0447  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  36.76 
 
 
656 aa  252  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  35.59 
 
 
464 aa  248  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  31.63 
 
 
1385 aa  248  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.82 
 
 
1406 aa  247  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.65 
 
 
1440 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.35 
 
 
476 aa  246  8e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2314  respiratory-chain NADH dehydrogenase, 51 kDa subunit  37.82 
 
 
707 aa  245  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0653639  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2503  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.47 
 
 
663 aa  244  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0423  selenate reductase YgfK  35.46 
 
 
1075 aa  242  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  36.6 
 
 
468 aa  241  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  36.69 
 
 
468 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.35 
 
 
479 aa  240  5e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.11 
 
 
464 aa  239  8e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.58 
 
 
555 aa  239  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.21 
 
 
1424 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  37.71 
 
 
470 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.08 
 
 
1432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.17 
 
 
476 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16540  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.78 
 
 
612 aa  235  2.0000000000000002e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000430303  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  35.89 
 
 
468 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3235  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.65 
 
 
596 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.08 
 
 
1432 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.76 
 
 
465 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.31 
 
 
1440 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  35.97 
 
 
465 aa  233  6e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.44 
 
 
1421 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  35.82 
 
 
469 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  36.32 
 
 
469 aa  233  8.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.49 
 
 
1425 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1594  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.12 
 
 
609 aa  231  2e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2800  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.33 
 
 
608 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.63 
 
 
463 aa  231  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.13 
 
 
1425 aa  231  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.29 
 
 
652 aa  229  7e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.931627 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1067  putative glutamate synthase (NADPH)  30.88 
 
 
597 aa  229  8e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3023  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.52 
 
 
672 aa  229  9e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.66 
 
 
614 aa  229  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.08 
 
 
1425 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.37 
 
 
1432 aa  229  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.37 
 
 
1428 aa  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.32 
 
 
483 aa  228  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.26 
 
 
463 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.05 
 
 
466 aa  227  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  35.45 
 
 
482 aa  227  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.29 
 
 
891 aa  227  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  35.63 
 
 
468 aa  227  4e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0510  Fe(III) reductase, beta subunit  34.64 
 
 
672 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  35.63 
 
 
468 aa  227  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00210  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.16 
 
 
612 aa  225  1e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.301732 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  34.39 
 
 
455 aa  226  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  36.14 
 
 
471 aa  226  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  37.2 
 
 
469 aa  226  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0659  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.78 
 
 
670 aa  225  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.61 
 
 
448 aa  224  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>