More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2167 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  100 
 
 
914 aa  1889    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  62.36 
 
 
891 aa  1171    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  62.9 
 
 
895 aa  1171    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.94 
 
 
1487 aa  376  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.93 
 
 
1481 aa  341  4e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.25 
 
 
1126 aa  340  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  37.6 
 
 
1150 aa  320  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  35.64 
 
 
653 aa  298  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.05 
 
 
1480 aa  299  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.933284 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0418  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  36.53 
 
 
653 aa  295  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  36.11 
 
 
658 aa  295  3e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2406  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.57 
 
 
648 aa  294  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0287125  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.39 
 
 
652 aa  292  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.931627 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1552  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.87 
 
 
646 aa  290  7e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1457  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.05 
 
 
646 aa  290  8e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.81 
 
 
996 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  39.12 
 
 
493 aa  287  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  36.23 
 
 
654 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.44 
 
 
555 aa  285  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  34.18 
 
 
688 aa  281  5e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2503  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.18 
 
 
663 aa  279  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.65 
 
 
614 aa  278  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.32 
 
 
1410 aa  275  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  33.56 
 
 
699 aa  274  6e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2118  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 
615 aa  273  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  35.74 
 
 
1073 aa  271  2.9999999999999997e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  33.47 
 
 
653 aa  270  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.2 
 
 
1406 aa  270  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  35.55 
 
 
1385 aa  268  5e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1594  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.62 
 
 
609 aa  266  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0885  putative oxidoreductase  33.9 
 
 
612 aa  266  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1383  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.62 
 
 
673 aa  265  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0447  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  35.74 
 
 
656 aa  265  3e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  35.14 
 
 
1412 aa  265  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.9 
 
 
1440 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00210  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33 
 
 
612 aa  261  6e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.301732 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0510  Fe(III) reductase, beta subunit  34.12 
 
 
672 aa  258  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.9 
 
 
1426 aa  257  6e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1855  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.78 
 
 
579 aa  257  8e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0230589  normal  0.0943361 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.63 
 
 
612 aa  256  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.23 
 
 
1432 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1543  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.66 
 
 
618 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.95 
 
 
1425 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  34.51 
 
 
1387 aa  255  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.95 
 
 
1421 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0138  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.09 
 
 
663 aa  255  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2314  respiratory-chain NADH dehydrogenase, 51 kDa subunit  34.26 
 
 
707 aa  254  5.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0653639  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2205  putative oxidoreductase  32.85 
 
 
598 aa  254  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204646  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0413  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  33.88 
 
 
659 aa  254  5.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.933547  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.95 
 
 
1425 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.95 
 
 
1425 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1222  putative oxidoreductase  34.08 
 
 
616 aa  253  1e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  39 
 
 
1432 aa  253  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.76 
 
 
1432 aa  253  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0350  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.4 
 
 
598 aa  252  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6307  putative 2-ketoglutarate  33.66 
 
 
599 aa  251  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.747625  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.23 
 
 
1440 aa  251  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.48 
 
 
1428 aa  251  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0977  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.29 
 
 
1105 aa  249  2e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000028046  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16540  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.23 
 
 
612 aa  249  2e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000430303  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.19 
 
 
1424 aa  248  4e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3023  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.93 
 
 
672 aa  247  8e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.65 
 
 
464 aa  241  5e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3235  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.04 
 
 
596 aa  240  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2250  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.51 
 
 
617 aa  240  8e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2319  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.69 
 
 
578 aa  239  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000648814  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0130  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.7 
 
 
578 aa  239  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0659  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.42 
 
 
670 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2152  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  29.34 
 
 
571 aa  236  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000764519 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2800  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.08 
 
 
608 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1067  putative glutamate synthase (NADPH)  31.16 
 
 
597 aa  234  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.29 
 
 
476 aa  234  6e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1954  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.95 
 
 
579 aa  233  8.000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.151886  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.06 
 
 
479 aa  233  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1136  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.59 
 
 
598 aa  233  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0672  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.85 
 
 
670 aa  233  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0858799999999997e-27 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2274  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.34 
 
 
542 aa  232  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0531449  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.01 
 
 
465 aa  232  2e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.1 
 
 
466 aa  233  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  35.58 
 
 
464 aa  232  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.03 
 
 
466 aa  231  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2986  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.6 
 
 
552 aa  231  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144587 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  34.62 
 
 
482 aa  231  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0031  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.27 
 
 
578 aa  231  7e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.43195 
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  34.46 
 
 
465 aa  230  1e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1661  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  29.04 
 
 
648 aa  229  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.950377  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1601  putative oxidoreductase  31.57 
 
 
615 aa  229  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  35.15 
 
 
468 aa  229  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5479  Glutamate synthase (NADPH)  31.79 
 
 
599 aa  229  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.91 
 
 
469 aa  229  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  34.53 
 
 
465 aa  228  4e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0696  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.19 
 
 
577 aa  228  4e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  34.92 
 
 
468 aa  227  6e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_131  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase protein  29.03 
 
 
677 aa  225  3e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000174101  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  36.78 
 
 
468 aa  225  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1736  putative oxidoreductase  31 
 
 
615 aa  224  4.9999999999999996e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2184  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  29.78 
 
 
541 aa  224  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.544077  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1031  glutamate synthase subunit beta  32.93 
 
 
469 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.473013  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3640  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.73 
 
 
672 aa  222  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000847513  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  34.35 
 
 
482 aa  221  3.9999999999999997e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>