More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1594 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1594  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  100 
 
 
609 aa  1249    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2250  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  46.15 
 
 
617 aa  548  1e-155  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  45.23 
 
 
612 aa  549  1e-155  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00210  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  46.46 
 
 
612 aa  545  1e-154  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.301732 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16540  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  45.35 
 
 
612 aa  536  1e-151  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000430303  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.83 
 
 
996 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2503  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.9 
 
 
663 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2314  respiratory-chain NADH dehydrogenase, 51 kDa subunit  32.45 
 
 
707 aa  299  9e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0653639  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  38.32 
 
 
699 aa  296  9e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  36.79 
 
 
1150 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.24 
 
 
1126 aa  295  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0138  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.83 
 
 
663 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  35.94 
 
 
654 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  41.25 
 
 
493 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  35.73 
 
 
653 aa  280  4e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  35.46 
 
 
658 aa  279  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0510  Fe(III) reductase, beta subunit  31.92 
 
 
672 aa  270  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  35.32 
 
 
653 aa  270  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  34.16 
 
 
688 aa  270  5.9999999999999995e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.79 
 
 
1487 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3023  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.76 
 
 
672 aa  265  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.07 
 
 
555 aa  260  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0447  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  35.24 
 
 
656 aa  260  6e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.62 
 
 
914 aa  258  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0418  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  35.81 
 
 
653 aa  257  4e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1543  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.17 
 
 
618 aa  256  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0672  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.39 
 
 
670 aa  256  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0858799999999997e-27 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.17 
 
 
1481 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0659  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.55 
 
 
670 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  35.22 
 
 
1385 aa  255  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.36 
 
 
1410 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.88 
 
 
1421 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.94 
 
 
1425 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.08 
 
 
1426 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.42 
 
 
1440 aa  253  7e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.17 
 
 
1406 aa  253  7e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.67 
 
 
1425 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.74 
 
 
1425 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1383  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.41 
 
 
673 aa  250  5e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  34.95 
 
 
1073 aa  249  9e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  34.94 
 
 
1412 aa  249  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.33 
 
 
1428 aa  248  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.85 
 
 
1432 aa  247  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.85 
 
 
1432 aa  247  6e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.68 
 
 
1432 aa  246  8e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.48 
 
 
1440 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.29 
 
 
891 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  33.82 
 
 
1387 aa  244  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1824  glutamate synthase (NADPH)  28.83 
 
 
677 aa  244  5e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.344079  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.65 
 
 
1424 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.68 
 
 
1480 aa  238  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.933284 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2205  putative oxidoreductase  37.35 
 
 
598 aa  236  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204646  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0423  selenate reductase YgfK  33.05 
 
 
1075 aa  234  3e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2800  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.27 
 
 
608 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0413  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  32.48 
 
 
659 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.933547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6307  putative 2-ketoglutarate  34.43 
 
 
599 aa  233  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.747625  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0770  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.12 
 
 
546 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0660  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.97 
 
 
672 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3640  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.47 
 
 
672 aa  231  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000847513  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2986  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.33 
 
 
552 aa  229  9e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  36.66 
 
 
471 aa  229  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  36.32 
 
 
469 aa  227  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  34.93 
 
 
455 aa  226  9e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.29 
 
 
895 aa  225  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1136  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.05 
 
 
598 aa  224  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0977  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.69 
 
 
1105 aa  224  4.9999999999999996e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000028046  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2152  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.24 
 
 
571 aa  223  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000764519 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1855  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.3 
 
 
579 aa  223  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0230589  normal  0.0943361 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.45 
 
 
476 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  34.51 
 
 
503 aa  222  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  35.1 
 
 
482 aa  221  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  35.42 
 
 
469 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4108  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.12 
 
 
543 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112813  normal  0.10156 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1067  putative glutamate synthase (NADPH)  31.85 
 
 
597 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  33.66 
 
 
465 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  34.92 
 
 
468 aa  217  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  34.64 
 
 
477 aa  217  4e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2274  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.3 
 
 
542 aa  217  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0531449  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.36 
 
 
469 aa  217  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.73 
 
 
448 aa  217  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.19 
 
 
483 aa  217  5e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3235  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.58 
 
 
596 aa  216  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  34.64 
 
 
480 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.46 
 
 
476 aa  216  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  34.55 
 
 
482 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  34.44 
 
 
468 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  35.28 
 
 
468 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0885  putative oxidoreductase  33.5 
 
 
612 aa  213  5.999999999999999e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  33.73 
 
 
469 aa  213  7e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2319  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.31 
 
 
578 aa  213  7e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000648814  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  34.49 
 
 
480 aa  213  7e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  35.93 
 
 
470 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5479  Glutamate synthase (NADPH)  31.34 
 
 
599 aa  213  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.38 
 
 
457 aa  212  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.19 
 
 
479 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.63 
 
 
464 aa  210  5e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  35.28 
 
 
470 aa  210  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4866  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.41 
 
 
559 aa  210  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4955  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.41 
 
 
559 aa  210  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0262  putative oxidoreductase  31.54 
 
 
462 aa  210  8e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>