More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1053 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  100 
 
 		 501 aa  1017    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  59.52 
 
 		 496 aa  608  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.29 
 
 		 740 aa  157  6e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 547 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 		 510 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  27.35 
 
 		 542 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  27.65 
 
 		 544 aa  143  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  27.91 
 
 		 512 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  27.91 
 
 		 512 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  26.92 
 
 		 502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  29.12 
 
 		 503 aa  130  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 		 534 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  26.58 
 
 		 506 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  29.21 
 
 		 508 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  26.81 
 
 		 708 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  28.45 
 
 		 522 aa  123  8e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  25.44 
 
 		 506 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  30.02 
 
 		 503 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4146  All-trans-retinol 13,14-reductase  28.86 
 
 		 562 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.559453  decreased coverage  0.00452261 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  22.97 
 
 		 535 aa  119  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 503 aa  117  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 722 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  28.77 
 
 		 518 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3281  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 479 aa  117  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463065  normal  0.0612809 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  25.11 
 
 		 532 aa  117  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 717 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  26.98 
 
 		 504 aa  114  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  25.11 
 
 		 518 aa  113  9e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 502 aa  113  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 501 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.02 
 
 		 522 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3726  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  24.81 
 
 		 586 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 506 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4129  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 		 504 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.60213 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  26.04 
 
 		 520 aa  110  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  22.36 
 
 		 505 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  25.58 
 
 		 501 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3286  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 488 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  24.79 
 
 		 518 aa  107  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  25.1 
 
 		 520 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  29.54 
 
 		 507 aa  106  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1329  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 501 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914458  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  27.63 
 
 		 530 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  27.51 
 
 		 508 aa  104  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 520 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  24.73 
 
 		 520 aa  103  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  27.5 
 
 		 711 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  28.29 
 
 		 508 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  27.49 
 
 		 513 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  24.41 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  25.11 
 
 		 509 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  28.35 
 
 		 531 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  22.22 
 
 		 516 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 484 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2665  putative phytoene dehydrogenase  25.2 
 
 		 495 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  27.68 
 
 		 518 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  25.14 
 
 		 511 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 515 aa  99.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  27.68 
 
 		 518 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  27.23 
 
 		 505 aa  99  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 		 554 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  27.27 
 
 		 507 aa  97.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  22.02 
 
 		 514 aa  97.1  6e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  28.33 
 
 		 523 aa  96.7  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1834  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 		 504 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0259899 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 510 aa  95.9  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 		 547 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  26.76 
 
 		 504 aa  95.5  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  26.19 
 
 		 512 aa  95.9  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  27.36 
 
 		 507 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  25.52 
 
 		 509 aa  95.1  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  25.77 
 
 		 509 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  22.25 
 
 		 514 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  25.67 
 
 		 519 aa  94.4  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  24.71 
 
 		 511 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  22.07 
 
 		 514 aa  94.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  27.88 
 
 		 499 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  26.19 
 
 		 505 aa  93.2  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  25.39 
 
 		 511 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.78 
 
 		 511 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.32 
 
 		 511 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  24.64 
 
 		 509 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  25.05 
 
 		 511 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 		 559 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  22.02 
 
 		 514 aa  91.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0939  amine oxidase  22.68 
 
 		 496 aa  91.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  28.09 
 
 		 505 aa  90.5  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_715  FAD dependent oxidoreductase  23.49 
 
 		 500 aa  89.7  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  25.05 
 
 		 494 aa  89.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  25.68 
 
 		 509 aa  89.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  24.04 
 
 		 554 aa  89.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  25.35 
 
 		 493 aa  89  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  26.01 
 
 		 504 aa  89  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  26.54 
 
 		 499 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 514 aa  87.4  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  25.79 
 
 		 509 aa  87.4  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03825  hypothetical protein  21.26 
 
 		 508 aa  87  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0811  phytoene dehydrogenase  23.9 
 
 		 523 aa  87  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0324739  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 		 555 aa  87  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  26.76 
 
 		 510 aa  86.7  8e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>