246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1552 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  895    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  55.9 
 
 		 427 aa  508  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  55.42 
 
 		 427 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  57.58 
 
 		 453 aa  499  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  54.74 
 
 		 436 aa  498  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0168  hypothetical protein  55.42 
 
 		 414 aa  484  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  54.27 
 
 		 428 aa  484  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  47.36 
 
 		 419 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  45.75 
 
 		 432 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  44.63 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  31.18 
 
 		 436 aa  246  6e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1133  hypothetical protein  34.3 
 
 		 450 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0829  hypothetical protein  31.1 
 
 		 448 aa  213  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.476785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  27.27 
 
 		 429 aa  209  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  31.8 
 
 		 439 aa  206  8e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  29.72 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3973  hypothetical protein  31.72 
 
 		 450 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0831495  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  29.72 
 
 		 448 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  29.95 
 
 		 448 aa  196  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  30.41 
 
 		 437 aa  190  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  30.02 
 
 		 412 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  28.97 
 
 		 436 aa  149  9e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1642  hypothetical protein  28.64 
 
 		 437 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0060  hypothetical protein  28.18 
 
 		 437 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0725  hypothetical protein  29.37 
 
 		 410 aa  147  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00111805  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1597  hypothetical protein  27.25 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1302  hypothetical protein  30.12 
 
 		 445 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1319  hypothetical protein  30.12 
 
 		 445 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150757 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1338  hypothetical protein  30.12 
 
 		 445 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0694  hypothetical protein  28.07 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.452898  normal  0.129497 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  28 
 
 		 474 aa  90.9  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  28.94 
 
 		 479 aa  83.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  27.04 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  26.71 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  27.78 
 
 		 624 aa  80.1  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  26.99 
 
 		 473 aa  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  28.71 
 
 		 477 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  27.27 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  26.83 
 
 		 465 aa  76.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  25.29 
 
 		 516 aa  76.6  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  26.92 
 
 		 466 aa  76.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  27.71 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3309  amine oxidase  25.93 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  27.04 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  23.48 
 
 		 520 aa  73.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  25.62 
 
 		 475 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  24.84 
 
 		 475 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  28.03 
 
 		 472 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  25.57 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  26.06 
 
 		 471 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  25.69 
 
 		 455 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  24.19 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  26.52 
 
 		 472 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  25.73 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  26.14 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  25.16 
 
 		 552 aa  67.8  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  24.39 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  24.3 
 
 		 453 aa  67  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  25.34 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  27.27 
 
 		 486 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  24.22 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  23.59 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  25.49 
 
 		 599 aa  63.5  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  27.31 
 
 		 486 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  24.22 
 
 		 589 aa  62.4  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  21.6 
 
 		 500 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  22.02 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  24.44 
 
 		 498 aa  58.9  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  24.83 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  24.17 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  22.46 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  26.07 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  25.38 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  25.85 
 
 		 504 aa  56.6  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  25.45 
 
 		 465 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  25.38 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  24.48 
 
 		 524 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  22.04 
 
 		 449 aa  53.1  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0696  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  62.5 
 
 		 577 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  38.55 
 
 		 482 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  22.69 
 
 		 480 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2319  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  60 
 
 		 578 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000648814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  22.56 
 
 		 722 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  25.28 
 
 		 507 aa  51.6  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  21.11 
 
 		 647 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1954  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  60 
 
 		 579 aa  51.6  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.151886  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  23.73 
 
 		 499 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  21.08 
 
 		 428 aa  51.6  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  28.57 
 
 		 490 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  23.89 
 
 		 484 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0031  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  60 
 
 		 578 aa  50.4  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.43195 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0130  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  54.76 
 
 		 578 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2503  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.85 
 
 		 663 aa  50.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  26.06 
 
 		 503 aa  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1383  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.5 
 
 		 673 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1959  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  51.06 
 
 		 647 aa  50.1  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.19 
 
 		 996 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  25 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  22.49 
 
 		 498 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  22.49 
 
 		 484 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>