253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0308 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  73.29 
 
 
472 aa  712    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  73.29 
 
 
464 aa  704    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  84.18 
 
 
479 aa  821    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  81 
 
 
479 aa  793    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  75.72 
 
 
472 aa  725    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  98.74 
 
 
475 aa  968    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  75.06 
 
 
472 aa  723    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  72.65 
 
 
465 aa  712    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  78.59 
 
 
474 aa  771    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  73.09 
 
 
466 aa  715    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  100 
 
 
475 aa  978    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  88.29 
 
 
471 aa  855    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  72.2 
 
 
477 aa  706    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  80.44 
 
 
459 aa  784    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  72.87 
 
 
466 aa  713    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  72.29 
 
 
473 aa  707    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  73.51 
 
 
462 aa  705    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  74.17 
 
 
472 aa  720    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  57.27 
 
 
589 aa  559  1e-158  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  56.34 
 
 
599 aa  542  1e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  57.57 
 
 
552 aa  539  9.999999999999999e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  56.03 
 
 
624 aa  533  1e-150  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  40.73 
 
 
453 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  41.18 
 
 
453 aa  347  2e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  41.45 
 
 
463 aa  346  4e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  41.39 
 
 
453 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  40.73 
 
 
453 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  40.65 
 
 
455 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  40.09 
 
 
453 aa  333  5e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  40.31 
 
 
453 aa  330  3e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  39.11 
 
 
461 aa  309  6.999999999999999e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  38.31 
 
 
462 aa  302  1e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  38.06 
 
 
461 aa  302  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  36.09 
 
 
460 aa  300  4e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  37.22 
 
 
462 aa  296  6e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  37.61 
 
 
459 aa  295  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  37.81 
 
 
460 aa  288  1e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  36.33 
 
 
484 aa  283  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  35.97 
 
 
484 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  35.76 
 
 
484 aa  276  6e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  34.89 
 
 
490 aa  276  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  34.89 
 
 
490 aa  276  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  34.69 
 
 
489 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  35.55 
 
 
499 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  35.82 
 
 
483 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  35.76 
 
 
488 aa  270  5.9999999999999995e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  35.19 
 
 
479 aa  267  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  34.51 
 
 
486 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  34.93 
 
 
478 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  35.27 
 
 
488 aa  263  6.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  34.3 
 
 
486 aa  259  8e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  36.55 
 
 
490 aa  259  9e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  33.88 
 
 
482 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  34.22 
 
 
479 aa  257  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  34.99 
 
 
481 aa  251  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  31.85 
 
 
591 aa  220  5e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  26.99 
 
 
451 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  28.33 
 
 
481 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.18 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  25.11 
 
 
503 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.83 
 
 
477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  24.85 
 
 
500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  24.21 
 
 
520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  24.08 
 
 
448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.34 
 
 
447 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  24.26 
 
 
452 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  24.26 
 
 
452 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  24.26 
 
 
452 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  25.93 
 
 
562 aa  93.2  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  24.28 
 
 
569 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  22.99 
 
 
486 aa  84.7  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.37 
 
 
447 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  26.38 
 
 
425 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  24.95 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  23.33 
 
 
438 aa  75.1  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  26.19 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  21.76 
 
 
441 aa  74.3  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  24.84 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  24.84 
 
 
506 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  23.66 
 
 
432 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  24.84 
 
 
506 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3155  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.8 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  27.03 
 
 
645 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  28.02 
 
 
647 aa  70.1  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  29.96 
 
 
647 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  29.96 
 
 
647 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  24.15 
 
 
459 aa  68.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  24.15 
 
 
811 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6666  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.16 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393983  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1093  zeta-carotene desaturase-like  23.6 
 
 
544 aa  67  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.802606  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1470  amine oxidase  24.01 
 
 
440 aa  67  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  23.55 
 
 
989 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  24.63 
 
 
506 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  24.69 
 
 
523 aa  67  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  23.27 
 
 
410 aa  65.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  22.65 
 
 
492 aa  64.3  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2968  putative phytoene dehydrogenase  24.07 
 
 
416 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.88 
 
 
640 aa  62.4  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  25.55 
 
 
432 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  23.13 
 
 
448 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>