34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3309 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3309  amine oxidase  100 
 
 
484 aa  957    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1642  hypothetical protein  35.57 
 
 
437 aa  260  4e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0060  hypothetical protein  35.05 
 
 
437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  24.38 
 
 
437 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1597  hypothetical protein  26.19 
 
 
412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  24.11 
 
 
436 aa  110  6e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  26.94 
 
 
412 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  23.76 
 
 
436 aa  96.7  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0694  hypothetical protein  25 
 
 
409 aa  95.9  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.452898  normal  0.129497 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  23.08 
 
 
429 aa  90.9  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0725  hypothetical protein  26.03 
 
 
410 aa  90.9  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00111805  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  26.16 
 
 
435 aa  86.7  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0829  hypothetical protein  24.45 
 
 
448 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.476785  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  23.43 
 
 
427 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3973  hypothetical protein  26.57 
 
 
450 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0831495  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0168  hypothetical protein  23.83 
 
 
414 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  24.44 
 
 
427 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  27.54 
 
 
419 aa  58.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  22.25 
 
 
448 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1133  hypothetical protein  27.05 
 
 
450 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366944  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  23.81 
 
 
439 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  22.88 
 
 
436 aa  55.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  24.35 
 
 
432 aa  54.3  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  23.86 
 
 
453 aa  53.9  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  23.08 
 
 
448 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  20 
 
 
423 aa  52.8  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  24.54 
 
 
429 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  19.42 
 
 
428 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1338  hypothetical protein  26.57 
 
 
445 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1319  hypothetical protein  26.57 
 
 
445 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.150757 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1302  hypothetical protein  26.57 
 
 
445 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4724  amine oxidase  34.44 
 
 
421 aa  44.3  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.519629  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1351  steroid monooxygenase  38 
 
 
541 aa  43.9  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.881234  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3885  flavin-containing monooxygenase  34.67 
 
 
505 aa  43.5  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>