241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1637 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  66.12 
 
 		 498 aa  674    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  65.66 
 
 		 494 aa  667    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  63.18 
 
 		 512 aa  652    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  100 
 
 		 516 aa  1053    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  68.07 
 
 		 524 aa  687    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  52.23 
 
 		 507 aa  486  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  49.59 
 
 		 496 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  50.59 
 
 		 500 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  51.71 
 
 		 520 aa  470  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  50.99 
 
 		 500 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  50.6 
 
 		 511 aa  463  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  50.75 
 
 		 480 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  50.4 
 
 		 500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  50.41 
 
 		 511 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  39.12 
 
 		 549 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  42.28 
 
 		 519 aa  389  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  40.21 
 
 		 472 aa  388  1e-106  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  39.1 
 
 		 1033 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  38.78 
 
 		 538 aa  363  4e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  38.33 
 
 		 537 aa  330  3e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  38.48 
 
 		 539 aa  327  5e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  38.27 
 
 		 463 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  38.27 
 
 		 463 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  38.05 
 
 		 463 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  36.93 
 
 		 450 aa  280  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  36.63 
 
 		 436 aa  280  4e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  35.61 
 
 		 465 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  28.6 
 
 		 465 aa  176  7e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  26.92 
 
 		 449 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  24.95 
 
 		 722 aa  133  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  27.21 
 
 		 447 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  23.76 
 
 		 459 aa  126  8.000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  25.29 
 
 		 446 aa  121  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  23.33 
 
 		 459 aa  121  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  28.51 
 
 		 435 aa  114  6e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  26 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2937  amine oxidase  29.82 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  26.77 
 
 		 437 aa  110  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 489 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  23.44 
 
 		 428 aa  105  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  25.97 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  24.24 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  28 
 
 		 491 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  26.71 
 
 		 428 aa  101  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  23.37 
 
 		 538 aa  99.8  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 460 aa  99  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  23.58 
 
 		 532 aa  96.7  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  22.65 
 
 		 1293 aa  96.3  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  27.1 
 
 		 450 aa  95.9  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  23.2 
 
 		 431 aa  89.4  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  24.93 
 
 		 452 aa  87.4  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  27.11 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  26.25 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  22.67 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  25.29 
 
 		 435 aa  76.3  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  27.68 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  22.96 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  22.67 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  25.38 
 
 		 525 aa  65.1  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  24.02 
 
 		 467 aa  63.9  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  20.76 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  20.53 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  28.05 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  40.74 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  24.41 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1606  phytoene desaturase  22.94 
 
 		 511 aa  56.6  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  23.59 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  22.51 
 
 		 423 aa  55.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  26.95 
 
 		 396 aa  54.7  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  24.12 
 
 		 419 aa  54.7  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  25.88 
 
 		 448 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  25.81 
 
 		 508 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0404  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  30.06 
 
 		 370 aa  52.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1290  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 		 455 aa  52.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  27.22 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  27.03 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  56 
 
 		 525 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  39.08 
 
 		 645 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  24.63 
 
 		 427 aa  51.6  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  25.61 
 
 		 366 aa  51.6  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  24.39 
 
 		 367 aa  51.2  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  25.6 
 
 		 372 aa  50.8  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  39.39 
 
 		 508 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  37.36 
 
 		 439 aa  50.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  20.53 
 
 		 436 aa  50.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  29.34 
 
 		 376 aa  50.1  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  40 
 
 		 505 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  22.51 
 
 		 384 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  31.4 
 
 		 511 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  30.6 
 
 		 369 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  41.18 
 
 		 468 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  37.88 
 
 		 469 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  26.03 
 
 		 470 aa  50.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  43.14 
 
 		 468 aa  50.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  48.15 
 
 		 512 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5416  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  24.16 
 
 		 471 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0286038 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  41.51 
 
 		 488 aa  49.3  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  22.64 
 
 		 486 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  32.46 
 
 		 468 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>