More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45735 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  59.96 
 
 		 552 aa  655    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  69.9 
 
 		 599 aa  846    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  100 
 
 		 624 aa  1296    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  58.51 
 
 		 464 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  56.73 
 
 		 472 aa  567  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  57.56 
 
 		 474 aa  564  1.0000000000000001e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  58.3 
 
 		 462 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  56.85 
 
 		 472 aa  560  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  56.25 
 
 		 465 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  56.25 
 
 		 466 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  57.08 
 
 		 471 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  56.03 
 
 		 472 aa  551  1e-155  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  55.62 
 
 		 466 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  54.94 
 
 		 479 aa  551  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  55.46 
 
 		 473 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  56.66 
 
 		 475 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  54.91 
 
 		 472 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  56.03 
 
 		 475 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  55.62 
 
 		 459 aa  532  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  52.96 
 
 		 479 aa  527  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  53.32 
 
 		 477 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  47.87 
 
 		 589 aa  504  1e-141  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  38.27 
 
 		 463 aa  325  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  34.86 
 
 		 455 aa  306  7e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  34.24 
 
 		 453 aa  301  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  34.73 
 
 		 453 aa  298  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  34.24 
 
 		 453 aa  298  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  35.07 
 
 		 453 aa  293  7e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  34.25 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  33.19 
 
 		 453 aa  289  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  31.88 
 
 		 460 aa  259  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  31.9 
 
 		 461 aa  253  6e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  32.98 
 
 		 462 aa  252  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  31.4 
 
 		 462 aa  248  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  32.67 
 
 		 489 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  31.56 
 
 		 461 aa  242  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  30.82 
 
 		 459 aa  239  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  30.72 
 
 		 490 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  30.72 
 
 		 490 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  31.93 
 
 		 479 aa  234  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  31.93 
 
 		 483 aa  234  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  30.74 
 
 		 460 aa  234  3e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  31.35 
 
 		 479 aa  233  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  31.53 
 
 		 482 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  30.82 
 
 		 478 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  33 
 
 		 488 aa  228  3e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  30.68 
 
 		 484 aa  226  7e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  30.75 
 
 		 486 aa  226  7e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  30.48 
 
 		 484 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  32.2 
 
 		 488 aa  224  4.9999999999999996e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  30.43 
 
 		 499 aa  223  8e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  33.33 
 
 		 481 aa  220  6e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  30.68 
 
 		 484 aa  220  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  32.28 
 
 		 490 aa  219  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  30.16 
 
 		 486 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  28.71 
 
 		 591 aa  206  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  29.06 
 
 		 481 aa  144  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  24.5 
 
 		 500 aa  127  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  24.36 
 
 		 451 aa  126  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  23.87 
 
 		 503 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  24.19 
 
 		 520 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  23.74 
 
 		 448 aa  103  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.64 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.49 
 
 		 439 aa  97.8  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.08 
 
 		 447 aa  91.3  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  25.72 
 
 		 506 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  25.72 
 
 		 506 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  24.95 
 
 		 562 aa  84.3  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  22.06 
 
 		 452 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  22.06 
 
 		 452 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  22.06 
 
 		 452 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  24.85 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  27.96 
 
 		 645 aa  80.5  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  27.97 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  26.14 
 
 		 647 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1093  zeta-carotene desaturase-like  22.73 
 
 		 544 aa  72.4  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.802606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  27.81 
 
 		 647 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  26.42 
 
 		 647 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  26.56 
 
 		 523 aa  72  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  22.2 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.25 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  25.95 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  21.1 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4947  amine oxidase  24.89 
 
 		 551 aa  68.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00497379  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  24.37 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  21.7 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1346  zeta-carotene desaturase-like  22.15 
 
 		 543 aa  67  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  23.75 
 
 		 506 aa  66.6  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  21.98 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  25.7 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7145  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.08 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  22.22 
 
 		 569 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  22.47 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  25.95 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2968  putative phytoene dehydrogenase  23.6 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  22.36 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0168  hypothetical protein  26.81 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  25.24 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5425  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.09 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1470  amine oxidase  21.78 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.292882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>