More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0059 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  74.07 
 
 		 436 aa  669    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  72.13 
 
 		 428 aa  654    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  932    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  71.56 
 
 		 427 aa  631  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  69.43 
 
 		 427 aa  614  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0168  hypothetical protein  70.87 
 
 		 414 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  57.58 
 
 		 435 aa  518  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  50.12 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  47.91 
 
 		 432 aa  423  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  39.81 
 
 		 423 aa  386  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  30.57 
 
 		 436 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  33.26 
 
 		 439 aa  226  9e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  26.35 
 
 		 429 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1133  hypothetical protein  32.08 
 
 		 450 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0829  hypothetical protein  30.79 
 
 		 448 aa  202  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.476785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  30.23 
 
 		 448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3973  hypothetical protein  30.33 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0831495  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  29.77 
 
 		 448 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  30.73 
 
 		 429 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  30.3 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  29.72 
 
 		 436 aa  156  7e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1597  hypothetical protein  27.78 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1642  hypothetical protein  26.77 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  28.87 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0060  hypothetical protein  27.06 
 
 		 437 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0725  hypothetical protein  28.84 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00111805  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1302  hypothetical protein  28.27 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1338  hypothetical protein  28.27 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1319  hypothetical protein  28.27 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150757 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0694  hypothetical protein  27.21 
 
 		 409 aa  99.4  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.452898  normal  0.129497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  24.41 
 
 		 520 aa  76.6  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  24.84 
 
 		 624 aa  73.6  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  25.5 
 
 		 524 aa  73.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  27.72 
 
 		 479 aa  70.1  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  24.12 
 
 		 599 aa  69.3  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  24.23 
 
 		 722 aa  68.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  24.7 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  24.24 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  20 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  21.09 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  21.92 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  21.86 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  23.99 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.6 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  24.93 
 
 		 507 aa  63.5  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.42 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  25.79 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  21.89 
 
 		 496 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  23.53 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.05 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  19.91 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  22.82 
 
 		 500 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  20.42 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  22.67 
 
 		 482 aa  57  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  23.29 
 
 		 475 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  22.29 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  35.29 
 
 		 589 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  22.29 
 
 		 466 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4037  putative oxidoreductase  30.49 
 
 		 455 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.239048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1801  putative oxidoreductase  30.83 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  61.54 
 
 		 489 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  61.54 
 
 		 489 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  22.73 
 
 		 475 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  23.55 
 
 		 473 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  61.54 
 
 		 480 aa  54.3  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5692  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  44.23 
 
 		 500 aa  54.7  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6583  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 435 aa  54.3  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  61.54 
 
 		 491 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  61.54 
 
 		 488 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  61.54 
 
 		 488 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3639  putative oxidoreductase  59.52 
 
 		 455 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3592  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.81 
 
 		 502 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4693  normal  0.0250321 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1936  glutamate synthase subunit beta  61.54 
 
 		 491 aa  53.9  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1835  putative oxidoreductase  59.52 
 
 		 455 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  54.55 
 
 		 491 aa  53.5  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2823  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  52.27 
 
 		 502 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3059  glutamate synthase (NADH) small subunit  54.55 
 
 		 502 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.519079  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  54.17 
 
 		 463 aa  53.5  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3043  glutamate synthase (NADH) small subunit  54.55 
 
 		 502 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3102  glutamate synthase (NADH) small subunit  54.55 
 
 		 502 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2319  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.94 
 
 		 578 aa  53.1  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000648814  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  58.97 
 
 		 491 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  23.82 
 
 		 516 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 		 409 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  34.94 
 
 		 472 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0342  glutamate synthase (NADH) small subunit  64.1 
 
 		 475 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  23.49 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0130  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  44.23 
 
 		 578 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0629  glutamate synthase subunit beta  58.97 
 
 		 491 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  58.97 
 
 		 488 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  23.72 
 
 		 479 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28030  glutamate synthase (NADH) small subunit  53.19 
 
 		 501 aa  52.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.328015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  58.14 
 
 		 492 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0185  glutamate synthase subunit beta  58.97 
 
 		 491 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  18.92 
 
 		 428 aa  52.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  61.54 
 
 		 494 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  53.49 
 
 		 487 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0031  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.94 
 
 		 578 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.43195 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0418  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  56.1 
 
 		 653 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0696  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35 
 
 		 577 aa  51.6  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>