228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0942 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  100 
 
 		 449 aa  928    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  65.22 
 
 		 437 aa  609  1e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  60.59 
 
 		 447 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  63.07 
 
 		 446 aa  572  1.0000000000000001e-162  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  57.79 
 
 		 436 aa  530  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  36.77 
 
 		 435 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  36.32 
 
 		 450 aa  259  9e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  34.4 
 
 		 428 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  28.81 
 
 		 431 aa  209  9e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  29.64 
 
 		 1293 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  25.52 
 
 		 428 aa  172  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  28.32 
 
 		 511 aa  166  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  27.42 
 
 		 421 aa  163  6e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  28.67 
 
 		 511 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  27.7 
 
 		 449 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  28.63 
 
 		 538 aa  149  7e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  27.55 
 
 		 500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  27.66 
 
 		 524 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  27.56 
 
 		 500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  27.5 
 
 		 507 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  28.06 
 
 		 454 aa  147  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  25.61 
 
 		 452 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  27.9 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  26.58 
 
 		 496 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  27.49 
 
 		 500 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  25.87 
 
 		 532 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  27.95 
 
 		 512 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  27.01 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  25.56 
 
 		 472 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  25 
 
 		 427 aa  136  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  25.25 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  26.58 
 
 		 498 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  26.92 
 
 		 516 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  26.77 
 
 		 520 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  25.68 
 
 		 480 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  24.04 
 
 		 722 aa  126  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  25.11 
 
 		 494 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  23.68 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  23.82 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  23.82 
 
 		 459 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  24.33 
 
 		 519 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  22.94 
 
 		 549 aa  97.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0329  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  26.16 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  23.44 
 
 		 465 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  22.31 
 
 		 539 aa  89.4  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  22.54 
 
 		 1033 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  22.11 
 
 		 537 aa  88.6  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  23.48 
 
 		 463 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  23.48 
 
 		 463 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  24.02 
 
 		 463 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  23.08 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  22.92 
 
 		 465 aa  79  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  23.06 
 
 		 538 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  23.49 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  22.63 
 
 		 472 aa  73.2  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  24.94 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  22.59 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  26.09 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  26.14 
 
 		 465 aa  66.2  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  24.2 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  22.67 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  22.16 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  24.82 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  22.34 
 
 		 470 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  24.45 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  21.61 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  24.62 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  23.43 
 
 		 467 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2837  amine oxidase  22.97 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3208  amine oxidase  22.01 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.884279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  22.08 
 
 		 427 aa  57  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3065  amine oxidase  21.73 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1312  amine oxidase  21.73 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3051  amine oxidase  21.73 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  24.07 
 
 		 488 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  21.03 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  21.28 
 
 		 466 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  40 
 
 		 468 aa  55.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3033  amine oxidase  23.05 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.567673  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  27.04 
 
 		 366 aa  55.1  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  23.99 
 
 		 427 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  41.54 
 
 		 468 aa  54.7  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  25.31 
 
 		 412 aa  54.7  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  25.08 
 
 		 482 aa  54.7  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  24.52 
 
 		 479 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  40 
 
 		 468 aa  53.9  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1495  hypothetical protein  42.65 
 
 		 485 aa  53.5  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  22.04 
 
 		 435 aa  53.1  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  23.58 
 
 		 436 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  23.43 
 
 		 477 aa  53.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  26.53 
 
 		 520 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  23.65 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  23.36 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  22.49 
 
 		 509 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  22.54 
 
 		 454 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  23.36 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  20.19 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  22.83 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  43.14 
 
 		 501 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>