More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4196 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  100 
 
 
496 aa  1036    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  63.4 
 
 
480 aa  627  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  52.43 
 
 
524 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  50.2 
 
 
520 aa  488  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  48.65 
 
 
498 aa  483  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  48.95 
 
 
507 aa  482  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  49.69 
 
 
494 aa  482  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  49.9 
 
 
512 aa  479  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  49.79 
 
 
516 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  48.17 
 
 
511 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  47.61 
 
 
500 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  47.11 
 
 
511 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  47.22 
 
 
500 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  47.01 
 
 
500 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  44.44 
 
 
472 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  43.05 
 
 
519 aa  418  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  39.81 
 
 
549 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  40.41 
 
 
538 aa  389  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  39.35 
 
 
1033 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  38.98 
 
 
539 aa  365  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  37.97 
 
 
537 aa  347  3e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  34.72 
 
 
465 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 
450 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  35.28 
 
 
436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  36.13 
 
 
463 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  36.13 
 
 
463 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  35.92 
 
 
463 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  27.85 
 
 
465 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  27.39 
 
 
459 aa  169  9e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  26.52 
 
 
459 aa  163  6e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  25.84 
 
 
722 aa  149  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  26.58 
 
 
449 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  26.56 
 
 
446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2937  amine oxidase  26.83 
 
 
448 aa  140  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  25.28 
 
 
437 aa  136  8e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  26.16 
 
 
491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  25.94 
 
 
435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  25.11 
 
 
447 aa  126  9e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  25.24 
 
 
436 aa  125  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  24.67 
 
 
452 aa  124  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  25.75 
 
 
449 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  24.14 
 
 
538 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  22.15 
 
 
489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  26.72 
 
 
452 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  26.14 
 
 
428 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 
460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  24.55 
 
 
1293 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  24.45 
 
 
428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  22.74 
 
 
454 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  25.66 
 
 
450 aa  97.8  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  22.92 
 
 
532 aa  96.3  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  22.94 
 
 
431 aa  93.2  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  21.63 
 
 
424 aa  76.6  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  23.21 
 
 
421 aa  73.6  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  25 
 
 
429 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  20.52 
 
 
427 aa  67  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  20.28 
 
 
427 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  42.86 
 
 
438 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  28.24 
 
 
468 aa  62.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  23.25 
 
 
366 aa  60.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  30.86 
 
 
455 aa  58.9  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0404  FAD dependent oxidoreductase  23.3 
 
 
443 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  22.25 
 
 
428 aa  58.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  40.54 
 
 
421 aa  57.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  26.99 
 
 
369 aa  57  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  25.4 
 
 
482 aa  57  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  22.61 
 
 
427 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  28.22 
 
 
454 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  28.57 
 
 
367 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  26.67 
 
 
367 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  48.28 
 
 
434 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  22.81 
 
 
453 aa  55.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  40.26 
 
 
519 aa  54.7  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  29.94 
 
 
453 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  27.01 
 
 
364 aa  54.7  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  21.62 
 
 
432 aa  54.3  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  38.64 
 
 
525 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  26.95 
 
 
372 aa  53.9  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  23.81 
 
 
365 aa  53.9  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  42.47 
 
 
565 aa  53.9  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  22.46 
 
 
423 aa  53.9  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  33.96 
 
 
426 aa  53.9  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  20.09 
 
 
437 aa  53.5  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  46.27 
 
 
446 aa  53.5  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  27.81 
 
 
396 aa  53.5  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  50 
 
 
463 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13065  monooxygenase  36.36 
 
 
524 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.118559 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  27.22 
 
 
391 aa  52.8  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  50.98 
 
 
462 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  28.11 
 
 
370 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  30.92 
 
 
451 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  34.83 
 
 
497 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  31.1 
 
 
376 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  49.02 
 
 
476 aa  52.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  30.92 
 
 
451 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 
520 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  27.71 
 
 
380 aa  52.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 
520 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  30.92 
 
 
451 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 
520 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>