211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1155 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  100 
 
 
423 aa  840    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  44.63 
 
 
435 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  44.39 
 
 
428 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  43.54 
 
 
427 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  44.26 
 
 
427 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  42.96 
 
 
436 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  39.81 
 
 
453 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  41.39 
 
 
432 aa  351  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0168  hypothetical protein  43.28 
 
 
414 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  42.17 
 
 
419 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  30.79 
 
 
436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  31.85 
 
 
429 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0829  hypothetical protein  25.66 
 
 
448 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.476785  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1133  hypothetical protein  26.07 
 
 
450 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366944  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3973  hypothetical protein  24.31 
 
 
450 aa  169  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0831495  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  25.47 
 
 
439 aa  162  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  28.47 
 
 
437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  25.92 
 
 
429 aa  150  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  23.25 
 
 
448 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  22.58 
 
 
448 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  28.88 
 
 
436 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  29.28 
 
 
412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0725  hypothetical protein  28.67 
 
 
410 aa  130  6e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00111805  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1597  hypothetical protein  30.79 
 
 
412 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1302  hypothetical protein  24.48 
 
 
445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1319  hypothetical protein  24.48 
 
 
445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.150757 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1338  hypothetical protein  24.48 
 
 
445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0060  hypothetical protein  23.4 
 
 
437 aa  112  9e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1642  hypothetical protein  23.91 
 
 
437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0694  hypothetical protein  29.23 
 
 
409 aa  106  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.452898  normal  0.129497 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  26.19 
 
 
475 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  26.19 
 
 
475 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  22.82 
 
 
520 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.73 
 
 
479 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.7 
 
 
474 aa  71.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  24.48 
 
 
459 aa  70.5  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  24.48 
 
 
459 aa  69.3  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  24.49 
 
 
471 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  23.68 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  29.7 
 
 
477 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  24.82 
 
 
461 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  25.08 
 
 
462 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  23.57 
 
 
460 aa  65.1  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  22.67 
 
 
449 aa  64.7  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  23.75 
 
 
472 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  24.92 
 
 
464 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  25.51 
 
 
459 aa  63.2  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  22.79 
 
 
465 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  20.21 
 
 
465 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1707  amine oxidase  23.55 
 
 
408 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588233  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  27.39 
 
 
472 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  22.79 
 
 
466 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  25.07 
 
 
511 aa  61.6  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  25.08 
 
 
473 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  22.22 
 
 
507 aa  60.8  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  24.14 
 
 
453 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  22.45 
 
 
466 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  23.28 
 
 
511 aa  60.5  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  25.17 
 
 
453 aa  60.5  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  23.96 
 
 
552 aa  60.1  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  23.76 
 
 
463 aa  60.1  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  40.45 
 
 
624 aa  60.1  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  23.47 
 
 
479 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  22.81 
 
 
524 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  21.89 
 
 
480 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  25.17 
 
 
453 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  24.74 
 
 
472 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  21.91 
 
 
500 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1606  phytoene desaturase  26.45 
 
 
511 aa  56.6  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  31.86 
 
 
472 aa  56.2  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  22.51 
 
 
516 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  24.48 
 
 
453 aa  55.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  22.73 
 
 
722 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  23.65 
 
 
484 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  22.64 
 
 
428 aa  54.3  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  30.97 
 
 
472 aa  54.3  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  22.46 
 
 
496 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  25.08 
 
 
488 aa  53.9  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  37.08 
 
 
599 aa  53.1  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  38.2 
 
 
486 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  23.36 
 
 
447 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  23.1 
 
 
453 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  23.13 
 
 
455 aa  50.8  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  25.54 
 
 
500 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  22.54 
 
 
453 aa  50.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2776  putative oxidoreductase  39.39 
 
 
413 aa  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  20.42 
 
 
589 aa  50.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 
518 aa  49.3  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  22.71 
 
 
461 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2058  NAD/FAD-binding protein-like protein  47.92 
 
 
408 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00023874  normal  0.0560685 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  37.08 
 
 
486 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36 
 
 
891 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  23.95 
 
 
462 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  27.17 
 
 
478 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1378  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.63 
 
 
612 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2463  putative oxidoreductase  37.88 
 
 
413 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  22.25 
 
 
539 aa  48.9  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0811  phytoene dehydrogenase  20.72 
 
 
523 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0324739  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03820  protoporphyrinogen oxidase, putative  25.86 
 
 
589 aa  48.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1383  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.9 
 
 
673 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>