More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2861 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  63.89 
 
 		 500 aa  646    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  63.69 
 
 		 500 aa  644    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  100 
 
 		 511 aa  1063    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  75.6 
 
 		 511 aa  788    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  63.18 
 
 		 500 aa  632  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  57.09 
 
 		 507 aa  575  1.0000000000000001e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  51.64 
 
 		 512 aa  472  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  52.06 
 
 		 524 aa  465  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  50.3 
 
 		 494 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  47.11 
 
 		 496 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  47.41 
 
 		 498 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  51.59 
 
 		 516 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  48.22 
 
 		 480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  46.46 
 
 		 520 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  43.16 
 
 		 450 aa  398  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  41.25 
 
 		 472 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  40.34 
 
 		 549 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  40.62 
 
 		 519 aa  364  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  38.69 
 
 		 1033 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  38.43 
 
 		 538 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  35.69 
 
 		 537 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  35.96 
 
 		 539 aa  295  2e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  36.59 
 
 		 465 aa  264  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  36.15 
 
 		 436 aa  251  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  34.58 
 
 		 463 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  34.17 
 
 		 463 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  34.17 
 
 		 463 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  28.32 
 
 		 449 aa  166  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  27.22 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  27.17 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  26.89 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  24.08 
 
 		 722 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  26.08 
 
 		 459 aa  144  4e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  27.29 
 
 		 437 aa  143  7e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  26.96 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  25.65 
 
 		 459 aa  138  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  26.77 
 
 		 435 aa  125  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  25.35 
 
 		 532 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  25.43 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  25.2 
 
 		 538 aa  114  5e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  25.32 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 489 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  27.08 
 
 		 491 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2937  amine oxidase  26.61 
 
 		 448 aa  101  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 460 aa  97.1  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  23.85 
 
 		 431 aa  95.5  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  23.13 
 
 		 454 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  24.48 
 
 		 452 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  28.65 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  22.65 
 
 		 449 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  22.35 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  22.54 
 
 		 1293 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  25 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  29.26 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0404  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  25.47 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  29.65 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  28.49 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  28.82 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  23.4 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  25.89 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  25 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  23.28 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  25.96 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  27.19 
 
 		 647 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  20.8 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  26.73 
 
 		 647 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  20.7 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  27.71 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  29.17 
 
 		 367 aa  57  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  50.91 
 
 		 489 aa  56.6  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  28.81 
 
 		 394 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  38.71 
 
 		 501 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  29.1 
 
 		 448 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  25.27 
 
 		 380 aa  55.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  27.06 
 
 		 432 aa  55.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  43.68 
 
 		 525 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  27.43 
 
 		 384 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  25.63 
 
 		 441 aa  54.7  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  22.22 
 
 		 465 aa  54.3  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  29.59 
 
 		 383 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  26.83 
 
 		 369 aa  54.3  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  29.59 
 
 		 383 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  25.79 
 
 		 645 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  29.59 
 
 		 383 aa  54.3  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  24.81 
 
 		 437 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  28.14 
 
 		 373 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  28.42 
 
 		 448 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  26.16 
 
 		 372 aa  53.5  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  29.55 
 
 		 377 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  24.42 
 
 		 647 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  26.09 
 
 		 460 aa  52.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  45.31 
 
 		 503 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  25.54 
 
 		 461 aa  51.6  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  27.78 
 
 		 369 aa  52  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  42.5 
 
 		 525 aa  51.6  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  46.55 
 
 		 938 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  49.02 
 
 		 494 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  28.89 
 
 		 463 aa  51.2  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  25.9 
 
 		 814 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>