232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0884 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  78.6 
 
 
459 aa  728    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  71.24 
 
 
462 aa  689    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  75.28 
 
 
461 aa  716    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  100 
 
 
460 aa  957    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  73.91 
 
 
462 aa  705    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  72.6 
 
 
461 aa  702    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  73.8 
 
 
460 aa  703    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  39.6 
 
 
453 aa  335  7e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  37.8 
 
 
455 aa  319  5e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  37.58 
 
 
453 aa  318  9e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  37.5 
 
 
453 aa  318  1e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  37.72 
 
 
453 aa  315  9e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  37.17 
 
 
471 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  37.31 
 
 
453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  36.5 
 
 
453 aa  310  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  37.5 
 
 
477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  36.23 
 
 
474 aa  306  7e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  35.79 
 
 
479 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  37.34 
 
 
472 aa  304  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  36.88 
 
 
459 aa  304  3.0000000000000004e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  36.01 
 
 
479 aa  300  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  37.14 
 
 
463 aa  300  4e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  36.09 
 
 
475 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  36.09 
 
 
475 aa  299  8e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  35.43 
 
 
465 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  36.03 
 
 
589 aa  298  2e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  35.36 
 
 
473 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  37.37 
 
 
472 aa  297  3e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  35.43 
 
 
466 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  36.84 
 
 
472 aa  296  6e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  35.43 
 
 
466 aa  296  7e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  35.51 
 
 
462 aa  294  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  35.15 
 
 
464 aa  293  6e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  36.46 
 
 
472 aa  290  5.0000000000000004e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  33.26 
 
 
552 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  31.88 
 
 
624 aa  259  7e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  31.59 
 
 
599 aa  257  3e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  34.76 
 
 
478 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  33.89 
 
 
484 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  33.67 
 
 
486 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  33.47 
 
 
484 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  33.89 
 
 
484 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  33.47 
 
 
486 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  33.33 
 
 
499 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  33.19 
 
 
488 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  33.12 
 
 
488 aa  233  5e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  31.19 
 
 
489 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  31.8 
 
 
479 aa  230  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  32.09 
 
 
490 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  32.09 
 
 
490 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  32 
 
 
482 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  31.26 
 
 
483 aa  228  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  32.02 
 
 
479 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  32.69 
 
 
490 aa  216  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  30.84 
 
 
481 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  28.25 
 
 
591 aa  190  4e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  28.17 
 
 
481 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  26.68 
 
 
451 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.94 
 
 
477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  24.89 
 
 
452 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  24.89 
 
 
452 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  24.89 
 
 
452 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  24.94 
 
 
503 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  25.56 
 
 
500 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.34 
 
 
447 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  24.44 
 
 
520 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.68 
 
 
439 aa  94  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  21.76 
 
 
447 aa  94  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  23.11 
 
 
432 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  23.17 
 
 
506 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  23.17 
 
 
506 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  23.17 
 
 
506 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  21.08 
 
 
448 aa  76.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  26.26 
 
 
645 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  22 
 
 
562 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  25.57 
 
 
435 aa  71.6  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  26.79 
 
 
647 aa  71.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1093  zeta-carotene desaturase-like  25.7 
 
 
544 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.802606  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  20.94 
 
 
506 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  47.3 
 
 
647 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  25.27 
 
 
647 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  23.57 
 
 
423 aa  65.1  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  24.67 
 
 
427 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  22.37 
 
 
989 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  23.61 
 
 
427 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  23.49 
 
 
523 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1698  putative squalene/phytoene dehydrogenase  22.53 
 
 
424 aa  61.6  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  25.7 
 
 
437 aa  60.1  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  22.22 
 
 
639 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  23.06 
 
 
569 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0764  twin-arginine translocation pathway signal  27.18 
 
 
594 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0778  amine oxidase  27.18 
 
 
594 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  30.2 
 
 
454 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.52 
 
 
643 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0758  amine oxidase  27.18 
 
 
594 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.744737 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.97 
 
 
639 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1513  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.64 
 
 
444 aa  57.4  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.00817062 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  23.81 
 
 
486 aa  57.4  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33779  predicted protein  21.19 
 
 
578 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  21.01 
 
 
438 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>