221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4011 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  73.73 
 
 		 464 aa  714    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  80.44 
 
 		 475 aa  784    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  79.61 
 
 		 479 aa  767    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  74.61 
 
 		 472 aa  721    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  72.85 
 
 		 472 aa  708    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  74.95 
 
 		 472 aa  729    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  73.85 
 
 		 465 aa  717    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  77.26 
 
 		 474 aa  761    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  71.08 
 
 		 477 aa  687    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  100 
 
 		 459 aa  949    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  82.35 
 
 		 471 aa  807    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  73.75 
 
 		 466 aa  722    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  73.68 
 
 		 473 aa  708    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  73.95 
 
 		 462 aa  715    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  74.61 
 
 		 472 aa  722    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  74.29 
 
 		 466 aa  721    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  83.62 
 
 		 479 aa  815    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  79.78 
 
 		 475 aa  778    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  58.52 
 
 		 589 aa  558  1e-158  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  57.11 
 
 		 599 aa  540  9.999999999999999e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  55.62 
 
 		 624 aa  531  1e-150  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  55.79 
 
 		 552 aa  525  1e-148  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  39.48 
 
 		 453 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  39.22 
 
 		 453 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  39.3 
 
 		 463 aa  331  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  38.31 
 
 		 455 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  38.66 
 
 		 453 aa  326  6e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  38.79 
 
 		 453 aa  324  2e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  38.74 
 
 		 453 aa  323  3e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  38.23 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  36.88 
 
 		 460 aa  304  3.0000000000000004e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  37.58 
 
 		 461 aa  300  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  37.64 
 
 		 462 aa  296  7e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  36.44 
 
 		 461 aa  294  3e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  37.44 
 
 		 462 aa  293  5e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  36.08 
 
 		 460 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  36.1 
 
 		 459 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  33.61 
 
 		 484 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  33.4 
 
 		 484 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  32.92 
 
 		 484 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  33.33 
 
 		 499 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  33.75 
 
 		 489 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  34.36 
 
 		 478 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  32.99 
 
 		 490 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  32.99 
 
 		 490 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  34.02 
 
 		 483 aa  251  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  33.4 
 
 		 488 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  33.06 
 
 		 486 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  33.54 
 
 		 488 aa  245  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  32.85 
 
 		 486 aa  242  9e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  32.72 
 
 		 479 aa  241  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  32.78 
 
 		 482 aa  239  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  32.3 
 
 		 479 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  33.81 
 
 		 490 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  32.51 
 
 		 481 aa  225  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  30.16 
 
 		 591 aa  204  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  26.97 
 
 		 451 aa  160  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  25 
 
 		 481 aa  126  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.39 
 
 		 477 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  24.4 
 
 		 503 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  23.79 
 
 		 500 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  24.05 
 
 		 448 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.97 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  24.18 
 
 		 520 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.47 
 
 		 447 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  25.61 
 
 		 569 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  21.85 
 
 		 452 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  21.85 
 
 		 452 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  21.85 
 
 		 452 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  24.61 
 
 		 562 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  28.77 
 
 		 645 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  24.57 
 
 		 989 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  23.54 
 
 		 486 aa  77.4  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  23.79 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  26.72 
 
 		 647 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  27.44 
 
 		 647 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  27.44 
 
 		 647 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  26.14 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  24.01 
 
 		 811 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6666  squalene-associated FAD-dependent desaturase  21.88 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  23.87 
 
 		 425 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  21.98 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  23.6 
 
 		 448 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  21.44 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  25.51 
 
 		 423 aa  63.2  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  22.07 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.39 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  23.5 
 
 		 506 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  23.5 
 
 		 506 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  23.72 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3583  FAD dependent oxidoreductase  22.87 
 
 		 609 aa  62.4  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  23.26 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1093  zeta-carotene desaturase-like  22.6 
 
 		 544 aa  60.5  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.802606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  23.05 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1470  amine oxidase  21.94 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3155  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.86 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  24.45 
 
 		 523 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  27.49 
 
 		 648 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  24.01 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  25.46 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>