209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1769 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  100 
 
 		 453 aa  942    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  87.17 
 
 		 453 aa  839    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  85.18 
 
 		 453 aa  830    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  85.68 
 
 		 455 aa  836    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  83.63 
 
 		 453 aa  809    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  83 
 
 		 453 aa  804    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  90.07 
 
 		 453 aa  863    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  40.74 
 
 		 464 aa  353  4e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  40.74 
 
 		 462 aa  353  5e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  41.34 
 
 		 474 aa  352  8.999999999999999e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  40.52 
 
 		 472 aa  351  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  41.39 
 
 		 475 aa  348  8e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  41.18 
 
 		 475 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  41.45 
 
 		 472 aa  344  2e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  41.23 
 
 		 472 aa  343  2.9999999999999997e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  39.91 
 
 		 472 aa  343  4e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  40.09 
 
 		 479 aa  342  8e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  39.65 
 
 		 479 aa  338  9e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  39.48 
 
 		 459 aa  338  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  39.57 
 
 		 473 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  38.53 
 
 		 463 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  40.09 
 
 		 471 aa  336  5e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  39.65 
 
 		 465 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  39.65 
 
 		 466 aa  332  8e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  38.65 
 
 		 477 aa  332  9e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  39.43 
 
 		 466 aa  329  8e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  35.91 
 
 		 589 aa  320  5e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  37.72 
 
 		 460 aa  315  9e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  36.32 
 
 		 599 aa  301  1e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  34.24 
 
 		 624 aa  298  1e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  34.66 
 
 		 489 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  35.01 
 
 		 462 aa  295  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  34.38 
 
 		 483 aa  294  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  36.49 
 
 		 484 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  35.15 
 
 		 490 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  35.15 
 
 		 490 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  35.11 
 
 		 552 aa  293  4e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  35.88 
 
 		 484 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  36.24 
 
 		 459 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  32.92 
 
 		 479 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  35.88 
 
 		 499 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  35.01 
 
 		 478 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  32.85 
 
 		 479 aa  287  2.9999999999999996e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  33.75 
 
 		 482 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  34.95 
 
 		 462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  35.14 
 
 		 486 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  34.93 
 
 		 486 aa  283  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  34.55 
 
 		 461 aa  281  1e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  35.7 
 
 		 461 aa  282  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  36.06 
 
 		 484 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  34.94 
 
 		 481 aa  279  9e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  35.09 
 
 		 460 aa  277  3e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  32.85 
 
 		 488 aa  276  7e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  32.02 
 
 		 488 aa  265  8.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  33.13 
 
 		 490 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  31.77 
 
 		 591 aa  241  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  24.83 
 
 		 481 aa  163  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  25.28 
 
 		 451 aa  150  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.97 
 
 		 477 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.89 
 
 		 447 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  25.58 
 
 		 500 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  23.71 
 
 		 503 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  21.57 
 
 		 448 aa  110  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  23.83 
 
 		 520 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  23.42 
 
 		 452 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  23.42 
 
 		 452 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  23.42 
 
 		 452 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5505  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.44 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342763  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  20 
 
 		 439 aa  101  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4952  amine oxidase  23.23 
 
 		 417 aa  99.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15769  normal  0.0932773 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.7 
 
 		 417 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3174  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.92 
 
 		 417 aa  97.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  23.7 
 
 		 417 aa  97.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  23.7 
 
 		 417 aa  97.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  23.35 
 
 		 417 aa  96.7  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  27.13 
 
 		 647 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  27.13 
 
 		 647 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  26.12 
 
 		 645 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2270  amine oxidase  22.35 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.160101 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  20.96 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2683  amine oxidase  22.81 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446485  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  23.08 
 
 		 506 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  23.08 
 
 		 506 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  25.49 
 
 		 647 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  22.86 
 
 		 506 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  21.13 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.29 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  24 
 
 		 811 aa  77.8  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  22.37 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  20.81 
 
 		 441 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7145  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.93 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  24.19 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  20.49 
 
 		 438 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  26.57 
 
 		 562 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5425  squalene-associated FAD-dependent desaturase  21.91 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  25.42 
 
 		 648 aa  67.8  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0758  amine oxidase  23.19 
 
 		 594 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.744737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0764  twin-arginine translocation pathway signal  23 
 
 		 594 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0778  amine oxidase  23 
 
 		 594 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3090  putative beta-carotene desaturase/methylase  23.65 
 
 		 520 aa  66.6  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>