264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1523 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  100 
 
 
438 aa  862    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1470  amine oxidase  40.61 
 
 
440 aa  272  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1513  squalene-associated FAD-dependent desaturase  40.05 
 
 
444 aa  230  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.00817062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  40.5 
 
 
441 aa  226  6e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  39.1 
 
 
410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1698  putative squalene/phytoene dehydrogenase  39.49 
 
 
424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2504  squalene-associated FAD-dependent desaturase  38.43 
 
 
414 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2016  amine oxidase  36.98 
 
 
426 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  33.48 
 
 
448 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2571  squalene-associated FAD-dependent desaturase  35.48 
 
 
462 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0585158 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2965  amine oxidase  37.39 
 
 
423 aa  167  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0856614  hitchhiker  0.00607749 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1286  putative squalene/phytoene dehydrogenase  38.19 
 
 
448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  32.95 
 
 
439 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1120  squalene-associated FAD-dependent desaturase  37.22 
 
 
422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.454747  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1201  amine oxidase  36.71 
 
 
434 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  0.505468 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2550  squalene-associated FAD-dependent desaturase  36.04 
 
 
432 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0071  amine oxidase  35.9 
 
 
452 aa  143  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0365942  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5425  squalene-associated FAD-dependent desaturase  33.85 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98696  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1548  amine oxidase  32.86 
 
 
434 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  30.87 
 
 
452 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  30.87 
 
 
452 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  30.87 
 
 
452 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  31.97 
 
 
437 aa  137  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  32.43 
 
 
424 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  31.14 
 
 
569 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1455  amine oxidase  32.56 
 
 
439 aa  127  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7145  squalene-associated FAD-dependent desaturase  33.87 
 
 
438 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1719  amine oxidase  31.75 
 
 
418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0628779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  28.7 
 
 
481 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  31.79 
 
 
410 aa  121  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  31.81 
 
 
562 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6666  squalene-associated FAD-dependent desaturase  32.33 
 
 
440 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393983  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3574  amine oxidase  32.08 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119107  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  31 
 
 
447 aa  117  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2219  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.81 
 
 
433 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.698048  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1943  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.81 
 
 
433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273475  normal  0.570646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  25.57 
 
 
489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1725  amine oxidase  30.46 
 
 
418 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299467  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1834  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.31 
 
 
433 aa  113  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3155  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.44 
 
 
415 aa  113  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  24.17 
 
 
479 aa  112  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  22.48 
 
 
483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.17 
 
 
477 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  24.08 
 
 
490 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  24.08 
 
 
490 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0063  amine oxidase  32.2 
 
 
432 aa  108  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  29.86 
 
 
432 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2968  putative phytoene dehydrogenase  28.63 
 
 
416 aa  106  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  24 
 
 
482 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5461  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.46 
 
 
419 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3242  squalene-associated FAD-dependent desaturase  30.95 
 
 
419 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.179321 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  23.01 
 
 
479 aa  101  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  31.02 
 
 
486 aa  98.2  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  28.6 
 
 
417 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  28.6 
 
 
417 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0011  hypothetical protein  30.34 
 
 
422 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.38 
 
 
417 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7028  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.44 
 
 
422 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000526905 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  28.83 
 
 
417 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2683  amine oxidase  32.64 
 
 
415 aa  92  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446485  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  23.41 
 
 
488 aa  91.3  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5505  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.39 
 
 
417 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342763  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4262  squalene-associated FAD-dependent desaturase  30.8 
 
 
418 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4952  amine oxidase  28.41 
 
 
417 aa  91.3  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15769  normal  0.0932773 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  22.34 
 
 
488 aa  89.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  20.88 
 
 
486 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2270  amine oxidase  32.24 
 
 
417 aa  88.2  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.160101 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4138  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.19 
 
 
425 aa  87  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3174  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.54 
 
 
417 aa  86.7  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724661  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  23.3 
 
 
503 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  21.16 
 
 
499 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  21.22 
 
 
484 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  21.01 
 
 
484 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  21.22 
 
 
484 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  22.55 
 
 
481 aa  84.7  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  20.63 
 
 
453 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.08 
 
 
447 aa  84.7  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  21.11 
 
 
453 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  20.94 
 
 
486 aa  83.2  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  21.78 
 
 
453 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  27.86 
 
 
451 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  22.8 
 
 
500 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  20.9 
 
 
478 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  20.09 
 
 
453 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  20.88 
 
 
455 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  23.41 
 
 
472 aa  77  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  22.59 
 
 
465 aa  76.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  22.41 
 
 
466 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  19.82 
 
 
453 aa  76.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  23.33 
 
 
475 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  24.4 
 
 
463 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  22.54 
 
 
466 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  22.25 
 
 
473 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  21.6 
 
 
462 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  22.63 
 
 
464 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  23.33 
 
 
475 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  25.6 
 
 
479 aa  73.6  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  25.76 
 
 
477 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  26.96 
 
 
506 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  26.96 
 
 
506 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>