162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2440 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  100 
 
 		 447 aa  883    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  37.47 
 
 		 439 aa  227  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  36.77 
 
 		 486 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  35.98 
 
 		 569 aa  190  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  36.15 
 
 		 562 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  30.24 
 
 		 481 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6666  squalene-associated FAD-dependent desaturase  36.02 
 
 		 440 aa  173  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  31.36 
 
 		 477 aa  153  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  31.6 
 
 		 438 aa  129  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  29.39 
 
 		 452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  29.39 
 
 		 452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  29.39 
 
 		 452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  31.35 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1513  squalene-associated FAD-dependent desaturase  32.43 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.00817062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  24.54 
 
 		 483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  24.8 
 
 		 479 aa  111  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  24.79 
 
 		 490 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  24.79 
 
 		 490 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1470  amine oxidase  28.6 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  21.98 
 
 		 460 aa  103  9e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  24.08 
 
 		 479 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  22.79 
 
 		 489 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  30.48 
 
 		 432 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1698  putative squalene/phytoene dehydrogenase  28.97 
 
 		 424 aa  99.8  9e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  29.3 
 
 		 448 aa  99  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  24.42 
 
 		 471 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  25.36 
 
 		 488 aa  94  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5425  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.74 
 
 		 433 aa  94  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  23.79 
 
 		 453 aa  93.2  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  22.17 
 
 		 453 aa  93.2  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  21.52 
 
 		 453 aa  92.8  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  22.3 
 
 		 459 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2550  squalene-associated FAD-dependent desaturase  31.73 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005489 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.28 
 
 		 474 aa  92  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  23.09 
 
 		 462 aa  92.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  23.58 
 
 		 475 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  23.37 
 
 		 475 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5461  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.39 
 
 		 419 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2219  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.32 
 
 		 433 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.698048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  23.58 
 
 		 473 aa  90.5  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1943  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.71 
 
 		 433 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273475  normal  0.570646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.12 
 
 		 424 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  24.77 
 
 		 462 aa  89.4  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  22.89 
 
 		 465 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  22.89 
 
 		 466 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  22.25 
 
 		 453 aa  89.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  22.89 
 
 		 461 aa  88.6  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  22.89 
 
 		 466 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2968  putative phytoene dehydrogenase  28.57 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  22.04 
 
 		 484 aa  87.4  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  23.25 
 
 		 453 aa  87  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  21.95 
 
 		 599 aa  87  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  30.07 
 
 		 447 aa  86.7  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  22.78 
 
 		 479 aa  86.3  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  21.69 
 
 		 484 aa  86.3  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  21.04 
 
 		 455 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3174  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.98 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  22.34 
 
 		 589 aa  85.1  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  27.98 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  27.98 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  29.22 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1834  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.46 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  28.79 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  23.47 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.6 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7145  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.19 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  23.71 
 
 		 461 aa  83.2  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  20.91 
 
 		 484 aa  83.2  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  23.71 
 
 		 488 aa  83.2  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  20.78 
 
 		 499 aa  83.2  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  22.22 
 
 		 482 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1286  putative squalene/phytoene dehydrogenase  30.39 
 
 		 448 aa  83.2  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0011  hypothetical protein  27.75 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  21.68 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5505  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.76 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342763  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2683  amine oxidase  27.69 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446485  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  22.57 
 
 		 479 aa  81.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  21.66 
 
 		 624 aa  80.9  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  21.8 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  21.59 
 
 		 486 aa  80.1  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  23.42 
 
 		 472 aa  80.1  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  22.65 
 
 		 472 aa  79.7  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  21.68 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4262  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.7 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  22.81 
 
 		 477 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  23.09 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  21.47 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4138  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.5 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  28.23 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4952  amine oxidase  29.46 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15769  normal  0.0932773 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  22.03 
 
 		 481 aa  76.6  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  23.44 
 
 		 552 aa  76.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7028  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.44 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000526905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3155  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.7 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2270  amine oxidase  26.52 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.160101 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0063  amine oxidase  28.73 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  22.27 
 
 		 478 aa  73.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  20.46 
 
 		 472 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  22.2 
 
 		 460 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1725  amine oxidase  27.25 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299467  normal  0.079846 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>