243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5033 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  100 
 
 		 452 aa  911    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  100 
 
 		 452 aa  911    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  100 
 
 		 452 aa  911    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  55.01 
 
 		 447 aa  434  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  43.02 
 
 		 432 aa  291  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  34.42 
 
 		 562 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  30.87 
 
 		 438 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.65 
 
 		 477 aa  132  9e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  32.39 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  31.71 
 
 		 569 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  24.89 
 
 		 460 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  24.08 
 
 		 461 aa  117  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  26.78 
 
 		 481 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  25.39 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  24.6 
 
 		 462 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  28.7 
 
 		 448 aa  114  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6666  squalene-associated FAD-dependent desaturase  30.18 
 
 		 440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  24.42 
 
 		 453 aa  109  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  24.69 
 
 		 453 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  26.38 
 
 		 589 aa  109  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  22.61 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.95 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1513  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.32 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.00817062 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  31.13 
 
 		 486 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  24.19 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  23.42 
 
 		 453 aa  104  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  26.45 
 
 		 552 aa  103  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  23.36 
 
 		 453 aa  103  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  23.64 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  24.26 
 
 		 475 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.76 
 
 		 424 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  23.42 
 
 		 479 aa  100  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  23.4 
 
 		 472 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  23.45 
 
 		 459 aa  100  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  23.4 
 
 		 475 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  22.34 
 
 		 472 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  22.1 
 
 		 599 aa  98.6  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1725  amine oxidase  29.53 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299467  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.86 
 
 		 437 aa  99  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  24.2 
 
 		 462 aa  98.2  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  23.79 
 
 		 455 aa  97.8  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  23.77 
 
 		 483 aa  96.3  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2968  putative phytoene dehydrogenase  27.6 
 
 		 416 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  22.25 
 
 		 471 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  23.05 
 
 		 486 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1470  amine oxidase  27.8 
 
 		 440 aa  95.5  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  23.63 
 
 		 479 aa  94.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  24.07 
 
 		 482 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  21.67 
 
 		 479 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  23.75 
 
 		 472 aa  92.4  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  22.72 
 
 		 488 aa  92.4  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.39 
 
 		 441 aa  92.8  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.52 
 
 		 472 aa  92.4  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  21.85 
 
 		 459 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  22.54 
 
 		 479 aa  91.3  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  22.43 
 
 		 486 aa  91.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  24.24 
 
 		 460 aa  91.7  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  22.56 
 
 		 464 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  25.62 
 
 		 477 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  21.78 
 
 		 489 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  22.56 
 
 		 462 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3155  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.34 
 
 		 415 aa  88.2  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  21.43 
 
 		 499 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  21.17 
 
 		 484 aa  87  6e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  22.82 
 
 		 490 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  22.31 
 
 		 488 aa  87  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  22.82 
 
 		 490 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3574  amine oxidase  26.33 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  21.16 
 
 		 484 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  22.15 
 
 		 478 aa  83.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  21.79 
 
 		 474 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  21.38 
 
 		 624 aa  82.4  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7145  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.61 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  22.41 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  21.46 
 
 		 465 aa  81.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  22.63 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  21.91 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5425  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.16 
 
 		 433 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0063  amine oxidase  26.45 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2683  amine oxidase  27.13 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446485  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  28.29 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  22.42 
 
 		 591 aa  77  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4952  amine oxidase  25.64 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15769  normal  0.0932773 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  28.27 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5505  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.54 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342763  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1719  amine oxidase  25.32 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0628779 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  26.1 
 
 		 506 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  25.98 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1698  putative squalene/phytoene dehydrogenase  26.65 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2270  amine oxidase  26.53 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.160101 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  26.21 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  26.05 
 
 		 506 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  26.05 
 
 		 506 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4262  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.17 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  22.32 
 
 		 481 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  29.04 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  22.85 
 
 		 490 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5461  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.98 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1834  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.33 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3242  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.77 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.179321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>