243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0368 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  100 
 
 
503 aa  1040    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  74.35 
 
 
500 aa  783    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  73.85 
 
 
520 aa  756    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  43.71 
 
 
506 aa  401  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33779  predicted protein  39.88 
 
 
578 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1346  zeta-carotene desaturase-like  38.92 
 
 
543 aa  306  6e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11831  zeta-carotene desaturase-like protein  39.27 
 
 
543 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.253964 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1093  zeta-carotene desaturase-like  38.8 
 
 
544 aa  302  9e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.802606  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10438  PDS-like 1, phytoene desaturase-like protein, phytoene dehydrogenase-like protein  35.52 
 
 
545 aa  277  3e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54051  pds-like2, phytoene desaturase-like protein  32.58 
 
 
605 aa  236  1.0000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.250882  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43187  predicted protein  32.64 
 
 
557 aa  206  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.140423  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  25.21 
 
 
599 aa  137  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  25 
 
 
490 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  25 
 
 
490 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  26.83 
 
 
463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  25.51 
 
 
486 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  25.42 
 
 
477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  25.31 
 
 
486 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  23.28 
 
 
484 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  24.9 
 
 
478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  23.63 
 
 
484 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  24.9 
 
 
483 aa  128  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  22.87 
 
 
484 aa  126  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  23.87 
 
 
624 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  23.49 
 
 
489 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  24.27 
 
 
482 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  25.42 
 
 
552 aa  124  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  22.89 
 
 
499 aa  123  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  24.59 
 
 
479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  25.78 
 
 
488 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  23.65 
 
 
479 aa  122  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  25 
 
 
488 aa  121  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.95 
 
 
479 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  24.46 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  26.19 
 
 
472 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  26.61 
 
 
589 aa  117  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  25.11 
 
 
475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  25.11 
 
 
475 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  24.78 
 
 
453 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.09 
 
 
474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  23.66 
 
 
453 aa  114  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  25.05 
 
 
464 aa  113  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  25.05 
 
 
462 aa  113  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  24.14 
 
 
453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  23.19 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  26.45 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  24.09 
 
 
461 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  24.94 
 
 
460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  25.53 
 
 
472 aa  111  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  24.67 
 
 
479 aa  111  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.4 
 
 
459 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  24.74 
 
 
473 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  23.71 
 
 
453 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  25.32 
 
 
472 aa  110  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  24.95 
 
 
465 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  23.7 
 
 
481 aa  109  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  23.01 
 
 
453 aa  106  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  23.19 
 
 
466 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  23.88 
 
 
591 aa  104  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  23.18 
 
 
453 aa  103  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  22.98 
 
 
466 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  25.39 
 
 
506 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  25.39 
 
 
506 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  25.2 
 
 
506 aa  100  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  26.07 
 
 
462 aa  98.6  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  24.82 
 
 
459 aa  98.2  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  24.33 
 
 
490 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  25.57 
 
 
462 aa  93.2  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  24.73 
 
 
811 aa  89.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  24.05 
 
 
461 aa  89  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  25.57 
 
 
523 aa  88.2  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  23.36 
 
 
460 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  23.3 
 
 
438 aa  85.9  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1844  amine oxidase  24.12 
 
 
511 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  25.1 
 
 
647 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3090  putative beta-carotene desaturase/methylase  25.88 
 
 
520 aa  79  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  26.17 
 
 
647 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  26.17 
 
 
647 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4947  amine oxidase  24.42 
 
 
551 aa  77.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00497379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3570  amine oxidase  24.42 
 
 
546 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145794  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  24.74 
 
 
508 aa  75.1  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.19 
 
 
639 aa  74.3  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  26.13 
 
 
645 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26460  hypothetical protein  26 
 
 
482 aa  73.9  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.214193  normal  0.663003 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.36 
 
 
643 aa  73.6  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  27.43 
 
 
639 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.82 
 
 
640 aa  70.9  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  25.51 
 
 
648 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  25.98 
 
 
451 aa  67  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2500  amine oxidase  24.26 
 
 
519 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0282  amine oxidase  23.05 
 
 
508 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112092  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  22.22 
 
 
432 aa  62  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1580  amine oxidase  23.78 
 
 
481 aa  62  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128087  normal  0.0872032 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.64 
 
 
642 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  25 
 
 
452 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  25 
 
 
452 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  25 
 
 
452 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  25.88 
 
 
448 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  24.53 
 
 
448 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  34.57 
 
 
353 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>