143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26460 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26460  hypothetical protein  100 
 
 		 482 aa  955    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.214193  normal  0.663003 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  65.14 
 
 		 506 aa  568  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  65.14 
 
 		 506 aa  568  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  64.93 
 
 		 506 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1844  amine oxidase  62.37 
 
 		 511 aa  537  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1580  amine oxidase  62.58 
 
 		 481 aa  523  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128087  normal  0.0872032 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3090  putative beta-carotene desaturase/methylase  58.3 
 
 		 520 aa  490  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  56.38 
 
 		 523 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4947  amine oxidase  55.72 
 
 		 551 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00497379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3570  amine oxidase  53.8 
 
 		 546 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2500  amine oxidase  52.06 
 
 		 519 aa  425  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  48.33 
 
 		 811 aa  403  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  42.52 
 
 		 508 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0282  amine oxidase  42.06 
 
 		 508 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112092  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.44 
 
 		 643 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.62 
 
 		 639 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  39.44 
 
 		 639 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  34.31 
 
 		 647 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  34.31 
 
 		 647 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  31.89 
 
 		 648 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 		 644 aa  130  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  34.58 
 
 		 645 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.74 
 
 		 640 aa  128  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  32.41 
 
 		 647 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.49 
 
 		 642 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  25.96 
 
 		 500 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  26.99 
 
 		 503 aa  87  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  23.86 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  25.41 
 
 		 520 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  25.39 
 
 		 490 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  23.52 
 
 		 453 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  25.39 
 
 		 490 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  23.57 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  24.52 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  24.6 
 
 		 482 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  24.04 
 
 		 453 aa  80.1  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  23.26 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  24.02 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  24.42 
 
 		 453 aa  76.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  24.8 
 
 		 488 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  22.86 
 
 		 489 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  22.68 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  25.36 
 
 		 488 aa  70.5  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  23.53 
 
 		 591 aa  68.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  24.38 
 
 		 624 aa  67.8  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  26.73 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  24.83 
 
 		 599 aa  67.4  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1093  zeta-carotene desaturase-like  29.53 
 
 		 544 aa  67  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.802606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  26.73 
 
 		 484 aa  67  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  23.16 
 
 		 486 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  22.61 
 
 		 479 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  27.06 
 
 		 499 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  23.22 
 
 		 486 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  25.61 
 
 		 463 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  26.71 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  22.17 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  24.37 
 
 		 461 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  24.55 
 
 		 471 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  21.28 
 
 		 459 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  25.95 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.29 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  26.53 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  26.73 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1346  zeta-carotene desaturase-like  27.07 
 
 		 543 aa  60.1  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  24.02 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  23.71 
 
 		 465 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  24.01 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  25.38 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  23.71 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  28.06 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  25.26 
 
 		 589 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  23.48 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  25.54 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  24.85 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  46.05 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  24.85 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  25.09 
 
 		 552 aa  57.4  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.63 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  23.59 
 
 		 475 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  26.3 
 
 		 438 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  21.56 
 
 		 472 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  26.03 
 
 		 452 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  26.03 
 
 		 452 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  26.03 
 
 		 452 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  23.49 
 
 		 472 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  24.11 
 
 		 506 aa  53.5  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  24.75 
 
 		 473 aa  53.5  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33779  predicted protein  25.07 
 
 		 578 aa  53.5  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11831  zeta-carotene desaturase-like protein  27.5 
 
 		 543 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.253964 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.62 
 
 		 472 aa  52.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  20.78 
 
 		 462 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.19 
 
 		 474 aa  52  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  24.07 
 
 		 462 aa  51.2  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  26.35 
 
 		 592 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2662  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  48.84 
 
 		 658 aa  50.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2127  heterodisulfide reductase, putative  44.83 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  23.88 
 
 		 472 aa  50.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  47.54 
 
 		 437 aa  50.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  23.67 
 
 		 461 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1839  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.51 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.618665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>